mRNA-sekvensering (NGS) med referansegenom

RNA-seq er et standardverktøy innen livs- og plantevitenskap, og bygger bro mellom genomer og proteomer. Styrken ligger i å oppdage nye transkripter og kvantifisere uttrykket deres i én analyse. Den er mye brukt til sammenlignende transkriptomiske studier, og kaster lys over gener relatert til ulike egenskaper eller fenotyper, som å sammenligne mutanter med villtyper eller avsløre genuttrykk under spesifikke forhold. BMKCloud mRNA(Reference) APP integrerer uttrykkskvantifisering, differensiell uttrykkanalyse (DEG) og sekvensstrukturanalyser i mRNA-seq(NGS) bioinformatikk-pipelinen og samler styrkene til lignende programvare, noe som sikrer bekvemmelighet og brukervennlighet. Brukere kan laste opp RNA-seq-dataene sine til skyen, hvor appen tilbyr en omfattende, komplett bioinformatisk analyseløsning. I tillegg prioriterer den kundeopplevelsen og tilbyr personlige operasjoner skreddersydd til brukernes spesifikke behov. Brukere kan angi parametere og sende inn pipeline-oppdraget selv, sjekke den interaktive rapporten, se data/diagrammer og fullføre datautvinning, for eksempel: valg av målgen, funksjonell klynging, diagrammer osv.