Mag-log in sa BMKCloud

Mga Produkto

Pagsusuri ng DNA/RNA – Nanopore Sequencer

Pagsusuri ng DNA/RNA – Tampok na Larawan ng Nanopore Sequencer

Ang ONT sequencing ay isang teknolohiya ng single molecule real-time electrical signal sequencing na nakabatay sa mga nanopore, at ang prinsipyo ng sequencing ng bawat platform ay pareho. Ang double-stranded DNA/RNA ay magbibigkis sa nanoporous protein na nakabaon sa biofilm at mag-aalis ng bara sa ilalim ng pangunguna ng motor protein. Sa ilalim ng aksyon ng pagkakaiba ng boltahe mula sa magkabilang panig ng biofilm, ang mga hibla ng DNA/RNA ay dumadaan sa nanopore channel protein sa isang tiyak na bilis. Dahil sa mga pagkakaiba ng mga kemikal na katangian ng iba't ibang base sa hibla ng DNA/RNA, kapag ang isang base o molekula ng DNA ay dumaan sa nanopore channel, magdudulot ito ng pagbabago ng iba't ibang electrical signal. Sa pamamagitan ng pag-detect at pagtutugma sa mga signal na ito, maaaring kalkulahin ang mga kaukulang uri ng base, at maaaring makumpleto ang real-time na pag-detect ng sequence.

Makipag-ugnayan sa Amin

Mga Detalye ng Serbisyo

Resulta ng Demo

Mga Tampok ng Detalye ng Serbisyo

Plataporma	Laki ng Aklatan	Teoretikal na Ani ng Datos (Bawat Cell)	Katumpakan ng Isang Base	Mga Aplikasyon
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/Selyula	85-92%	Pagtawag ng SV, De novo, Buong-haba na sequencing, Iso-Seq, Anotasyon ng Gene, Pagtuklas ng DNA methylation

Mga Kalamangan sa Serbisyo

● Mahigit 5 taong karanasan sa platform ng PacBio sequencing na may libu-libong saradong proyekto na may iba't ibang uri ng hayop.
● Ang BMKGENE ay isang opisyal na kasosyo ng Oxford Nanopore, na may dual platform na sertipikasyon ng RNA/DNA.
● May mga pangunahing modelo ng mga sequencer na may kumpletong kagamitan at sapat na throughput ng sequencing.
● Batay sa platapormang Nanopore, mahigit 10 pananaliksik sa hayop at halaman ng Denovo ang nailathala sa mga journal na kilala sa buong mundo.

Mga Kinakailangan sa Halimbawa

Uri ng Sample

Halaga

Konsentrasyon (Qubit ®)

Dami

Kadalisayan

Iba pa

Henomikong DNA

Depende sa Pangangailangan sa Datos

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5；

Malinaw na rurok sa 260 nm, walang kontaminasyon

Kailangang sukatin ang konsentrasyon gamit ang Qubit at Qubit/Nanopore ≤ 2

Kabuuang RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5；walang kontaminasyon

Halaga ng RIN ≥7.5

Daloy ng Trabaho sa Serbisyo

Paghahanda ng sample

Pagtatayo ng aklatan

Pagsunod-sunod

Pagsusuri ng datos

Paghahatid ng proyekto

Nakaraan: Mga paunang-gawa na aklatan ng Illumina

Susunod: Pagsunod-sunod ng Pinalawak na Fragment ng Specific-Locus (SLAF-Seq)

Pagtatasa ng Kalidad ng Datos ng Sample ng DNA

Talahanayan 1. Mga estadistika sa malinis na datos.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	malinis naSeqNum	malinis naSumBase	malinisN50Len	malinisN90Len	cleanMeanLen	malinisMaxLen	malinisMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9

Pagtatasa ng Kalidad ng Datos ng Sample ng RNA

Talahanayan 1. Mga estadistika sa malinis na datos.

Pangalan ng File	ID ng Kliyente	Bilang ng Pagbasa	BaseNumber	N50	Katamtamang Haba	Pinakamataas na Haba	MeanQscore
RNA_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	Q12