BMKCLOUD Logg inn

Produkter

DNA/RNA -sekvensering - Nanopore Sequencer

ONT-sekvensering er et enkelt molekyl sanntids elektrisk signalsekvenseringsteknologi basert på nanoporer, sekvenseringsprinsippet for hver plattform er den samme. Dobbeltstrenget DNA/RNA vil binde seg til nanoporøst protein innebygd i biofilmen og avvikle under ledet av motorisk protein, under virkning av spenningsforskjell fra begge sider av biofilmen, DNA/RNA-tråder passerer gjennom nanopore kanalprotein ved en viss viss sats. På grunn av forskjellene i de kjemiske egenskapene til de forskjellige basene på DNA/RNA -strengen, når en enkelt base eller DNA -molekyl passerer gjennom nanopore -kanalen, vil det føre til endring av forskjellige elektriske signaler. Ved å oppdage og tilsvarende disse signalene, kan de tilsvarende basetypene beregnes, og sanntidsdeteksjonen av sekvensen kan fullføres.

Kontakt oss

Tjenestedetaljer

Demo -resultat

Tjenesteinformasjonsfunksjoner

Plattform	Bibliotekstørrelse	Teoretiske datautbytte (per celle)	Enkeltbase-nøyaktighet	Applikasjoner
Nanopore	8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, CDNA-PCR	70-90 GB/celle	85-92%	SV-samtale, de novo, i full lengde, ISO-seq, gennotasjon, deteksjon av DNA-metylering

Tjenestefordeler

● Over 5 års erfaring på PACBIO -sekvenseringsplattformen med tusenvis av lukkede prosjekter med forskjellige arter.
● Bmkgene er en offisiell partner av Oxford Nanopore, med dobbel plattform RNA/DNA -sertifisering.
● Det er mainstream -modeller av sequencers med komplett utstyr og tilstrekkelig sekvenseringsgjennomstrømning.
● Basert på Nanopore -plattformen er mer enn 10 dyre- og plante Denovo -undersøkelser blitt publisert i internasjonalt anerkjente tidsskrifter.

Prøvekrav

Prøvetype

Beløp

Konsentrsjon (Qubit ®)

Volum

Renhet

Andre

Genomisk DNA

Avhengig av datakrav

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1,5 ；

Klar topp på 260 nm ， ingen forurensninger

Konsentrasjonen må måles med quit og qubit/nanopore ≤ 2

Totalt RNA

≥1,2μg

≥100μg/μL

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ； Ingen forurensninger

RIN -verdi ≥7,5

Tjenestearbeidsflyt

Prøveforberedelse

Bibliotekskonstruksjon

Sekvensering

Dataanalyse

Prosjektlevering

Tidligere: Illumina ferdiglagde biblioteker

NESTE: Spesifikk-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

Datakvalitetsvurdering av DNA -prøve

Tabell 1. Statistikk over rene data.

BMKID	Rawseqnum	RawSumbase	Cleansqnum	Rensumbase	Cleann50len	CleanN90Len	Cleanmeanlen	Cleanmaxlen	Cleanmeanqual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121 736	25.90	28.014	15.764	23.090	143,181	9