-
क्रोमॅटिन इम्युनोप्रेसिपिटेशन सिक्वेन्सिंग (ChIP-seq)
ChIP-Seq हिस्टोन बदल, ट्रान्सक्रिप्शन घटक आणि इतर डीएनए-संबंधित प्रथिनांसाठी डीएनए लक्ष्यांचे जीनोम-व्यापी प्रोफाइलिंग प्रदान करते.हे विशिष्ट प्रोटीन-डीएनए कॉम्प्लेक्स पुनर्प्राप्त करण्यासाठी क्रोमॅटिन इम्युनो-पर्सिपिटेशन (ChIP) च्या निवडकतेला एकत्रित करते, पुनर्प्राप्त केलेल्या डीएनएच्या उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमासाठी नेक्स्ट-जनरेशन सिक्वेन्सिंग (NGS) च्या सामर्थ्यासह.याव्यतिरिक्त, प्रथिने-डीएनए कॉम्प्लेक्स जिवंत पेशींमधून पुनर्प्राप्त केल्यामुळे, बंधनकारक साइटची तुलना वेगवेगळ्या पेशी प्रकार आणि ऊतकांमध्ये किंवा भिन्न परिस्थितींमध्ये केली जाऊ शकते.अनुप्रयोगांमध्ये ट्रान्सक्रिप्शनल रेग्युलेशनपासून डेव्हलपमेंटल पॅथवेजपासून ते रोगाच्या यंत्रणेपर्यंत आणि त्याही पलीकडे असतात.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq प्लॅटफॉर्म
-
संपूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रम
सायटोसिन (5-mC) मध्ये पाचव्या स्थानावर असलेल्या डीएनए मेथिलेशनचा जीन अभिव्यक्तीवर आणि सेल्युलर क्रियाकलापांवर मूलभूत प्रभाव आहे.असामान्य मेथिलेशन पॅटर्न कर्करोगासारख्या अनेक परिस्थिती आणि रोगांशी संबंधित आहेत.सिंगल बेस रिझोल्यूशनवर जीनोम-वाइड मेथिलेशनचा अभ्यास करण्यासाठी WGBS हे सुवर्ण मानक बनले आहे.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq प्लॅटफॉर्म
-
उच्च थ्रूपुट सिक्वेन्सिंग (ATAC-seq) सह ट्रान्सपोसेस-अॅक्सेसिबल क्रोमॅटिनसाठी परख
ATAC-seq ही जीनोम-व्यापी क्रोमॅटिन प्रवेशयोग्यतेच्या विश्लेषणासाठी उच्च-थ्रूपुट अनुक्रम पद्धत आहे, जी जनुक अभिव्यक्तीच्या जागतिक एपिजेनेटिक नियंत्रणासाठी महत्त्वपूर्ण आहे.हायपरएक्टिव्ह Tn5 ट्रान्सपोसेस द्वारे सिक्वेन्सिंग अडॅप्टर्स खुल्या क्रोमॅटिन क्षेत्रांमध्ये घातले जातात.पीसीआर प्रवर्धनानंतर, एक अनुक्रमिक लायब्ररी बांधली जाते.सर्व खुल्या क्रोमॅटिन क्षेत्र एका विशिष्ट स्पेस-टाइम स्थितीनुसार मिळू शकतात, केवळ ट्रान्सक्रिप्शन घटकाच्या बंधनकारक साइट्सपुरते मर्यादित नाही, किंवा विशिष्ट हिस्टोन सुधारित प्रदेश.
-
रिड्युस्ड रिप्रेझेंटेशन बिसल्फाइट सिक्वेन्सिंग (RRBS)
डीएनए मेथिलेशन संशोधन हा रोग संशोधनात नेहमीच चर्चेचा विषय राहिला आहे आणि जनुक अभिव्यक्ती आणि फिनो-टाइपिक वैशिष्ट्यांशी जवळून संबंधित आहे.RRBS ही DNA मेथिलेशन संशोधनासाठी अचूक, कार्यक्षम आणि किफायतशीर पद्धत आहे.प्रवर्तक आणि CpG बेट क्षेत्रांचे एन्झाईमॅटिक क्लीवेज (Msp I) द्वारे संवर्धन, Bisulfite अनुक्रमासह, उच्च रिझोल्यूशन DNA मेथिलेशन शोध प्रदान करते.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq प्लॅटफॉर्म
