BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Hel transkriptomsekvensering – Illumina

Hele transkriptomsekvensering tilbyr en omfattende tilnærming til profilering av forskjellige RNA-molekyler, som omfatter både kodende (mRNA) og ikke-kodende RNA (lncRNA, circRNA og miRNA).Denne teknikken fanger opp hele transkriptomet til spesifikke celler på et gitt tidspunkt, noe som gir en helhetlig forståelse av cellulære prosesser.Også kjent som "total RNA-sekvensering", tar den sikte på å avdekke intrikate regulatoriske nettverk på transkriptomnivå, noe som muliggjør dybdeanalyse som konkurrerende endogent RNA (ceRNA) og felles RNA-analyse.Dette markerer det første skrittet mot funksjonell karakterisering, spesielt i å avdekke de regulatoriske nettverkene som involverer circRNA-miRNA-mRNA-baserte ceRNA-interaksjoner.


Tjenestedetaljer

Bioinformatikk

Demo resultater

Utvalgte publikasjoner

Egenskaper

● Dobbelt bibliotek for å sekvensere det komplette transkriptomet: rRNA-uttømming etterfulgt av PE150 bibliotek forberedelse og størrelse valg etterfulgt av SE50 bibliotek forberedelse

● Fullstendig bioinformatikkanalyse av mRNA, lncRNA, circRNA og miRNA i separate bioinformatikkrapporter

● Felles analyse av all RNA-ekspresjon i kombinert rapport, inkludert analyse av ceRNA-nettverk.

Tjenestefordeler

Dybdeanalyse av regulatoriske nettverk: ceRNA-nettverksanalyse er aktivert ved felles sekvensering av mRNA, lncRNA, circRNA og miRNA og av en uttømmende bioinformatisk arbeidsflyt.

Omfattende merknad: vi bruker flere databaser for funksjonelt å kommentere de differensielt uttrykte genene (DEGs) og utføre den tilsvarende berikelsesanalysen, og gir innsikt i de cellulære og molekylære prosessene som ligger til grunn for transkriptomresponsen.

Omfattende kompetanse: Med en merittliste med vellykket lukking av over 2000 hele transkriptomprosjekter i ulike forskningsdomener, bringer teamet vårt et vell av erfaring til hvert prosjekt.

Streng kvalitetskontroll: Vi implementerer kjernekontrollpunkter på tvers av alle stadier, fra prøve- og bibliotekforberedelse til sekvensering og bioinformatikk.Denne grundige overvåkingen sikrer levering av konsekvent høykvalitetsresultater.

● Omfattende merknad: vi bruker flere databaser for funksjonelt å kommentere de differensielt uttrykte genene (DEGs) og utføre den tilsvarende berikelsesanalysen, og gir innsikt i de cellulære og molekylære prosessene som ligger til grunn for transkriptomresponsen.

Support etter salg: Vårt engasjement strekker seg utover prosjektgjennomføring med en 3-måneders ettersalgsserviceperiode.I løpet av denne tiden tilbyr vi prosjektoppfølging, feilsøkingshjelp og spørsmål og svar-økter for å løse eventuelle spørsmål knyttet til resultatene

Prøvekrav og levering

Bibliotek

Sekvenseringsstrategi

Data anbefales

Kvalitetskontroll

rRNA utarmet

Illumina PE150

16 Gb

Q30≥85 %

Størrelse valgt

Illumina SE50

10-20M lesninger

 

Eksempelkrav:

Nukleotider:

Kons.(ng/μl)

Mengde (μg)

Renhet

Integritet

≥ 100

≥ 1

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Begrenset eller ingen protein- eller DNA-kontaminering vist på gel.

Planter: RIN≥6,5

Dyr: RIN≥7,0

5,0≥28S/18S≥1,0;

begrenset eller ingen grunnlinjehøyde

Anbefalt prøvelevering

Container:
2 ml sentrifugerør (tinnfolie anbefales ikke)
Prøvemerking: Gruppe+replikat f.eks. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Forsendelse:
1.Tørris: Prøver må pakkes i poser og begraves i tørris.
2.RNAstabile rør: RNA-prøver kan tørkes i RNA-stabiliseringsrør (f.eks. RNAstable®) og sendes i romtemperatur.

Servicearbeidsflyt

Prøve QC

Eksperimentdesign

prøvelevering

Prøvelevering

Piloteksperiment

RNA-ekstraksjon

Bibliotekforberedelse

Bygging av bibliotek

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Ettersalgstjenester

Ettersalgstjenester


  • Tidligere:
  • Neste:

  • Bioinformatikk

    wps_doc_16

    Oversikt over RNA-uttrykk

     图片41

    Differensielt uttrykte gener

    图片42

     

     

    ceRNA-analyse

     图片43Differensielt uttrykte miRNA-er og relaterte RNA-er

    图片44 

     Utforsk forskningsfremskritt som tilrettelegges av BMKGene 'hele transkriptomsekvenseringstjenester gjennom en kuratert samling av publikasjoner.

     

    Dai, Y. et al.(2022) 'Omfattende ekspresjonsprofiler av mRNA, lncRNA og miRNA i Kashin-Beck sykdom identifisert ved RNA-sekvensering', Molecular Omics, 18(2), s. 154–166.doi: 10.1039/D1MO00370D.

    Liu, N. nan et al.(2022) 'Fulllengde transkriptomer analyse av kuldemotstanden til Apis cerana i Changbai-fjellet under overvintringsperioden.', Gene, 830, s. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.

    Wang, XJ et al.(2022) 'Multi-Omics integrasjonsbasert prioritering av konkurrerende endogene RNA-reguleringsnettverk i småcellet lungekreft: Molecular Characteristics and Drug Candidates', Frontiers in Oncology, 12, s.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.

    Xu, P. et al.(2022) 'Integrert analyse av lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA-ekspresjonsprofilene avslører ny innsikt i potensielle mekanismer som respons på rotknute-nematoder i peanøtt', BMC Genomics, 23(1), s. 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURE/7.

    Yan, Z. et al.(2022) "Hele-transkriptom-RNA-sekvensering fremhever de molekylære mekanismene assosiert med opprettholdelse av etterhøstkvalitet i brokkoli ved rød LED-bestråling", Postharvest Biology and Technology, 188, s.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.

    få et tilbud

    Skriv din melding her og send den til oss

    Send din melding til oss: