BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Genomomfattende assosiasjonsanalyse

Genomomfattende assosiasjonsstudie (GWAS) tar sikte på å identifisere genetiske varianter (genotype) som assosieres med spesifikke egenskaper (fenotype).GWAS-studien undersøker genetiske markører på tvers av hele genomet til et stort antall individer og forutsier genotype-fenotype-assosiasjoner ved statistisk analyse på populasjonsnivå.Det har blitt mye brukt i forskning på menneskelige sykdommer og funksjonell genutvinning på komplekse egenskaper hos dyr eller planter.


Tjenestedetaljer

Demo resultat

Utvalgt publikasjon

bilde3

1. Tjenestefordeler

● Rikelig med prosjekttilfeller: siden etableringen i 2009 har BMKGENE fullført hundrevis av artsprosjekter i populasjons-GWAS-forskning, hjulpet forskere med å publisere mer enn 100 artikler, og den kumulative effektfaktoren nådde 500.
● Profesjonelle analytikere.
● Kort analysesyklus.
● Nøyaktig datautvinning.

2. Tjenestespesifikasjoner

Type

Befolkningsskala

Sekvenseringsstrategi og dybde

SLAF-GWAS Prøvenummer ≥200 Genomstørrelse < 400M, med ref-genom, WGS anbefales

Genomstørrelse ≤ 1G, 100K Tags og 10X

1G ≤ Genomstørrelse ≤ 2G, 200K Tags og 10X

Genomstørrelse > 2G, 300K Tags og 10X

WGS-GWAS

Prøvenummer ≥200

10X for hver prøve

3. Materialvalg

动物1
动物2
bilde7

Ulike varianter, underarter, landraser/genbanker/blandingsfamilier/ville ressurser

Ulike varianter, underarter, landraser

Halvsøskenfamilie/helsøskenfamilie/ville ressurser

4. Bioinformasjonsanalyse

● Genomomfattende assosiasjonsanalyse
● Analyse og screening av signifikant SNP
● Funksjonell annotering av kandidatgen

5. Servicearbeidsflyt

Prøve QC

Eksperimentdesign

prøvelevering

Prøvelevering

Piloteksperiment

RNA-ekstraksjon

Bibliotekforberedelse

Bygging av bibliotek

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Ettersalgstjenester

Ettersalgstjenester


  • Tidligere:
  • Neste:

  • en.Fenotype QC

    Frekvensfordelingshistogram

    bilde9

    Fenotypestatistikk

    bilde10

    b.Assosiasjonsanalyse (modell: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

    QQ Plot

    bilde11

    Manhattan Plot

    Ammoniakk_emmax_manhattan_00

    År

    Tidsskrift

    IF

    Tittel

    2022

    NC

    17,69

    Genomisk grunnlag for giga-kromosomene og giga-genomet til trepionen Paeonia ostii

    2015

    NP

    7,43

    Domestiseringsfotavtrykk forankrer genomiske regioner av agronomisk betydning i soyabønner

    2018

    MP

    9.32

    Helgenom-resekvensering av en verdensomspennende samling av rapsfrø avslører genetisk grunnlag for deres økotype-divergens

    2022

    HR

    7,29

    Genomomfattende assosiasjonsanalyse gir molekylær innsikt i den naturlige variasjonen av vannmelonfrøstørrelse

    få et tilbud

    Skriv din melding her og send den til oss

    Send din melding til oss: