条形banner-03

Produkter

Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)

图片84

Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS) har dukket opp som et kostnadseffektivt og effektivt alternativ til Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) i DNA-metyleringsforskning. Mens WGBS gir omfattende innsikt ved å undersøke hele genomet med enkeltbaseoppløsning, kan den høye kostnaden være en begrensende faktor. RRBS demper denne utfordringen strategisk ved selektivt å analysere en representativ del av genomet. Denne metodikken er avhengig av berikelse av CpG-øyrike regioner ved MspI-spalting etterfulgt av størrelsesvalg av 200-500/600 bps fragmenter. Følgelig blir bare regioner proksimalt til CpG-øyene sekvensert, mens de med fjerne CpG-øyer er ekskludert fra analysen. Denne prosessen, kombinert med bisulfitt-sekvensering, tillater høyoppløselig deteksjon av DNA-metylering, og sekvenseringstilnærmingen, PE150, fokuserer spesifikt på endene av innsatsene i stedet for midten, noe som øker effektiviteten til metyleringsprofilering. RRBS er et uvurderlig verktøy som muliggjør kostnadseffektiv DNA-metyleringsforskning og fremmer kunnskap om epigenetiske mekanismer.


Tjenestedetaljer

Bioinformatikk

Demo resultat

Utvalgte publikasjoner

Tjenestefunksjoner

● Krever et referansegenom.

● Lambda-DNA brukes til å overvåke bisulfittkonverteringseffektiviteten.

● MspI-fordøyelseseffektiviteten overvåkes også.

● Dobbel enzymfordøyelse for planteprøver.

● Sekvensering på Illumina NovaSeq.

Tjenestefordeler

Kostnadseffektivt og effektivt alternativ til WGBS: gjør at analysen kan utføres til en lavere kostnad og med lavere prøvekrav.

Komplett plattform:gi en utmerket service fra prøvebehandling, bibliotekkonstruksjon og sekvensering til bioinformatikkanalyse.

Omfattende kompetanse: med RRBS-sekvenseringsprosjekter fullført på tvers av et mangfold av arter, bringer BMKGENE over et tiår med erfaring, et svært dyktig analyseteam, omfattende innhold og utmerket støtte etter salg.

Tjenestespesifikasjoner

Bibliotek

Sekvenseringsstrategi

Anbefalt datautgang

Kvalitetskontroll

MspI-fordøyd og Bisulfitt-behandlet bibliotek

Illumina PE150

8 Gb

Q30 ≥ 85 %

Bisulfittkonvertering > 99 %

MspI kutteeffektivitet > 95 %

Eksempelkrav

 

Konsentrasjon (ng/µL)

Total mengde (µg)

 

Genomisk DNA

≥ 30

≥ 1

Begrenset nedbrytning eller forurensning

Servicearbeidsflyt

prøvelevering

Prøvelevering

Bibliotekforberedelse

Bygging av bibliotek

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Ettersalgstjenester

Ettersalgstjenester


  • Tidligere:
  • Neste:

  • 图片85

    Inkluderer følgende analyse:

    ● Rå sekvensering kvalitetskontroll;

    ● Kartlegging til referansegenom;

    ● Påvisning av 5mC metylerte baser og motividentifikasjon;

    ● Analyse av metyleringsfordeling og prøvesammenligning;

    ● Analyse av differensielt metylerte regioner (DMRs);

    ● Funksjonell annotering av gener knyttet til DMR.

    Kvalitetskontroll: fordøyelseseffektivitet (i genomkartlegging)

     

    图片86

     

    Kvalitetskontroll: bisulfittkonvertering (i metyleringsinfoekstraksjon)

     

    图片87

     

    Metyleringskart: 5mC metyleringsgenomomfattende distribusjon

    图片88

     

    Eksempelsammenligning: Hovedkomponentanalyse

     

    图片89

     

    Differensielt metylerte regioner (DMRs) analyse: varmekart

     

    图片90

     

     

    Utforsk forskningsfremskritt tilrettelagt av BMKGenes hele genom-bisulfitt-sekvenseringstjenester gjennom en kuratert samling av publikasjoner.

    Li, Z. et al. (2022) 'High-fidelity omprogrammering til Leydig-lignende celler ved CRISPR-aktivering og parakrine faktorer',PNAS Nexus1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.

    Tian, ​​H. et al. (2023) 'Genomomfattende DNA-metyleringsanalyse av kroppssammensetning hos kinesiske eneggede tvillinger',European Journal of Clinical Investigation53(11), s. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.

    Wu, Y. et al. (2022) 'DNA-metylering og midje-til-hofte-forhold: en epigenomomfattende assosiasjonsstudie i kinesiske monozygotiske tvillinger',Journal of Endocrinological Investigation, 45(12), s. 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.

    få et tilbud

    Skriv din melding her og send den til oss

    Send din melding til oss: