-
Penjujukan Metagenomik (NGS)
Metagenom merujuk kepada koleksi jumlah bahan genetik komuniti campuran organisma, seperti metagenom persekitaran, metagenom manusia, dll. Ia mengandungi genom kedua-dua mikroorganisma yang boleh ditanam dan tidak boleh ditanam.Penjujukan metagenomik ialah alat molekul yang digunakan untuk menganalisis bahan genomik campuran yang diekstrak daripada sampel persekitaran, yang menyediakan maklumat terperinci dalam kepelbagaian dan kelimpahan spesies, struktur populasi, hubungan filogenetik, gen berfungsi dan rangkaian korelasi dengan faktor persekitaran.
Platform：Illumina NovaSeq6000
-
Penjujukan Metagenomik-Nanopori
Metagenomik ialah alat molekul yang digunakan untuk menganalisis bahan genomik campuran yang diekstrak daripada sampel persekitaran, yang menyediakan maklumat terperinci dalam kepelbagaian dan kelimpahan spesies, struktur populasi, hubungan filogenetik, gen berfungsi dan rangkaian korelasi dengan faktor persekitaran, dsb. Platform penjujukan Nanopore baru-baru ini diperkenalkan kepada kajian metagenomik.Prestasi cemerlangnya dalam panjang bacaan sebahagian besarnya meningkatkan analisis metagenomik aliran bawah, terutamanya pemasangan metagenom.Mengambil kelebihan daripada bacaan panjang, kajian metagenomik berasaskan Nanopore mampu mencapai pemasangan yang lebih berterusan berbanding dengan metagenomik senapang patah.Telah diterbitkan bahawa metagenomik berasaskan Nanopore berjaya menghasilkan genom bakteria lengkap dan tertutup daripada mikrobiom (Moss, EL, et. al,Bioteknologi Alam Semula Jadi, 2020)
Platform：Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Subunit pada rRNA 16S dan 18S yang mengandungi kedua-dua kawasan yang sangat konservatif dan hiper-pembolehubah ialah cap jari molekul yang sempurna untuk pengecaman organisma prokariotik dan eukariotik.Mengambil kesempatan daripada penjujukan, amplikon ini boleh disasarkan berdasarkan bahagian yang dipelihara dan kawasan pembolehubah hiper boleh dicirikan sepenuhnya untuk pengenalpastian mikrob yang menyumbang kepada kajian yang meliputi analisis kepelbagaian mikrob, taksonomi, filogeni, dll. Molekul tunggal masa nyata (SMRT ) penjujukan platform PacBio membolehkan mendapatkan bacaan panjang yang sangat tepat, yang boleh meliputi amplikon panjang penuh (lebih kurang 1.5 Kb).Pandangan luas bidang genetik telah meningkatkan resolusi dalam anotasi spesies dalam komuniti bakteria atau kulat.
Platform：Sekuel PacBio II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Penjujukan amplikon 16S/18S/ITS bertujuan untuk mendedahkan kelimpahan filogeni, taksonomi dan spesies dalam komuniti mikrob dengan menyiasat produk PCR penanda genetik pengemasan yang mengandungi kedua-dua bahagian yang sangat bertutur dan hipervariable.Pengenalan cap jari molekul sempurna ini oleh Woeses et al, (1977) memperkasakan pemprofilan mikrobiom bebas pengasingan.Penjujukan 16S (bakteria), 18S (kulat) dan spacer transkripsi Dalaman (ITS, kulat) membolehkan pengecaman kedua-dua spesies yang banyak serta spesies yang jarang dan tidak dikenal pasti.Teknologi ini telah menjadi alat yang digunakan secara meluas dan utama dalam mengenal pasti komposisi mikrob yang berbeza dalam pelbagai persekitaran, seperti mulut manusia, usus, najis, dll.
Platform：Illumina NovaSeq6000
-
Penjujukan Semula Seluruh Genom Bakteria dan Kulat
Penjujukan semula genom keseluruhan bakteria dan kulat ialah alat kritikal untuk melengkapkan genom bakteria dan kulat yang diketahui, serta membandingkan berbilang genom atau memetakan genom organisma baharu.Adalah sangat penting untuk menyusun keseluruhan genom bakteria dan kulat untuk menghasilkan genom rujukan yang tepat, untuk melakukan pengenalpastian mikrob dan kajian genom perbandingan lain.
Platform:Illumina NovaSeq 6000
-
Genom kulat
Biomarker Technologies menyediakan tinjauan genom, genom halus dan genom kulat pene-lengkap bergantung pada matlamat penyelidikan tertentu.Penjujukan genom, pemasangan dan anotasi berfungsi boleh dicapai dengan menggabungkan penjujukan generasi seterusnya + Penjujukan generasi ketiga untuk mencapai pemasangan genom peringkat tinggi.Teknologi Hi-C juga boleh digunakan untuk memudahkan pemasangan genom pada tahap kromosom.
Platform：Sekuel PacBio II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Genom Lengkap Bakteria
Biomarker Technologies menyediakan perkhidmatan penjujukan untuk membina genom lengkap bakteria dengan jurang sifar.Aliran kerja utama pembinaan genom lengkap bakteria termasuk penjujukan generasi ketiga, pemasangan, anotasi berfungsi dan analisis bioinformatik lanjutan yang memenuhi matlamat penyelidikan khusus.Profil genom bakteria yang lebih komprehensif memperkasakan pendedahan mekanisme asas yang mendasari proses biologi mereka, yang juga boleh memberikan rujukan berharga untuk penyelidikan genomik dalam spesies eukariotik yang lebih tinggi
Platform：Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
Sekuel PacBio II
