条形banner-03

Produkter

Menneskelig hel eksomsekvensering

Human heleksomsekvensering (hWES) er allment anerkjent som en kostnadseffektiv og kraftig sekvenseringsmetode for å finne sykdomsfremkallende mutasjoner. Til tross for at de bare utgjør omtrent 1,7 % av hele genomet, spiller eksoner en avgjørende rolle ved å direkte reflektere profilen til totale proteinfunksjoner. Det er verdt å merke seg at over 85 % av mutasjoner relatert til sykdommer i det menneskelige genomet manifesterer seg innenfor de proteinkodende regionene. BMKGENE tilbyr en omfattende og fleksibel tjeneste for sekvensering av human heleksom med to forskjellige eksonfangststrategier tilgjengelig for å møte ulike forskningsmål.


Tjenestedetaljer

Demoresultater

Tjenestefunksjoner

● To eksompaneler tilgjengelig basert på målberikelse med prober: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) og xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sekvensering på Illumina NovaSeq.

● Bioinformatisk pipeline rettet mot sykdomsanalyse eller tumoranalyse.

Servicefordeler

Målretter seg mot proteinkodende regionVed å fange og sekvensere proteinkodende regioner, brukes hWES til å avdekke varianter relatert til proteinstruktur.

Kostnadseffektiv:hWES gir omtrent 85 % av de sykdomsassosierte mutasjonene fra 1 % av det menneskelige genomet.

Høy nøyaktighetMed høy sekvenseringsdybde forenkler hWES deteksjonen av både vanlige varianter og sjeldne varianter med frekvenser lavere enn 1 %.

Streng kvalitetskontrollVi implementerer fem kjernekontrollpunkter på tvers av alle stadier, fra prøve- og bibliotekforberedelse til sekvensering og bioinformatikk. Denne grundige overvåkingen sikrer levering av resultater av gjennomgående høy kvalitet.

Omfattende bioinformatisk analyseForskningspipelinen vår går utover å identifisere variasjoner i referansegenomet, ettersom den inkluderer avansert analyse designet for å spesifikt adressere forskningsspørsmål knyttet til genetiske aspekter ved sykdommer eller tumoranalyse.

Støtte etter salg:Vår forpliktelse strekker seg utover prosjektets ferdigstillelse, med en 3-måneders ettersalgsserviceperiode. I løpet av denne tiden tilbyr vi prosjektoppfølging, feilsøkingshjelp og spørsmål og svar-sesjoner for å svare på eventuelle spørsmål knyttet til resultatene.

Eksempelspesifikasjoner

Eksonfangststrategi

Sekvenseringsstrategi

Anbefalt datautgang

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

eller xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5–10 GB

For mendelske lidelser/sjeldne sykdommer: > 50x

For tumorprøver: ≥ 100x

Krav til prøveeksempler

Prøvetype

 

 Beløp(Qubit®)

 

Konsentrasjon 

Volum

 

 

 Renhet (NanoDrop™)

 

Genomisk DNA

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 μL
 
OD260/280=1,8–2,0
 
ingen nedbrytning, ingen forurensning

 

Bioinformatikk

WES_BI arbeidsflyt_Sykdom-01

Bioinformatisk analyse av hWES-sykdomsprøver inkluderer:

● Kvalitetskontroll av sekvenseringsdata

● Referansegenomjustering

● Identifisering av SNP-er og InDel-er

● Funksjonell annotering av SNP-er og InDels

WES_BI arbeidsflyt_Tumor-01

Bioinformatisk analyse av tumorprøver inkluderer:

● Kvalitetskontroll av sekvenseringsdata

● Referansegenomjustering

● Identifisering av SNP-er, InDels og somatiske variasjoner

● Identifisering av kimlinjevarianter

● Analyse av mutasjonssignaturer

● Identifisering av drivgener basert på gain-of-function-mutasjoner

● Mutasjonsannotering på nivået av legemiddelfølsomhet

● Heterogenitetsanalyse – beregning av renhet og ploiditet

Tjenestens arbeidsflyt

prøvelevering

Prøvelevering

Piloteksperiment

DNA-ekstraksjon

Biblioteksforberedelse

bibliotekbygging

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

数据上传-01

Datalevering

Ettersalgstjenester

Ettersalgstjenester


  • Tidligere:
  • Neste:

  • Data QC – Statistikk over eksomfangst

     

    wps_doc_22

     

    Variantidentifikasjon – InDels

    图片36

    Avansert analyse: identifisering og distribusjon av skadelige SNP-er/InDels – Circos-plott

     

    图片37

    Tumoranalyse: identifisering og distribusjon av somatiske mutasjoner – Circos-plott

     

    图片38

     

    Tumoranalyse: klonale avstamninger

     

    图片39

     

    få et tilbud

    Skriv meldingen din her og send den til oss

    Send meldingen din til oss: