BMKCloud Log in
条形banner-03

Mga produkto

DNA/RNA Sequencing – Nanopore Sequencer

Ang ONT sequencing ay isang solong molekula na real-time na electrical signal sequencing technology batay sa nanopores, ang sequencing principle ng bawat platform ay pareho.Ang double-stranded na DNA/RNA ay magbibigkis sa nanoporous na protina na naka-embed sa biofilm at mag-unwinding sa ilalim ng lead ng motor protein, sa ilalim ng pagkilos ng pagkakaiba ng boltahe mula sa magkabilang panig ng biofilm, ang mga DNA/RNA strands ay dumadaan sa nanopore channel protein sa isang tiyak rate.Dahil sa pagkakaiba-iba ng mga kemikal na katangian ng iba't ibang base sa DNA/RNA strand, kapag ang isang base o molekula ng DNA ay dumaan sa nanopore channel, ito ay magiging sanhi ng pagbabago ng iba't ibang electrical signal.Sa pamamagitan ng pag-detect at pag-uugnay sa mga signal na ito, maaaring kalkulahin ang mga kaukulang uri ng base, at ang real-time na pagtuklas ng sequence ay maaaring makumpleto.


Mga Detalye ng Serbisyo

Resulta ng Demo

Mga Tampok ng Mga Detalye ng Serbisyo

Platform

Laki ng Aklatan

Theoretical Data Yield (Per Cell)

Single-base na Katumpakan

Mga aplikasyon

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90Gb/Cell

85-92%

SV calling, De novo, Full-length sequencing, Iso-Seq, Gene annotation, Detection of DNA methylation

Mga Kalamangan sa Serbisyo

● Higit sa 5 taong karanasan sa PacBio sequencing platform na may libu-libong saradong proyekto na may iba't ibang species.
● Ang BMKGENE ay isang opisyal na kasosyo ng Oxford Nanopore, na may dual platform na RNA/DNA certification.
● May mga pangunahing modelo ng mga sequencer na may kumpletong kagamitan at sapat na sequencing throughput.
● Batay sa Nanopore platform, mahigit 10 hayop at halaman na mga pagsasaliksik ng Denovo ang nai-publish sa mga kilalang journal sa buong mundo.

Mga Sample na Kinakailangan


Uri ng Sample

Halaga

Concentrtion(Qubit ®)

Dami

Kadalisayan

Iba

Genomic DNA

Depende sa Data Requirement

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

Maaliwalas na peak sa 260 nm,walang kontaminasyon

Kailangang sukatin ang konsentrasyon ng Qubit at Qubit/Nanopore ≤ 2

Kabuuang RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5;walang kontaminasyon

Halaga ng RIN ≥7.5

 

Daloy ng Trabaho ng Serbisyo

paghahanda ng sample

Paghahanda ng sample

Paghahanda sa Aklatan

Paggawa ng aklatan

Pagsusunod-sunod

Pagsusunod-sunod

Pagsusuri sa datos

Pagsusuri sa datos

Sample QC

Paghahatid ng proyekto


  • Nakaraan:
  • Susunod:

  • Pagtatasa ng Kalidad ng Data ng Sample ng DNA

    Talahanayan 1. Mga istatistika sa malinis na datos.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    malinisN50Len

    malinisN90Len

    malinisMeanLen

    malinisMaxLen

    malinisMeanQual

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15,764

    23,090

    143,181

    9

    Pagtatasa ng Kalidad ng Data ng Sample ng RNA

    Talahanayan 1. Mga istatistika sa malinis na datos.

    FileName

    ID ng kliyente

    ReadNum

    BaseNum

    N50

    MeanLength

    MaxLength

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    Q12

    Figure 1. Basahin ang distribusyon ng haba

    A3

    Figure 2. Pamamahagi ng marka ng kalidad ng malinis na data

    A4

    Figure 3. Haba at kalidad ng pamamahagi ng marka ng malinis na data

    A5

    kumuha ka ng kota

    Isulat ang iyong mensahe dito at ipadala ito sa amin

    Ipadala ang iyong mensahe sa amin: