-
Metagenomic تسلسل (NGS)
میټاجینوم د ژوندی موجوداتو د ګډې ټولنې ټول جینیاتي موادو ټولګه ته اشاره کوي لکه د چاپیریال میټاجینوم، د انسان میټاجینوم او داسې نور. دا د کرنې وړ او غیر کښت وړ مایکرو ارګانیزمونو جینومونه لري.د میټاګینومیک ترتیب یوه مالیکولر وسیله ده چې د چاپیریال نمونو څخه استخراج شوي مخلوط جینومیک توکي تحلیل کولو لپاره کارول کیږي، کوم چې د ډولونو تنوع او کثرت، نفوس جوړښت، فیلوجینیک اړیکه، فعال جینونه او د چاپیریال فکتورونو سره د اړیکو شبکه کې تفصيلي معلومات وړاندې کوي.
پلیټ فارم:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic Sequencing-نانوپور
میټاګینومکس یو مالیکولر وسیله ده چې د چاپیریال نمونو څخه استخراج شوي مخلوط جینومیک مواد تحلیل کولو لپاره کارول کیږي، کوم چې د ډولونو تنوع او کثرت، د نفوس جوړښت، فایلوجینیک اړیکه، فعال جینونه او د چاپیریال فکتورونو سره د اړیکو شبکه، او نور په اړه مفصل معلومات وړاندې کوي. د نانوپور ترتیب کولو پلیټ فارمونه پدې وروستیو کې معرفي شوي. د میټاګینومیک مطالعاتو لپاره.د لوستلو په اوږدوالي کې د دې عالي فعالیت په پراخه کچه د لاندې جریان میټاجینومیک تحلیل ته وده ورکړه ، په ځانګړي توګه د میټاګینوم اسمبلۍ.د لوستلو اوږدوالی څخه په ګټې اخیستنې، د نانوپور میشته میټاګینومیک مطالعه د دې وړتیا لري چې د شاټ ټوپک میټاګینومکس سره پرتله کولو سره ډیر دوامداره مجلس ترلاسه کړي.دا خپاره شوي چې د نانوپور میشته میټاګینومکس په بریالیتوب سره د مایکرو بایومونو څخه بشپړ او تړل شوي باکتریا جینومونه تولید کړي (Moss, EL, et. al.,د طبیعت بایوټیک۲۰۲۰)
پلیټ فارم:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS امپلیکون ترتیب کول-PacBio
په 16S او 18S rRNA کې فرعي واحد چې دواړه خورا خوندي او لوړ متغیر سیمې لري د پروکریوټیک او یوکریوټیک ارګانیزمونو پیژندنې لپاره د مالیکولر ګوتو نښه ده.د ترتیب څخه په ګټه اخیستنې سره، دا امپلیکون د خوندي برخو پراساس په نښه کیدی شي او د هایپر متغیر سیمې په بشپړ ډول د مایکروبیل پیژندنې لپاره مشخص کیدی شي چې د مایکروبیل تنوع تحلیل ، ټیکونومي ، فیلوجیني او نور پوښښ کې مرسته کوي. واحد مالیکول ریښتیني وخت (SMRT) ) د PacBio پلیټ فارم ترتیب کول د خورا دقیق اوږد لوستلو ترلاسه کولو توان ورکوي ، کوم چې کولی شي د بشپړ اوږدوالي امپلیکون پوښښ کړي (شاوخوا 1.5 Kb).د جینیاتي ساحې پراخه لید د باکتریا یا فنګسي ټولنې کې د نوعې تشریح کې حل خورا ښه کړی.
پلیټ فارم:د PacBio سیکویل II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
د 16S/18S/ITS امپلیکون ترتیب هدف په مایکروبیل ټولنه کې د فایلوجیني ، ټیکونومي او ډولونو کثرت څرګندول دي د کور ساتنې جینیتیک مارکرونو PCR محصولاتو تحقیق کولو له لارې چې دواړه خورا متقابل او هایپر بدلیدونکي برخې لري.د Woeses et al (1977) لخوا د دې کامل مالیکولر ګوتو نښې معرفي کول د انزوا څخه پاک مایکروبیوم پروفایل کولو ځواک ورکوي.د 16S (باکتریا)، 18S (فنګسي) او داخلي لیږد شوي سپیسر (ITS، فنګسي) ترتیب کول د دواړو پراخه ډولونو او همدارنګه نادر او ناپیژندل شوي ډولونو پیژندلو ته اجازه ورکوي.دا ټیکنالوژي په بیلابیلو چاپیریالونو کې د توپیر مایکروبیل جوړښت پیژندلو کې په پراخه کچه پلي شوي او لوی وسیله ګرځیدلې ، لکه د انسان خولې ، کولمو ، ملایانو او داسې نور.
پلیټ فارم:Illumina NovaSeq6000
-
د باکتریا او فنګسي ټول جینوم بیا ترتیب کول
د باکتریا او فنګسي ټول جینوم بیا ترتیب کول د پیژندل شوي بکتیریا او فنګسي جینومونو بشپړولو لپاره یو مهم وسیله ده، او همدارنګه د څو جینومونو پرتله کول یا د نوي ژوندی موجوداتو جینومونو نقشه کول.دا خورا مهم دی چې د باکتریا او فنګسي ټول جینومونه ترتیب کړي ترڅو دقیق حواله جینومونه رامینځته کړي ، د مایکروبیل پیژندنې او نورو پرتله کولو جینوم مطالعات ترسره کړي.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq 6000
-
فنګسي جینوم
د بایومارکر ټیکنالوژي د ځانګړي څیړنې هدف پورې اړه لري د جینوم سروې، ښه جینوم او د فنګل بشپړ جینوم چمتو کوي.د جینوم ترتیب، مجلس او فعال تشریح د لوړ پوړ جینوم اسمبلۍ ترلاسه کولو لپاره د راتلونکي نسل ترتیب + دریم نسل ترتیب سره یوځای کولو سره ترلاسه کیدی شي.Hi-C ټیکنالوژي هم د کروموزوم په کچه د جینوم راټولولو اسانتیا لپاره کارول کیدی شي.
پلیټ فارم:د PacBio سیکویل II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
باکتریا بشپړ جینوم
د بایومارکر ټیکنالوژي د صفر تشې سره د باکتریا بشپړ جینوم جوړولو لپاره د ترتیب خدمت چمتو کوي.د باکتریا بشپړ جینوم جوړونې اصلي کاري فلو کې د دریم نسل ترتیب کول ، مجلس ، فعال تشریح او پرمختللي بایو انفارمیټیک تحلیل شامل دي چې ځانګړي څیړنې اهداف پوره کوي.د باکتریا جینوم خورا پراخه پروفایل کول د هغو بنسټیزو میکانیزمونو څرګندولو ځواک ورکوي چې د دوی بیولوژیکي پروسو لاندې دي، کوم چې کولی شي په لوړو یوکریوټیک ډولونو کې د جینومیک څیړنو لپاره ارزښتناکه حواله چمتو کړي.
پلیټ فارم:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
د PacBio سیکویل II
