条形 Banner-03

Produkter

Hele transkriptomsekvensering - Illumina

Hele transkriptomsekvensering gir en omfattende tilnærming til profilering av forskjellige RNA-molekyler, som omfatter koding (mRNA) og ikke-kodende RNA (lncRNA, circRNA og miRNA). Denne teknikken fanger opp hele transkriptomet av spesifikke celler i et gitt øyeblikk, noe som gir en helhetlig forståelse av cellulære prosesser. Også kjent som "Total RNA-sekvensering", tar den sikte på å avduke intrikate regulatoriske nettverk på transkriptomnivå, noe som muliggjør en grundig analyse som konkurrerende endogent RNA (CERNA) og felles RNA-analyse. Dette markerer det første trinnet mot funksjonell karakterisering, spesielt ved å avdekke regulatoriske nettverk som involverer circrna-miRNA-mRNA-baserte CERNA-interaksjoner.


Tjenestedetaljer

Bioinformatikk

Demo -resultater

Utvalgte publikasjoner

Funksjoner

● Dual bibliotek for å sekvensere det komplette transkriptomet: rRNA -uttømming etterfulgt av PE150 bibliotekforberedelse og valg av størrelse etterfulgt av SE50 bibliotekforberedelse

● Komplett bioinformatikkanalyse av mRNA, lncRNA, circRNA og miRNA i separate bioinformatikkrapporter

● Fellesanalyse av alt RNA -ekspresjon i en kombinert rapport, inkludert CERNA Networks -analyse.

Tjenestefordeler

Dyptgående analyse av regulatoriske nettverk: CERNA -nettverksanalyse er aktivert ved leddsekvensering av mRNA, lncRNA, circRNA og miRNA og ved en uttømmende bioinformatisk arbeidsflyt.

Omfattende merknad: Vi bruker flere databaser for å funksjonelt kommentere de differensialt uttrykte genene (DEG) og utføre den tilsvarende berikelsesanalysen, og gir innsikt i de cellulære og molekylære prosessene som ligger til grunn for transkriptomresponsen.

Omfattende kompetanse: Med en merittliste for å lykkes med å lukke over 2100 hele transkriptomprosjekter innen forskjellige forskningsdomener, bringer teamet vårt et vell av erfaring til hvert prosjekt.

Streng kvalitetskontroll: Vi implementerer kjernekontrollpunkter over alle trinn, fra prøve- og bibliotekforberedelse til sekvensering og bioinformatikk. Denne omhyggelige overvåkningen sikrer levering av konsekvent høykvalitetsresultater.

Støtte etter salg: Vår forpliktelse strekker seg utover prosjektets fullføring med en 3-måneders serviceperiode etter salg. I løpet av denne tiden tilbyr vi prosjektoppfølging, feilsøkingshjelp og spørsmål og svar-økter for å adressere eventuelle spørsmål relatert til resultatene

Eksempelkrav og levering

Bibliotek

Sekvenseringsstrategi

Data anbefalt

Kvalitetskontroll

rRNA utarmet

Illumina PE150

16 GB

Q30≥85%

Størrelse valgt

Illumina SE50

10-20m leser

Eksempelkrav:

Nukleotider:

Conc. (Ng/μl)

Beløp (μg)

Renhet

Integritet

≥ 80

≥ 1,6

OD260/280 = 1,7-2,5

OD260/230 = 0,5-2,5

Begrenset eller ingen protein- eller DNA -forurensning vist på gel.

Rin≥6,0

5,0 ≥28s/18S≥1,0;

begrenset eller ingen baselinehøyde

Anbefalt prøvelevering

Beholder: 2 ml sentrifugerør (tinnfolie anbefales ikke)

Eksempelmerking: Gruppe+replikat Eg A1, A2, A3; B1, B2, B3.

Forsendelse:

1. Dry-is: Prøver må pakkes i poser og begraves i tørris.

2. Rnastable rør: RNA -prøver kan tørkes i RNA -stabiliseringsrør (f.eks. Rnastable®) og sendes ved romtemperatur.

Servicearbeidsflyt

Eksempel QC

Eksperimentdesign

Eksempellevering

Eksempellevering

Piloteksperiment

RNA -ekstraksjon

Bibliotekforberedelse

Bibliotekskonstruksjon

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Etter salgstjenester

Etter salgstjenester


  • Tidligere:
  • NESTE:

  • Bioinformatikk

    WPS_DOC_16

    RNA -ekspresjonsoversikt

     

     图片 41

    Differensialt uttrykte gener

     

    图片 42

     

     

    CERNA -analyse

    图片 43          Differensialt uttrykte miRNA og relaterte RNA

    图片 44 

     Utforsk forskningsutviklingene tilrettelagt av Bmkgene 'hele transkriptomsekvenseringstjenester gjennom en kuratert samling av publikasjoner.

     

    Dai, Y. et al. (2022) 'Omfattende uttrykksprofiler av mRNA, lncRNA og miRNA i Kashin-Beck sykdom identifisert ved RNA-sekvensering', Molecular Omics, 18 (2), s. 154–166. doi: 10.1039/d1mo00370d.

    Liu, N. Nan et al. (2022) 'Transkriptomanalyse av full lengde av kaldresistens av APIer Cerana i Changbai-fjellet i overvintrende periode.', Gen, 830, s. 146503–146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.

    Wang, XJ et al. (2022) 'Multi-Omics integrasjonsbasert prioritering av konkurrerende endogene RNA-reguleringsnettverk i småcellet lungekreft: molekylære egenskaper og medikamentkandidater', Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.

    Xu, P. et al. (2022) 'Integrert analyse av lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA-ekspresjonsprofilene avslører ny innsikt i potensielle mekanismer som respons på rotknute nematoder i peanøtt', BMC Genomics, 23 (1), s. 1–12. doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/figurer/7.

    Yan, Z. et al. (2022) 'Hele-transkriptom RNA-sekvensering fremhever molekylære mekanismer assosiert med opprettholdelse av postharvestkvalitet i brokkoli ved rød LED-bestråling', Postharvest Biology and Technology, 188, s. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.

    Få et tilbud

    Skriv meldingen din her og send den til oss

    Send meldingen din til oss: