条形banner-03

Produkter

Menneskelig hel eksomsekvensering

Human heleksomsekvensering (hWES) er allment anerkjent som en kostnadseffektiv og kraftig sekvenseringsmetode for å finne sykdomsfremkallende mutasjoner. Til tross for at de bare utgjør omtrent 1,7 % av hele genomet, spiller eksoner en avgjørende rolle ved å direkte reflektere profilen til totale proteinfunksjoner. Det er verdt å merke seg at over 85 % av mutasjoner relatert til sykdommer i det menneskelige genomet manifesterer seg innenfor de proteinkodende regionene. BMKGENE tilbyr en omfattende og fleksibel tjeneste for sekvensering av human heleksom med to forskjellige eksonfangststrategier tilgjengelig for å møte ulike forskningsmål.


Tjenestedetaljer

Demoresultater

Tjenestefunksjoner

● To eksompaneler tilgjengelig basert på målberikelse med prober: SureSelect Human All Exon v6 (Agilent) og xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

- Basert på SureSelect Human All Exon V6 Panel, er UTR-regioner og mtDNA i full lengde supplert til målfangstområdet.
– UMI-aktivert bibliotekkonstruksjon er tilgjengelig med SureSelect Human All Exon V6 Panel.

● Sekvensering på Illumina NovaSeq.

● Bioinformatisk pipeline rettet mot sykdomsanalyse eller tumoranalyse.

Servicefordeler

●Målretter seg mot proteinkodende regionVed å fange og sekvensere proteinkodende regioner, brukes hWES til å avdekke varianter relatert til proteinstruktur.

●Kostnadseffektiv:hWES gir omtrent 85 % av de sykdomsassosierte mutasjonene fra 1 % av det menneskelige genomet.

●Høy nøyaktighetMed høy sekvenseringsdybde forenkler hWES deteksjonen av både vanlige varianter og sjeldne varianter med frekvenser lavere enn 1 %.

●Streng kvalitetskontrollVi implementerer fem kjernekontrollpunkter på tvers av alle stadier, fra prøve- og bibliotekforberedelse til sekvensering og bioinformatikk. Denne grundige overvåkingen sikrer levering av resultater av gjennomgående høy kvalitet.

●Omfattende bioinformatisk analyseForskningspipelinen vår går utover å identifisere variasjoner i referansegenomet, ettersom den inkluderer avansert analyse designet for å spesifikt adressere forskningsspørsmål knyttet til genetiske aspekter ved sykdommer eller tumoranalyse.

●Støtte etter salg:Vår forpliktelse strekker seg utover prosjektets ferdigstillelse, med en 3-måneders ettersalgsserviceperiode. I løpet av denne tiden tilbyr vi prosjektoppfølging, feilsøkingshjelp og spørsmål og svar-sesjoner for å svare på eventuelle spørsmål knyttet til resultatene.

Eksempelspesifikasjoner

Eksonfangststrategi

Sekvenseringsstrategi

Anbefalt datautgang

Agilent SureSelectXT Human All Exon V6 + UTR + mtDNA

Agilent SureSelectXT humant all-ekson V6 + UTR + mtDNA (med UMI)

IDT xGen Exome Hyb Panel V2

Illumina NovaSeq PE150

5–10 GB

For mendelske lidelser/sjeldne sykdommer: > 50x

For tumorprøver: ≥ 100x

Krav til prøveeksempler

Prøvetype

 Beløp(Qubit®)

Konsentrasjon 

Volum

Agarosegel

WES-FF

≥ 150 ng ≥ 15 ng/µL

 

≥ 15 µL

 
Ingen eller begrenset forurensning og nedbrytning (hovedbåndet er klart).
FFPE-DNA: Hvis hovedbåndet er uklart, kreves et tydelig utstryk over 2 kb.

WES-FFPE

≥ 200 ng ≥ 15 ng/µL

Bioinformatikk

WES_BI arbeidsflyt_Sykdom-01

Bioinformatisk analyse av hWES-sykdomsprøver inkluderer:

● Kvalitetskontroll av sekvenseringsdata

● Referansegenomjustering

● Identifisering av SNP-er og InDel-er

● Funksjonell annotering av SNP-er og InDels

WES_BI arbeidsflyt_Tumor-01

Bioinformatisk analyse av tumorprøver inkluderer:

● Kvalitetskontroll av sekvenseringsdata

● Referansegenomjustering

● Identifisering av SNP-er, InDels og somatiske variasjoner

● Identifisering av kimlinjevarianter

● Analyse av mutasjonssignaturer

● Identifisering av drivgener basert på gain-of-function-mutasjoner

● Mutasjonsannotering på nivået av legemiddelfølsomhet

● Heterogenitetsanalyse – beregning av renhet og ploiditet

Tjenestens arbeidsflyt

prøvelevering

Prøvelevering

Piloteksperiment

DNA-ekstraksjon

Biblioteksforberedelse

bibliotekbygging

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

数据上传-01

Datalevering

Ettersalgstjenester

Ettersalgstjenester


  • Tidligere:
  • Neste:

  • Data QC – Statistikk over eksomfangst

     

    wps_doc_22

     

    Variantidentifikasjon – InDels

    图片36

    Avansert analyse: identifisering og distribusjon av skadelige SNP-er/InDels – Circos-plott

     

    图片37

    Tumoranalyse: identifisering og distribusjon av somatiske mutasjoner – Circos-plott

     

    图片38

     

    Tumoranalyse: klonale avstamninger

     

    图片39

     

    få et tilbud

    Skriv meldingen din her og send den til oss

    Send meldingen din til oss: