-
Метагеномик дараалал (NGS)
Метагеном гэдэг нь хүрээлэн буй орчны метагеном, хүний метагеном гэх мэт холимог организмын нийт генетикийн материалын цуглуулгыг хэлнэ. Энэ нь тариалж болох ба тариалах боломжгүй бичил биетний геномыг агуулдаг.Метагеномик дараалал нь хүрээлэн буй орчны дээжээс гаргаж авсан холимог геномын материалыг шинжлэхэд ашигладаг молекулын хэрэгсэл бөгөөд зүйлийн олон талт байдал, элбэгшил, популяцийн бүтэц, филогенетик харилцаа, функциональ ген, хүрээлэн буй орчны хүчин зүйлстэй харилцах сүлжээний талаар дэлгэрэнгүй мэдээлэл өгдөг.
Платформ:Illumina NovaSeq6000
-
Метагеномик дараалал-Нанопора
Метагеномикс нь хүрээлэн буй орчны дээжээс гаргаж авсан холимог геномын материалыг шинжлэхэд ашигладаг молекулын хэрэгсэл бөгөөд зүйлийн олон янз байдал, элбэг дэлбэг байдал, популяцийн бүтэц, филогенетик харилцаа, функциональ ген болон хүрээлэн буй орчны хүчин зүйлстэй харилцах сүлжээ гэх мэт дэлгэрэнгүй мэдээлэл өгдөг. Нанопорын дараалал тогтоох платформыг саяхан нэвтрүүлсэн. метагеномын судалгаанд.Унших уртын хувьд түүний гайхалтай гүйцэтгэл нь метагеномын шинжилгээ, ялангуяа метагеномын угсралтыг ихээхэн сайжруулсан.Унших уртын давуу талыг ашиглан Нанопород суурилсан метагеномын судалгаа нь бууны метагеномиктой харьцуулахад илүү тасралтгүй угсрах боломжтой юм.Нанопород суурилсан метагеномик нь микробиомоос бүрэн, хаалттай бактерийн геномыг амжилттай гаргаж авсан нь нийтлэгдсэн (Moss, EL, et. al.,Байгалийн биотехнологи, 2020)
Платформ:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S ба 18S рРНХ-ийн өндөр хадгалалттай болон хэт хувьсах бүс нутгийг агуулсан дэд нэгж нь прокариот ба эукариот организмыг тодорхойлох төгс молекул хурууны хээ юм.Дарааллын давуу талыг ашиглан эдгээр ампликонуудыг хадгалсан хэсгүүдэд тулгуурлан чиглүүлж, хэт хувьсах бүс нутгуудыг бичил биетний олон янз байдлын шинжилгээ, ангилал зүй, филогени гэх мэт судалгаанд хувь нэмрээ оруулан бичил биетнийг тодорхойлоход зориулж бүрэн тодорхойлох боломжтой. Нэг молекулын бодит цагийн (SMRT) ) PacBio платформын дараалал нь бүрэн хэмжээний ампликонуудыг (ойролцоогоор 1.5 Кб) хамрах өндөр нарийвчлалтай урт унших боломжийг олгодог.Генетикийн талбайг өргөнөөр харах нь бактери, мөөгөнцөрийн бүлгүүдийн зүйлийн тэмдэглэгээний нарийвчлалыг ихээхэн сайжруулсан.
Платформ:PacBio үргэлжлэл II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS ампликоны дараалал нь хоорондоо харилцан уялдаатай болон хэт хувьсагч хэсгүүдийг агуулсан гэр ахуйн генетикийн маркеруудын ПГУ-ын бүтээгдэхүүнийг судлах замаар бичил биетний бүлэгт филогени, ангилал зүй, зүйлийн элбэг дэлбэг байдлыг илрүүлэх зорилготой.Woeses нар (1977) эдгээр төгс молекул хурууны хээг нэвтрүүлсэн нь тусгаарлалтгүй микробиомын профайлыг сайжруулах боломжийг олгодог.16S (нян), 18S (мөөгөнцөр) болон дотоод транскрипт зайлагч (ITS, мөөгөнцөр)-ийн дараалал нь элбэг зүйл, ховор, тодорхойгүй зүйлүүдийг хоёуланг нь тодорхойлох боломжийг олгодог.Энэхүү технологи нь хүний ам, гэдэс, баас гэх мэт янз бүрийн орчинд микробын ялгавартай найрлагыг тодорхойлоход өргөн хэрэглэгдэж, гол хэрэгсэл болж байна.
Платформ:Illumina NovaSeq6000
-
Бактери ба мөөгөнцрийн бүхэл геномын дараалал
Бактерийн болон мөөгөнцрийн бүхэл геномын дарааллыг тогтоох нь мэдэгдэж буй бактери, мөөгөнцрийн геномыг гүйцээх, олон геномыг харьцуулах эсвэл шинэ организмын геномын зураглал хийх чухал хэрэгсэл юм.Нарийн лавлагаа геном гаргах, бичил биетнийг тодорхойлох болон бусад харьцуулсан геномын судалгааг хийхийн тулд нян, мөөгөнцөрийн геномыг бүхэлд нь дараалалд оруулах нь маш чухал юм.
Платформ: Illumina NovaSeq 6000
-
Мөөгөнцрийн геном
Biomarker Technologies нь судалгааны тодорхой зорилгоос хамааран геномын судалгаа, нарийн геном, мөөгөнцрийн бүрэн гүйцэд геномоор хангадаг.Геномын дараалал, угсралт, функциональ тэмдэглэгээг өндөр түвшний геномын угсралтад хүрэхийн тулд Дараагийн үеийн дараалал + Гурав дахь үеийн дарааллыг хослуулснаар хүрч болно.Хромосомын түвшинд геномын угсралтыг хөнгөвчлөхийн тулд Hi-C технологийг бас ашиглаж болно.
Платформ:PacBio үргэлжлэл II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Бактерийн бүрэн геном
Biomarker Technologies нь тэг цоорхойтой бактерийн геномыг бүрэн бүтээх дарааллын үйлчилгээг үзүүлдэг.Бактерийн геномыг бүрэн бүтээх үндсэн ажлын урсгалд гурав дахь үеийн дараалал, угсралт, функциональ тайлбар, судалгааны тодорхой зорилгыг хангасан дэвшилтэт биоинформатик шинжилгээ орно.Бактерийн геномын дэлгэрэнгүй мэдээлэл нь тэдний биологийн үйл явцын үндсэн механизмыг илрүүлэх боломжийг олгодог бөгөөд энэ нь дээд эукариот зүйлийн геномын судалгаанд үнэ цэнэтэй лавлагаа болж чадна.
Платформ:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio үргэлжлэл II
