-
जीनोम-वाइड असोसिएशन विश्लेषण
जीनोम-वाइड असोसिएशन स्टडी (जीडब्ल्यूएएस) चे उद्दिष्ट विशिष्ट वैशिष्ट्यांशी (फिनोटाइप) संबंधित अनुवांशिक रूपे (जीनोटाइप) ओळखणे आहे.GWAS अभ्यास अनुवांशिक मार्कर मोठ्या संख्येने व्यक्तींच्या संपूर्ण जीनोमची तपासणी करतो आणि लोकसंख्येच्या पातळीवर सांख्यिकीय विश्लेषणाद्वारे जीनोटाइप-फिनोटाइप असोसिएशनचा अंदाज लावतो.मानवी रोगांवरील संशोधन आणि प्राणी किंवा वनस्पतींच्या जटिल वैशिष्ट्यांवरील कार्यात्मक जनुकांच्या खाणकामात याचा मोठ्या प्रमाणावर वापर केला गेला आहे.
-
सिंगल- न्यूक्लियस आरएनए सिक्वेन्सिंग
सिंगल सेल कॅप्चरिंग आणि वैयक्तिक लायब्ररी बांधकाम तंत्रात प्रगती उच्च-थ्रूपुट सिक्वेन्सिंगसह एकत्रित केल्याने सेल-बाय-सेल आधारावर जनुक अभिव्यक्तीचा अभ्यास करता येतो.हे जटिल पेशींच्या लोकसंख्येवर एक सखोल आणि संपूर्ण प्रणाली विश्लेषण सक्षम करते, ज्यामध्ये ते सर्व पेशींची सरासरी घेऊन त्यांच्या विषमतेचे मुखवटा टाळते.
तथापि, काही पेशी सिंगल-सेल सस्पेंशनमध्ये बनविण्यास योग्य नाहीत, म्हणून इतर नमुना तयार करण्याच्या पद्धती - ऊतींमधून न्यूक्लियस काढणे आवश्यक आहे, म्हणजेच, न्यूक्लियस थेट ऊतक किंवा पेशींमधून काढले जाते आणि एकल-केंद्रीय निलंबनामध्ये तयार केले जाते. सेल अनुक्रम.
BMK 10× Genomics ChromiumTM आधारित सिंगल-सेल RNA सिक्वेन्सिंग सेवा प्रदान करते.रोगाशी संबंधित अभ्यास, जसे की रोगप्रतिकारक पेशी भिन्नता, ट्यूमर विषमता, ऊतक विकास इ.
अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टोम चिप: 10× जीनोमिक्स
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq 6000
-
वनस्पती/प्राणी संपूर्ण जीनोम अनुक्रमणिका
संपूर्ण जीनोम री-सिक्वेंसिंग, ज्याला WGS असेही म्हणतात, सिंगल न्यूक्लियोटाइड पॉलिमॉर्फिज्म (SNP), इन्सर्शन डिलीशन (InDel), स्ट्रक्चर व्हेरिएशन (SV), आणि कॉपी नंबर व्हेरिएशन (CNV) यासह संपूर्ण जीनोमवरील सामान्य आणि दुर्मिळ दोन्ही उत्परिवर्तन उघड करण्यास सक्षम करते. ).SVs SNPs पेक्षा भिन्नता बेसचा एक मोठा भाग बनवतात आणि त्यांचा जीनोमवर जास्त प्रभाव असतो, ज्याचा सजीवांवर लक्षणीय परिणाम होतो.लाँग-रीड रिक्वेंसिंग मोठ्या तुकड्यांची आणि गुंतागुंतीची भिन्नता अधिक अचूक ओळखण्यास अनुमती देते कारण दीर्घ वाचनामुळे टॅन्डम रिपीट, GC/AT-समृद्ध प्रदेश आणि हायपर-व्हेरिएबल प्रदेश यांसारख्या क्लिष्ट प्रदेशांवर गुणसूत्र ओलांडणे खूप सोपे होते.
प्लॅटफॉर्म: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transscriptome
पेशींची स्थानिक संस्था विविध जैविक प्रक्रियांमध्ये महत्वाची भूमिका बजावते, जसे की रोगप्रतिकारक घुसखोरी, भ्रूण विकास इ. अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रम, जे अवकाशीय स्थितीची माहिती राखून ठेवत जनुक अभिव्यक्ती प्रोफाइलिंग दर्शवते, ट्रान्सक्रिप्टोम-स्तरीय टिश्यू आर्किटेक्चरमध्ये उत्कृष्ट अंतर्दृष्टी प्रदान करते.तंत्रज्ञानाच्या विकासासह, अल्ट्रा-क्लीअर टिश्यू मॉर्फोलॉजी आणि अवकाशीय आण्विक अभिव्यक्तीच्या वास्तविक संरचनात्मक फरकाचा उच्च रिझोल्यूशनसह अभ्यास करणे आवश्यक आहे.BMKGENE नमुन्यांपासून जैविक अंतर्दृष्टीपर्यंत सर्वसमावेशक, वन-स्टॉप अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रम सेवा प्रदान करते.
अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टॉमिक्स तंत्रज्ञानाने विषम नमुन्यांमधील अवकाशीय सामग्रीसह जनुक अभिव्यक्ती प्रोफाइलचे निराकरण करून विविध संशोधन क्षेत्रात नवीन दृष्टीकोनांना सशक्त केले.
अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टोम चिप: BMKMANU S1000
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq 6000
-
10x जीनोमिक्स व्हिजियम स्पेशियल ट्रान्सक्रिप्टोम
एकूण mRNA वर आधारित ऊतींचे वर्गीकरण करण्यासाठी व्हिजियम स्पेशियल जीन एक्सप्रेशन हे मुख्य प्रवाहातील अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञान आहे.सामान्य विकास, रोग पॅथॉलॉजी आणि क्लिनिकल अनुवादात्मक संशोधनातील नवीन अंतर्दृष्टी शोधण्यासाठी संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोमचा मॉर्फोलॉजिकल संदर्भासह नकाशा बनवा.BMKGENE नमुन्यांपासून जैविक अंतर्दृष्टीपर्यंत सर्वसमावेशक, वन-स्टॉप अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रम सेवा प्रदान करते.
अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टॉमिक्स तंत्रज्ञानाने विषम नमुन्यांमधील अवकाशीय सामग्रीसह जनुक अभिव्यक्ती प्रोफाइलचे निराकरण करून विविध संशोधन क्षेत्रात नवीन दृष्टीकोनांना सशक्त केले..
अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टोम चिप: 10x जीनोमिक्स व्हिजियम
प्लॅटफॉर्म:Illumina NovaSeq 6000
-
पूर्ण-लांबीचे mRNA अनुक्रम-नॅनोपोर
सर्वसमावेशक ट्रान्सक्रिप्टोम विश्लेषणासाठी आरएनए अनुक्रम हे एक अमूल्य साधन आहे.निःसंशयपणे, पारंपारिक शॉर्ट-रीड सिक्वेन्सिंगने येथे अनेक महत्त्वपूर्ण विकास साधले.तरीसुद्धा, पूर्ण-लांबीच्या आयसोफॉर्म ओळख, परिमाण, पीसीआर पूर्वाग्रह यामध्ये अनेकदा मर्यादा येतात.
नॅनोपोर सिक्वेन्सिंग स्वतःला इतर सिक्वेन्सिंग प्लॅटफॉर्मपासून वेगळे करते, ज्यामध्ये न्यूक्लियोटाइड्स डीएनए संश्लेषणाशिवाय थेट वाचले जातात आणि दहा किलोबेसवर दीर्घ वाचन तयार करतात.हे पूर्ण-लांबीच्या उतार्‍यांचे थेट वाचन करण्यास आणि आयसोफॉर्म-स्तरीय अभ्यासातील आव्हानांना सामोरे जाण्यास सक्षम करते.
प्लॅटफॉर्म:नॅनोपोर प्रोमेथिओन
लायब्ररी:cDNA-PCR
-
पूर्ण-लांबीचे mRNA अनुक्रम -PacBio
डी नोव्होपूर्ण-लांबीचे ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रम, या नावाने देखील ओळखले जातेडी नोव्होIso-Seq वाचन लांबीमध्ये PacBio sequencer चे फायदे घेते, ज्यामुळे पूर्ण-लांबीच्या cDNA रेणूंचा कोणताही खंड न पडता अनुक्रम करणे शक्य होते.हे ट्रान्सक्रिप्ट असेंब्ली स्टेप्समध्ये व्युत्पन्न झालेल्या कोणत्याही त्रुटी पूर्णपणे टाळते आणि आयसोफॉर्म-लेव्हल रिझोल्यूशनसह युनिजीन सेट तयार करते.हा युनिजीन संच ट्रान्सक्रिप्टोम स्तरावर "संदर्भ जीनोम" म्हणून शक्तिशाली अनुवांशिक माहिती प्रदान करतो.याव्यतिरिक्त, पुढील पिढीच्या अनुक्रमांक डेटासह एकत्रित करून, ही सेवा isoform-स्तरीय अभिव्यक्तीचे अचूक प्रमाणीकरण करण्यास सक्षम करते.
प्लॅटफॉर्म: PacBio सिक्वेल IIलायब्ररी: SMRT बेल लायब्ररी -
युकेरियोटिक एमआरएनए सिक्वेन्सिंग-इलुमिना
mRNA सिक्वेन्सिंग विशिष्ट परिस्थितीत पेशींमधून ट्रान्सक्रिप्ट केलेल्या सर्व mRNA चे प्रोफाइलिंग सक्षम करते.जनुक अभिव्यक्ती प्रोफाइल, जनुक संरचना आणि विशिष्ट जैविक प्रक्रियांच्या आण्विक यंत्रणा प्रकट करण्यासाठी हे एक शक्तिशाली तंत्रज्ञान आहे.आजपर्यंत, mRNA अनुक्रम मूलभूत संशोधन, क्लिनिकल डायग्नोस्टिक्स, औषध विकास इत्यादींमध्ये मोठ्या प्रमाणावर वापरले गेले आहे.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq 6000
-
गैर-संदर्भ आधारित mRNA सिक्वेन्सिंग-इलुमिना
काही विशेष कार्ये सक्रिय होत असलेल्या विशिष्ट कालावधीत मेसेंजर RNA(mRNA) फॉर्म युकेरियोट कॅप्चर करण्यासाठी mRNA सिक्वेन्सिंग नेक्स्ट-जनरेशन सिक्वेन्सिंग तंत्र (NGS) अवलंबते.कापलेल्या सर्वात लांब प्रतिलिपीला 'युनिजीन' असे म्हणतात आणि त्यानंतरच्या विश्लेषणासाठी संदर्भ अनुक्रम म्हणून वापरले जाते, जे संदर्भाशिवाय प्रजातींच्या आण्विक यंत्रणा आणि नियामक नेटवर्कचा अभ्यास करण्यासाठी एक प्रभावी माध्यम आहे.
ट्रान्सक्रिप्टम डेटा असेंब्ली आणि युनिजीन फंक्शनल एनोटेशन नंतर
(1)एसएसआर विश्लेषण, सीडीएस अंदाज आणि जनुकांची रचना पूर्वनिर्मित केली जाईल.
(२) प्रत्येक नमुन्यातील युनिजीन अभिव्यक्तीचे प्रमाणीकरण केले जाईल.
(३) नमुने (किंवा गट) दरम्यान भिन्नपणे व्यक्त केलेले युनिजीन युनिजीन अभिव्यक्तीच्या आधारे शोधले जातील
(4) भिन्न व्यक्त केलेल्या युनिजीन्सचे क्लस्टरिंग, कार्यात्मक भाष्य आणि संवर्धन विश्लेषण केले जाईल
-
लांब नॉन-कोडिंग अनुक्रम-इलुमिना
लाँग नॉन-कोडिंग RNAs (lncRNAs) हे 200 nt पेक्षा जास्त लांबीचे RNA रेणू आहेत, जे अत्यंत कमी कोडिंग क्षमतेने वैशिष्ट्यीकृत आहेत.LncRNA, नॉन-कोडिंग RNA मध्ये एक प्रमुख सदस्य म्हणून, मुख्यतः न्यूक्लियस आणि प्लाझ्मामध्ये आढळतो.सिक्वेन्सिंग टेक्नॉलॉजी आणि बायोइन्फॉर्मटिक्समधील विकासामुळे असंख्य नवीन lncRNAs ओळखणे शक्य होते आणि त्यांना जैविक कार्यांशी जोडले जाते.संचयी पुरावे सूचित करतात की lncRNA एपिजेनेटिक नियमन, ट्रान्सक्रिप्शन नियमन आणि पोस्ट-ट्रान्सक्रिप्शन नियमन यामध्ये मोठ्या प्रमाणावर गुंतलेले आहे.
-
लहान आरएनए अनुक्रम-इलुमिना
स्मॉल आरएनए म्हणजे नॉन-कोडिंग आरएनए रेणूंच्या वर्गाचा संदर्भ आहे ज्याची लांबी साधारणपणे 200nt पेक्षा कमी असते, ज्यात सूक्ष्म RNA (miRNA), लहान हस्तक्षेप RNA (siRNA), आणि piwi-interacting RNA (piRNA).
मायक्रोआरएनए (miRNA) हा अंतर्जात लहान आरएनएचा एक वर्ग आहे ज्याची लांबी सुमारे 20-24nt आहे, जी पेशींमध्ये विविध महत्त्वपूर्ण नियामक भूमिका बजावते.miRNA अनेक जीवन प्रक्रियांमध्ये सामील आहे जे ऊतक प्रकट करतात - विशिष्ट आणि स्टेज - विशिष्ट अभिव्यक्ती आणि विविध प्रजातींमध्ये अत्यंत संरक्षित.
-
circRNA अनुक्रम-इलुमिना
संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग हे सर्व प्रकारचे RNA रेणू प्रोफाईल करण्यासाठी डिझाइन केले आहे, ज्यामध्ये कोडिंग (mRNA) आणि नॉन-कोडिंग RNA (lncRNA, circRNA आणि miRNA सह) विशिष्ट पेशींद्वारे विशिष्ट वेळी लिप्यंतरण केले जाते.संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग, ज्याला "टोटल आरएनए सिक्वेन्सिंग" देखील म्हटले जाते, त्याचे उद्दिष्ट ट्रान्सक्रिप्टम स्तरावर सर्वसमावेशक नियामक नेटवर्क उघड करणे आहे.NGS तंत्रज्ञानाचा फायदा घेऊन, संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम उत्पादनांचे अनुक्रम ceRNA विश्लेषण आणि संयुक्त RNA विश्लेषणासाठी उपलब्ध आहेत, जे कार्यात्मक वैशिष्ट्यीकरणाच्या दिशेने पहिले पाऊल प्रदान करते.circRNA-miRNA-mRNA आधारित ceRNA चे नियामक नेटवर्क उघड करणे.
