条形banner-03

Produkter

DNA/RNA-sekvensering – Nanoporesekvenserer

ONT-sekvensering er en teknologi for sanntids elektrisk signalsekvensering av enkeltmolekyler basert på nanoporer, der sekvenseringsprinsippet for hver plattform er det samme. Dobbelttrådet DNA/RNA binder seg til nanoporøst protein som er innebygd i biofilmen og avvikles under påvirkning av motorprotein. Under påvirkning av spenningsforskjeller på begge sider av biofilmen passerer DNA/RNA-trådene gjennom nanoporkanalproteinet med en viss hastighet. På grunn av forskjellene i de kjemiske egenskapene til de forskjellige basene på DNA/RNA-tråden, vil en enkelt base eller et enkelt DNA-molekyl passerer gjennom nanoporkanalen, forårsake endring av forskjellige elektriske signaler. Ved å detektere og korrespondere med disse signalene kan de tilsvarende basetypene beregnes, og sanntidsdeteksjonen av sekvensen kan fullføres.


Tjenestedetaljer

Demoresultat

Tjenestedetaljer Funksjoner

Plattform

Bibliotekstørrelse

Teoretisk datautbytte (per celle)

Enkeltbase-nøyaktighet

Bruksområder

Nanopore

8 kb, 10 kb, 20 kb, ultralang, cDNA-PCR

70–90 GB/celle

85–92 %

SV-kalling, De novo, fulllengdessekvensering, Iso-Seq, genannotering, påvisning av DNA-metylering

Servicefordeler

● Over 5 års erfaring med PacBio-sekvenseringsplattformen med tusenvis av avsluttede prosjekter med ulike arter.
● BMKGENE er en offisiell partner av Oxford Nanopore, med RNA/DNA-sertifisering for begge plattformer.
● Det finnes vanlige modeller av sekvensere med komplett utstyr og tilstrekkelig sekvenseringskapasitet.
● Basert på Nanopore-plattformen har mer enn 10 Denovo-forskninger på dyr og planter blitt publisert i internasjonalt anerkjente tidsskrifter.

Krav til prøveeksempler


Prøvetype

Beløp

Konsentrasjon (Qubit ®)

Volum

Renhet

Andre

Genomisk DNA

Avheng av datakrav

 ≥20 ng/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7–2,2;

OD260/230≥1,5;

Klar topp ved 260 nm, ingen forurensninger

Konsentrasjonen må måles med Qubit og Qubit/Nanopore ≤ 2

Totalt RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7–2,5;

OD260/230=0,5–2,5; ingen forurensninger

RIN-verdi ≥7,5

 

Tjenestens arbeidsflyt

prøveforberedelse

Prøveforberedelse

Biblioteksforberedelse

bibliotekbygging

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Prøvekvalitetskontroll

Prosjektlevering


  • Tidligere:
  • Neste:

  • Vurdering av datakvalitet av DNA-prøve

    Tabell 1. Statistikk over rene data.

    BMKID

    råSekvensnummer

    råSumBase

    renSekvensNum

    renSumBase

    renN50Len

    renN90Len

    renMeanLen

    cleanMaxLen

    renMeanQual

    DNA_BMK01

    1 218 239

    26,37

    1 121 736

    25,90

    28 014

    15 764

    23 090

    143 181

    9

    Vurdering av datakvalitet av RNA-prøve

    Tabell 1. Statistikk over rene data.

    Filnavn

    Klient-ID

    LesNum

    Basenummer

    N50

    Gjennomsnittslengde

    Maks. lengde

    Gjennomsnittlig Qscore

    RNA_BMK001

    C2

    8 947 708

    4 047 230 083

    398

    452

    129 227

    Q12

    Figur 1. Fordeling av leselengde

    A3

    Figur 2. Fordeling av kvalitetspoeng for rene data

    A4

    Figur 3. Lengde- og kvalitetsscorefordeling av rene data

    A5

    få et tilbud

    Skriv meldingen din her og send den til oss

    Send meldingen din til oss: