| Plattform | Bibliotekstørrelse | Teoretisk datautbytte (per celle) | Enkeltbase-nøyaktighet | Bruksområder |
| Nanopore | 8 kb, 10 kb, 20 kb, ultralang, cDNA-PCR | 70–90 GB/celle | 85–92 % | SV-kalling, De novo, fulllengdessekvensering, Iso-Seq, genannotering, påvisning av DNA-metylering |
● Over 5 års erfaring med PacBio-sekvenseringsplattformen med tusenvis av avsluttede prosjekter med ulike arter.
● BMKGENE er en offisiell partner av Oxford Nanopore, med RNA/DNA-sertifisering for begge plattformer.
● Det finnes vanlige modeller av sekvensere med komplett utstyr og tilstrekkelig sekvenseringskapasitet.
● Basert på Nanopore-plattformen har mer enn 10 Denovo-forskninger på dyr og planter blitt publisert i internasjonalt anerkjente tidsskrifter.
| Prøvetype | Beløp | Konsentrasjon (Qubit ®) | Volum | Renhet | Andre |
| Genomisk DNA | Avheng av datakrav | ≥20 ng/μl | ≥15 μl | OD260/280=1,7–2,2; OD260/230≥1,5; Klar topp ved 260 nm, ingen forurensninger | Konsentrasjonen må måles med Qubit og Qubit/Nanopore ≤ 2 |
| Totalt RNA | ≥1,2 μg | ≥100 μg/μl | ≥15 μl | OD260/280=1,7–2,5; OD260/230=0,5–2,5; ingen forurensninger | RIN-verdi ≥7,5 |
Vurdering av datakvalitet av DNA-prøve
Tabell 1. Statistikk over rene data.
| BMKID | råSekvensnummer | råSumBase | renSekvensNum | renSumBase | renN50Len | renN90Len | renMeanLen | cleanMaxLen | renMeanQual |
| DNA_BMK01 | 1 218 239 | 26,37 | 1 121 736 | 25,90 | 28 014 | 15 764 | 23 090 | 143 181 | 9 |
Vurdering av datakvalitet av RNA-prøve
Tabell 1. Statistikk over rene data.
| Filnavn | Klient-ID | LesNum | Basenummer | N50 | Gjennomsnittslengde | Maks. lengde | Gjennomsnittlig Qscore |
| RNA_BMK001 | C2 | 8 947 708 | 4 047 230 083 | 398 | 452 | 129 227 | Q12 |
Figur 1. Fordeling av leselengde
Figur 2. Fordeling av kvalitetspoeng for rene data
Figur 3. Lengde- og kvalitetsscorefordeling av rene data