page_head_bg

उत्पादने

मेटाजेनोमिक सिक्वेन्सिंग-नॅनोपोर

मेटाजेनॉमिक्स हे एक आण्विक साधन आहे जे पर्यावरणीय नमुन्यांमधून काढलेल्या मिश्रित जीनोमिक सामग्रीचे विश्लेषण करण्यासाठी वापरले जाते, जे प्रजाती विविधता आणि विपुलता, लोकसंख्येची रचना, फायलोजेनेटिक संबंध, कार्यात्मक जीन्स आणि पर्यावरणीय घटकांसह सहसंबंध नेटवर्क इत्यादींची तपशीलवार माहिती प्रदान करते. नॅनोपोर सिक्वेन्सिंग प्लॅटफॉर्मने अलीकडेच सादर केले आहे. मेटाजेनोमिक अभ्यासासाठी.वाचन लांबीमध्ये त्याची उत्कृष्ट कामगिरी मोठ्या प्रमाणात डाउन स्ट्रीम मेटाजेनोमिक विश्लेषण, विशेषत: मेटाजेनोम असेंब्ली वाढवते.वाचन-लांबीचा फायदा घेऊन, नॅनोपोर-आधारित मेटाजेनोमिक अभ्यास शॉट-गन मेटाजेनोमिक्सच्या तुलनेत अधिक सतत असेंबली साध्य करण्यास सक्षम आहे.हे प्रकाशित झाले आहे की नॅनोपोर-आधारित मेटाजेनोमिक्सने मायक्रोबायोम्स (मॉस, ईएल, एट. अल,नेचर बायोटेक, 2020)

प्लॅटफॉर्म:नॅनोपोर प्रोमेथिओन P48


सेवा तपशील

डेमो परिणाम

बीएमके केस

सेवा फायदे

Øउच्च-गुणवत्तेची असेंब्ली-प्रजाती ओळख आणि कार्यात्मक जनुक अंदाजाची अचूकता वाढवणे

Øबंद जिवाणू जीनोम अलगाव

Øविविध क्षेत्रात अधिक शक्तिशाली आणि विश्वासार्ह अनुप्रयोग, उदा. रोगजनक सूक्ष्मजीव किंवा प्रतिजैविक प्रतिरोधक जनुकांचा शोध

Øतुलनात्मक मेटाजेनोम विश्लेषण

सेवा तपशील

अनुक्रमप्लॅटफॉर्म

लायब्ररी

शिफारस केलेले डेटा उत्पन्न

अंदाजे टर्न-अराउंड वेळ

Illumina NovaSeq 6000

PE250

50K/100K/300K टॅग

30 दिवस

बायोइन्फॉरमॅटिक्स विश्लेषण

üकच्चा डेटा गुणवत्ता नियंत्रण

üमेटाजेनोम असेंब्ली

üनॉन-रिडंडंट जीन सेट आणि भाष्य

üप्रजाती विविधता विश्लेषण

üअनुवांशिक कार्य विविधता विश्लेषण

üआंतर-समूह विश्लेषण

üप्रायोगिक घटकांविरुद्ध असोसिएशन विश्लेषण

2

नमुना आवश्यकता आणि वितरण

नमुना आवश्यकता आणि वितरण

नमुना आवश्यकता:   

च्या साठीडीएनए अर्क:

नमुना प्रकार

रक्कम

एकाग्रता

पवित्रता

डीएनए अर्क

> 30 एनजी

1 ng/μl

OD260/280= 1.6-2.5

पर्यावरणीय नमुन्यांसाठी:

नमुना प्रकार

शिफारस केलेली नमुना प्रक्रिया

माती

नमुना रक्कम: अंदाजे.5 ग्रॅम;उरलेला वाळलेला पदार्थ पृष्ठभागावरून काढून टाकणे आवश्यक आहे;मोठे तुकडे बारीक करा आणि 2 मिमी फिल्टरमधून जा;आरक्षणासाठी निर्जंतुकीकरण EP-ट्यूब किंवा सायरोट्यूबमध्ये अलिकट नमुने.

विष्ठा

नमुना रक्कम: अंदाजे.5 ग्रॅम;आरक्षणासाठी निर्जंतुकीकरण EP-ट्यूब किंवा क्रायोट्यूबमध्ये अॅलिकोट नमुने गोळा करा.

आतड्यांसंबंधी सामग्री

अॅसेप्टिक स्थितीत नमुन्यांची प्रक्रिया करणे आवश्यक आहे.पीबीएससह गोळा केलेले ऊतक धुवा;PBS सेंट्रीफ्यूज करा आणि EP-ट्यूबमध्ये प्रक्षेपक गोळा करा.

गाळ

नमुना रक्कम: अंदाजे.5 ग्रॅम;आरक्षणासाठी निर्जंतुक EP-ट्यूब किंवा क्रायोट्यूबमध्ये अलिकट गाळ नमुना गोळा करा

पाणवठा

नळाचे पाणी, विहिरीचे पाणी इत्यादीसारख्या मर्यादित प्रमाणात सूक्ष्मजीव असलेल्या नमुन्यासाठी, कमीतकमी 1 लिटर पाणी गोळा करा आणि पडद्यावरील सूक्ष्मजीव समृद्ध करण्यासाठी 0.22 μm फिल्टरमधून जा.पडदा निर्जंतुकीकरण ट्यूबमध्ये साठवा.

त्वचा

निर्जंतुकीकरण कापूस पुसून किंवा सर्जिकल ब्लेडने त्वचेची पृष्ठभाग काळजीपूर्वक खरवडून घ्या आणि ती निर्जंतुकीकरण ट्यूबमध्ये ठेवा.

शिफारस केलेले नमुना वितरण

नमुने द्रव नायट्रोजनमध्ये 3-4 तासांसाठी गोठवा आणि द्रव नायट्रोजनमध्ये किंवा -80 अंश ते दीर्घकालीन आरक्षणामध्ये ठेवा.कोरड्या बर्फासह नमुना शिपिंग आवश्यक आहे.

सेवा कार्य प्रवाह

logo_02

नमुना वितरण

logo_04

ग्रंथालय बांधकाम

logo_05

अनुक्रम

logo_06

डेटा विश्लेषण

logo_07

विक्रीनंतर सेवा


  • मागील:
  • पुढे:

  • 1.हीटमॅप: प्रजाती समृद्धता क्लस्टरिंग32. केईजीजी चयापचय मार्गांवर भाष्य केलेले कार्यात्मक जीन्स43. प्रजाती सहसंबंध नेटवर्क54. CARD प्रतिजैविक प्रतिरोधक जनुकांचे सर्कोस
    6

    बीएमके केस

    नॅनोपोर मेटाजेनोमिक्स जीवाणूंच्या खालच्या श्वसनमार्गाच्या संसर्गाचे जलद क्लिनिकल निदान करण्यास सक्षम करते

    प्रकाशित:नेचर बायोटेक्नॉलॉजी, 2019

    तांत्रिक ठळक मुद्दे
    अनुक्रम: नॅनोपोर मिनियन
    क्लिनिकल मेटाजेनोमिक्स बायोइन्फॉर्मेटिक्स: होस्ट डीएनए कमी होणे, WIMP आणि ARMA विश्लेषण
    जलद शोध: 6 तास
    उच्च संवेदनशीलता: 96.6%

    मुख्य परिणाम

    2006 मध्ये, लोअर रेस्पीरेटरी इन्फेक्शन (LR) ने जागतिक स्तरावर 3 दशलक्ष लोकांचा मृत्यू झाला.LR1 रोगजनक शोधण्याची विशिष्ट पद्धत म्हणजे लागवड करणे, ज्यामध्ये संवेदनशीलता कमी असते, दीर्घकाळ वळणे असते आणि लवकर प्रतिजैविक थेरपीमध्ये मार्गदर्शनाचा अभाव असतो.जलद आणि अचूक सूक्ष्मजीव निदान ही फार पूर्वीपासून तातडीची गरज आहे.पूर्व अँग्लिया विद्यापीठातील डॉ. जस्टिन आणि त्यांच्या भागीदारांनी रोगजनक शोधण्यासाठी नॅनोपोर-आधारित मेटाजेनोमिक पद्धत यशस्वीरित्या विकसित केली.त्यांच्या वर्कफ्लोनुसार, 99.99% होस्ट डीएनए कमी होऊ शकतो.रोगजनक आणि प्रतिजैविक प्रतिरोधक जनुकांचा शोध 6 तासांत पूर्ण केला जाऊ शकतो.

    संदर्भ
    चारलाम्पस, टी., के, जीएल, रिचर्डसन, एच., आयडिन, ए. आणि ओ'ग्रेडी, जे.(२०१९).नॅनोपोर मेटाजेनोमिक्स जीवाणूंच्या खालच्या श्वसनमार्गाच्या संसर्गाचे जलद क्लिनिकल निदान करण्यास सक्षम करते.नेचर बायोटेक्नॉलॉजी, ३७(७), १.

    एक कोट मिळवा

    तुमचा संदेश इथे लिहा आणि आम्हाला पाठवा

    तुमचा संदेश आम्हाला पाठवा: