条形banner-03

Produkter

Illumina forhåndslagde biblioteker

Illumina-sekvenseringsteknologi, basert på Sequencing by Synthesis (SBS), er en globalt anerkjent NGS-innovasjon som er ansvarlig for å generere over 90 % av verdens sekvenseringsdata. Prinsippet bak SBS innebærer å avbilde fluorescensmerkede reversible terminatorer etter hvert som hver dNTP legges til, og deretter spaltes for å tillate inkorporering av den neste basen. Med alle fire reversible terminatorbundne dNTP-er tilstede i hver sekvenseringssyklus, minimerer naturlig konkurranse inkorporeringsskjevhet. Denne allsidige teknologien støtter både enkeltlesings- og parvise biblioteker, og dekker en rekke genomiske applikasjoner. Illumina-sekvenseringens høye gjennomstrømningskapasitet og presisjon posisjonerer den som en hjørnestein i genomforskning, og gir forskere mulighet til å avdekke genomenes komplikasjoner med uovertruffen detaljrikdom og effektivitet.

Vår ferdiglagde biblioteksekvenseringstjeneste lar kunder forberede sekvenseringsbiblioteker fra ulike kilder (mRNA, helgenom, amplikon, 10x-biblioteker, blant annet). Deretter kan disse bibliotekene sendes til våre sekvenseringssentre for kvalitetskontroll og sekvensering i Illumina-plattformer.


Tjenestedetaljer

Demoresultat

Funksjoner

Plattformer:Illumina NovaSeq 6000 og NovaSeq X Plus

Sekvenseringsmoduser:PE150 og PE250

Kvalitetskontroll av biblioteker før sekvensering

Sekvenseringsdata QC og levering:levering av QC-rapport og rådata i fastq-format etter demultipleksing og filtrering av Q30-avlesninger

 

 

Servicefordeler

Allsidigheten til sekvenseringstjenester:Kunden kan velge å sekvensere etter bane, flytcelle eller etter mengde data som kreves (delvis banesekvensering).

Omfattende erfaring med Illumina-sekvenseringsplattformen:med tusenvis av avsluttede prosjekter med ulike arter. 

Levering av QC-rapport for sekvensering:med kvalitetsmålinger, datanøyaktighet og generell ytelse for sekvenseringsprosjektet.

Moden sekvenseringsprosess:med kort behandlingstid.

Streng kvalitetskontrollVi implementerer strenge kvalitetskontrollkrav for å garantere levering av resultater av gjennomgående høy kvalitet.

 

 

Eksempelplattformer

Plattform

Flytcelle

Sekvenseringsmodus

Enhet

Estimert produksjon

NovaSeq X

10B (8 baner)

PE150

Enkeltfelt

Delvis kjørefelt

375 GB / fil

25B (8 kjørefelt)

PE150

Enkeltfelt

Delvis kjørefelt

1000 Gb/fil

NovaSeq 6000

SP Flow-celle (2 baner)

PE250

Flytcelle

Enkeltfelt

Delvis kjørefelt

325–400 millioner avlesninger/felt

S4 Flowcelle (4 baner)

PE150

Flytcelle

Enkeltfelt

Delvis kjørefelt

~800 Gb / fil

Krav til prøveeksempler

 

Datamengde (Gb)

Kons. (qPCR) PE150

Kons. (qPCR) PE250

Volum

Delvis kjørefelt

 

 

G ≤ 10

≥ 1 nM

≥ 2nM

≥ 25 μl

10 < G ≤ 50

≥ 2 nM

≥ 3 nM

≥ 25 μl

50 < G ≤ 100

≥ 3 nM

≥ 4 nM

≥ 25 μl

G > 100

≥ 4 nM

≥ 4 nM

≥ 25 μl

Enkeltfelt

Per kjørefelt

≥ 1,5 nM/bibliotekspool

≥ 2 nM/bibliotekspool

≥ 25 µL/bibliotekpool

I tillegg til konsentrasjon og totalmengde kreves også et passende toppmønster.

Merk: Filsekvensering av biblioteker med lavt mangfold krever PhiX-spike-in for å sikre robust basekall.

Vi anbefaler å sende inn forhåndssamlede biblioteker som prøver for banesekvensering. Hvis du trenger at BMKGENE skal utføre bibliotekspooling, se bibliotekkravene for delvis banesekvensering.

Bibliotekstørrelse (toppkart)

For PE150-sekvensering bør innsettingsstørrelsen være 300–400 bp (eksklusive adaptere); for PE250-sekvensering bør innsettingsstørrelsen være 150–500 bp (eksklusive adaptere).
Biblioteker bør ha én hovedtopp, ingen adapterforurensning og ingen primerdimerer.

Ta kontakt med oss ​​hvis prøvene dine ikke oppfyller kravene til utgangsmateriale.

Tjenestens arbeidsflyt

prøveforberedelse

Kvalitetskontroll på biblioteket

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Datakvalitetskontroll

Prøvekvalitetskontroll

Prosjektlevering


  • Tidligere:
  • Neste:

  • Bibliotekets kvalitetskontrollrapport

    En rapport om bibliotekets kvalitet gis før sekvensering, vurdering av bibliotekmengde og fragmentering.

     

    Sekvenserings-QC-rapport

     

    Tabell 1. Statistikk over sekvenseringsdata.

    Eksempel-ID

    BMKID

    Rå lesninger

    Rådata (bp)

    Rene avlesninger (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22 870 120

    6 861 036 000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14 717 867

    4 415 360 100

    96,00

    98,95

    93,89

    37,08

    Figur 1. Kvalitetsfordeling langs avlesningene i hver prøve

    A9

    Figur 2. Fordeling av basisinnhold

    A10

    Figur 3. Fordeling av lest innhold i sekvenseringsdata

    A11

     

    få et tilbud

    Skriv meldingen din her og send den til oss

    Send meldingen din til oss: