-
пайдарпайии метагеномӣ (NGS)
Метагеном ба маҷмӯаи маводи умумии генетикии ҷамъияти омехтаи организмҳо, ба монанди метагеноми муҳити зист, метагеноми инсон ва ғ. дахл дорад. Он дорои геномҳои ҳам микроорганизмҳои киштшаванда ва ҳам коркарднашаванда мебошад.Пайдарпаии метагеномӣ як воситаи молекулавӣ барои таҳлили маводи омехтаи геномии аз намунаҳои муҳити зист истихроҷшуда мебошад, ки дар бораи гуногунрангӣ ва фаровонии намудҳо, сохтори популятсия, робитаи филогенетикӣ, генҳои функсионалӣ ва шабакаи коррелятсия бо омилҳои муҳити зист маълумоти муфассал медиҳад.
Платформа:Illumina NovaSeq6000
-
Пайдарпаии метагеномӣ-Нанопур
Метагеномика як воситаи молекулавӣ барои таҳлили маводи омехтаи геномии аз намунаҳои муҳити зист истихроҷшуда мебошад, ки маълумоти муфассалро дар бораи гуногунрангӣ ва фаровонии намудҳо, сохтори популятсия, робитаи филогенетикӣ, генҳои функсионалӣ ва шабакаи коррелятсия бо омилҳои муҳити зист ва ғайра медиҳад. ба омӯзиши метагеномӣ.Фаъолияти барҷастаи он дар дарозии хониш ба таври назаррас таҳлили метагеномии поёнӣ, бахусус маҷмӯаи метагеномҳоро такмил дод.Бо истифода аз бартариҳои дарозии хондан, омӯзиши метагеномии нанопур дар муқоиса бо метагеномикаи тирандозӣ метавонад ба ҷамъомади муттасили бештар ноил шавад.Интишор шудааст, ки метагеномика дар асоси нанопор геномҳои пурра ва пӯшидаи бактерияҳоро аз микробиомаҳо бомуваффақият тавлид кардааст (Moss, EL, et.Биотехнологияи табиат, 2020)
Платформа:Nanopore PromethION P48
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Зершӯъбаи 16S ва 18S rRNA, ки ҳам минтақаҳои хеле ҳифзшуда ва ҳам гипертағйирёбанда доранд, изи ангуштони молекулавӣ барои муайян кардани организмҳои прокариотӣ ва эукариотӣ мебошад.Бо истифода аз пайдарпайӣ, ин ампликонҳоро метавон дар асоси қисмҳои ҳифзшуда ҳадаф қарор дод ва минтақаҳои гипертағйирёбандаро пурра барои муайянкунии микробҳо тавсиф кардан мумкин аст, ки ба таҳқиқоти таҳлили гуногунии микробҳо, таксономия, филогения ва ғайра мусоидат мекунанд. ) пайдарпайии платформаи PacBio имкон медиҳад, ки хондани хеле дақиқи дароз, ки ампликонҳои пурраро (тақрибан 1,5 Кб) фаро гирифта метавонанд.Намоиши васеъи майдони генетикӣ ҳалли шарҳи намудҳоро дар ҷомеаи бактерияҳо ё занбӯруғҳо хеле беҳтар кард.
Платформа:Пайванди PacBio II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Ҳадафи пайдарпайии ампликони 16S/18S/ITS ошкор кардани филогения, таксономия ва фаровонии намудҳо дар ҷомеаи микробҳо тавассути таҳқиқи маҳсулоти PCR-и маркерҳои генетикии хонагӣ, ки ҳам қисмҳои хеле гуфтугӯ ва ҳам гипертағйирёбандаро дар бар мегиранд.Ҷорӣ кардани ин изи ангуштони комили молекулавӣ аз ҷониби Woeses et al, (1977) профили микробиомаҳои бе изолятсияро фароҳам меорад.Пайдарпаии 16S (бактерияҳо), 18S (занбуғҳо) ва spacer transcribed internal (ITS, fungi) имкон медиҳад, ки ҳам намудҳои фаровон ва ҳам навъҳои нодир ва номаълум муайян карда шаванд.Ин технология як воситаи васеъ истифодашаванда ва асосӣ дар муайян кардани таркиби дифференсиалии микробҳо дар муҳитҳои гуногун, аз қабили даҳони инсон, рӯдаҳо, наҷосат ва ғайра шудааст.
Платформа:Illumina NovaSeq6000
-
Таҷдиди пайдарпайии тамоми геноми бактериявӣ ва fungal
Таҷдиди пайдарпайии тамоми геномҳои бактериявӣ ва занбӯруғӣ як воситаи муҳим барои анҷом додани геномҳои бактерия ва занбӯруғҳои маълум, инчунин муқоисаи геномҳои сершумор ё харитаи геномҳои организмҳои нав мебошад.Барои тавлиди геномҳои дақиқи истинод, муайянкунии микробҳо ва дигар таҳқиқоти муқоисавии геномҳо, пайдарпайии тамоми геномҳои бактерия ва занбӯруғҳо аҳамияти калон дорад.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Геномҳои fungal
Технологияҳои биомаркер вобаста ба ҳадафи мушаххаси тадқиқот тадқиқоти геномӣ, геномҳои хуб ва геноми пурраи геноми занбӯруғҳоро таъмин мекунанд.Пайдарпайвандии геномҳо, ҷамъбаст ва тавзеҳи функсионалӣ мумкин аст тавассути омезиши пайдарпайии насли оянда + пайдарпайии насли сеюм барои ноил шудан ба маҷмӯи геномҳои сатҳи баланд ба даст оварда шавад.Технологияи Hi-C низ метавонад барои осон кардани ҷамъшавии геномҳо дар сатҳи хромосома истифода шавад.
Платформа:Пайванди PacBio II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Геноми пурраи бактерияҳо
Biomarker Technologies хидмати пайдарпайро оид ба сохтани геноми мукаммали бактерияҳо бо холигии сифр пешкаш мекунад.Ҷараёни асосии кори бактерияҳо, ки геномҳои мукаммал сохта мешаванд, пайдарпайии насли сеюм, васлкунӣ, шарҳи функсионалӣ ва таҳлили пешрафтаи биоинформатикиро, ки ҳадафҳои мушаххаси тадқиқотро иҷро мекунанд, дар бар мегирад.Профили ҳамаҷонибаи геноми бактерияҳо имкон медиҳад, ки механизмҳои бунёдии равандҳои биологии онҳо ошкор карда шаванд, ки ин инчунин метавонад барои таҳқиқоти геномикӣ дар намудҳои олии эукариотҳо истинодҳои арзишманд диҳад.
Платформа:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
Пайванди PacBio II
