条形banner-03

Produkter

Metatranskriptomsekvensering

Ved å utnytte Illumina-sekvenseringsteknologien avslører BMKGENEs metatranskriptomsekvenseringstjeneste det dynamiske genuttrykket til et mangfoldig utvalg av mikrober, som spenner fra eukaryoter til prokaryoter og virus, i naturlige miljøer som jord, vann, hav, avføring og tarm. Vår omfattende tjeneste gir forskere mulighet til å fordype seg i komplekse mikrobielle samfunns komplette genekspresjonsprofiler. Utover taksonomisk analyse, letter vår metatranskriptomsekvenseringstjeneste utforskning av funksjonell berikelse, og kaster lys over differensielt uttrykte gener og deres roller. Avdekk et vell av biologisk innsikt mens du navigerer i det komplekse landskapet av genuttrykk, taksonomisk mangfold og funksjonell dynamikk innenfor disse mangfoldige miljønisjene.


Tjenestedetaljer

Bioinformatikk

Demo resultater

Utvalgte publikasjoner

Tjenestefunksjoner

● rRNA-utarming etterfulgt av retningsbestemt mRNA-bibliotekpreparering.

● Sekvensering på Illumina NovaSeq.

Tjenestefordeler

Studer endringene i komplekse mikrobielle samfunn:Dette skjer på transkripsjonsnivå og utforske potensielle nye gener.

Forklare mikrobielle fellesskapsinteraksjoner med verten eller miljøet.

Omfattende bioinformatisk analyse: Dette gir innsikt i fellesskaps taksonomiske og funksjonelle sammensetninger, samt differensiell genekspresjonsanalyse.

Omfattende genanmerkning:Bruk av oppdaterte genfunksjonsdatabaser for informativ genuttrykksinformasjon fra mikrobielle samfunn.

Støtte etter salg:Vårt engasjement strekker seg utover prosjektgjennomføring med en 3-måneders ettersalgsserviceperiode. I løpet av denne tiden tilbyr vi prosjektoppfølging, feilsøkingshjelp og spørsmål og svar-økter for å løse eventuelle spørsmål knyttet til resultatene.

Tjenestespesifikasjoner

Sekvenseringsplattform

Sekvenseringsstrategi

Data anbefales

Datakvalitetskontroll

Illumina NovaSeq

PE150

12 Gb

Q30≥85 %

Eksempelkrav

Konsentrasjon (ng/µL)

Total mengde (µg)

Volum (µL)

OD260/280

OD260/230

RIN

≥50

≥1,0

≥20

1,8-2,0

1,0-2,5

≥6,5

 

 

 

Servicearbeidsflyt

prøvelevering

Prøvelevering

Bibliotekforberedelse

Bygging av bibliotek

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Ettersalgstjenester

Ettersalgstjenester


  • Tidligere:
  • Neste:

  • 流程图7-01

    Inkluderer følgende analyse:

    ● Sekvensering av datakvalitetskontroll

    ● Transkripsjonssamling

    ● Taksonomiske merknader og overflod

    ● Funksjonell merknad og overflod

    ● Uttrykkskvantifisering og differensialanalyse

    Taksonomisk fordeling av hver prøve:

     

     图片73

     

    Beta-mangfoldsanalyse: UPGMA

     

    图片74 

     

      

    Funksjonell merknad – GO overflod

     

    图片75 

     

    Differensiell taksonomioverflod – LEFSE

     

     图片76

     

    Utforsk fremskritt tilrettelagt av BMKGene sine meta-transkriptomiske sekvenseringstjenester gjennom en kuratert samling av publikasjoner.

    Lu, Z. et al. (2023) 'Syretoleranse for laktat-utnyttende bakterier av ordenen Bacteroidales bidrar til forebygging av ruminal acidose hos geiter tilpasset et høykonsentrert diett',Dyrenæring, 14, s. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

    Song, Z. et al. (2017) 'Utrede kjernefunksjonell mikrobiota i tradisjonell faststoffgjæring ved høykapasitets amplikoner og metatranskriptomisk sekvensering',Grenser i mikrobiologi, 8 (JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.

    Wang, W. et al. (2022) "Nye mykovirus oppdaget fra en metatranskriptomisk undersøkelse av den fytopatogene Alternaria-soppen",Virus, 14(11), s. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

    Wei, J. et al. (2022) 'Parallell metatranskriptomanalyse avslører nedbrytning av plantesekundære metabolitter av biller og deres tarmsymbisjoner',Molekylær Økologi, 31(15), s. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.

    få et tilbud

    Skriv din melding her og send den til oss

    Send din melding til oss: