उत्पादने

*येथे दाखवलेले डेमो परिणाम सर्व बायोमार्कर टेक्नॉलॉजीसह प्रकाशित केलेल्या जीनोमचे आहेत

1.LTR इन्सर्ट वेळेचा अंदाज: इतर प्रजातींच्या तुलनेत वेनिंग राई जीनोममध्ये LTR-RTs घालण्याच्या वेळेत एक अद्वितीय बिमोडल वितरण दर्शविलेले आकृती.सर्वात अलीकडील शिखर सुमारे 0.5 दशलक्ष वर्षांपूर्वी दिसले.

ली गुआंग इ.,नेचर जेनेटिक्स, २०२१

2.चायोटे (सेचियम एड्यूल) वरील फायलोजेनी आणि जनुक कुटुंबाचे विश्लेषण : चायोट आणि जनुक कुटुंबातील इतर 13 संबंधित प्रजातींचे विश्लेषण करून, चायोटेचा साप (ट्रायकोसॅन्थेस अँगुइना) शी सर्वात जवळचा संबंध असल्याचे आढळले.27-45 म्‍यामध्‍ये सापाच्या गोळ्यापासून बनवलेले चायोटे आणि संपूर्ण जीनोम डुप्‍लिकेशन (WGD) 25±4 म्‍यामध्‍ये चायोटेमध्‍ये आढळून आले, जी कुकुबिटासीमध्‍ये तिसरी डब्ल्यूजीडी घटना आहे.

फू ए इ.,फलोत्पादन संशोधन, २०२१

3.सिंटेनी विश्लेषण: फळांच्या विकासातील फायटोहॉर्मोन्सशी संबंधित काही जनुके चायोटे, नागमोडी आणि स्क्वॅशमध्ये आढळून आली.चायोटे आणि स्क्वॅश यांच्यातील संबंध चायोटे आणि नागमोडी यांच्यातील संबंधांपेक्षा थोडा जास्त आहे.

फू ए इ.,फलोत्पादन संशोधन, २०२१

4.जीन फॅमिली अॅनालिसिस: G.thurberi आणि G.davidsonii जीनोममध्ये जीन फॅमिली विस्तार आणि आकुंचन यावर KEGG संवर्धनाने स्टिरॉइड बायोसिंथेसिस आणि ब्रॅसिनोस्टेरॉइड बायोसिंथेसिस संबंधित जनुकांचा विस्तार केल्याचे दिसून आले.

यांग झेड आणि इतर.,बीएमसी जीवशास्त्र, २०२१

5. संपूर्ण जीनोम डुप्लिकेशन विश्लेषण: 4DTV आणि Ks वितरण विश्लेषण संपूर्ण जीनोम डुप्लिकेशन इव्हेंट दर्शविते.इंट्रास्पीसीजची शिखरे डुप्लिकेशन इव्हेंट दर्शविली आहेत.आंतरप्रजातींची शिखरे स्पेसिएशन इव्हेंट दर्शवितात.विश्लेषणाने असे सूचित केले आहे की इतर तीन जवळच्या प्रजातींशी तुलना करता, ओ. युरोपियाने अलीकडे मोठ्या प्रमाणावर जनुकांची नक्कल केली आहे.

राव जी आणि इतर.,फलोत्पादन संशोधन, २०२१

बीएमके केस

काटेशिवाय गुलाब: ओलावा अनुकूलतेशी संबंधित जीनोमिक अंतर्दृष्टी

प्रकाशित: राष्ट्रीय विज्ञान पुनरावलोकन, २०२१

अनुक्रम धोरण:

'बस्यांचेकाटेरहित' (आर.विचुरैनन) जीनोम:
अंदाजे93 X PacBio + अंदाजे90 X नॅनोपोर + 267 X इलुमिना

मुख्य परिणाम

1.उच्च दर्जाचे R.wichuraiana जीनोम लाँग-रीड सिक्वेन्सिंग तंत्र वापरून तयार केले गेले होते, जे 530.07 Mb चे असेंब्ली देते (अंदाजित जीनोम आकार प्रवाह सायटोमेट्री द्वारे अंदाजे 525.9 Mb आणि जीनोम सर्वेक्षणानुसार 525.5 होता; सुमारे 3% हेटरोजी होती).BUSCO अंदाजे स्कोअर 93.9% होता."ओल्ड ब्लश" (haploOB) शी तुलना करताना, या जीनोमची गुणवत्ता आणि पूर्णता बेस सिंगल-बेस अचूकता आणि LTR असेंबली इंडेक्स (LAI=20.03) द्वारे पुष्टी केली गेली.R.wichuraiana जीनोममध्ये 32,674 प्रोटीन कोडिंग जीन्स आहेत.

2.मल्टी-ओमिक्स संयुक्त विश्लेषण, तुलनात्मक जीनोमिक्स, ट्रान्सक्रिप्टॉमिक्स, अनुवांशिक लोकसंख्येचे QTL विश्लेषण, आर. विचुरायना आणि रोजा चिनेन्सिस यांच्यातील महत्त्वपूर्ण विशिष्टता उघड करते.तसेच, QTL मधील संबंधित जनुकांची अभिव्यक्ती भिन्नता स्टेम प्रिकल पॅटर्निंगशी संबंधित असण्याची शक्यता होती.

सिंटेनी विश्लेषण, जीन फॅमिली क्लस्टर, विस्तार आणि आकुंचन विश्लेषण यासह बासी थॉर्नलेस आणि रोझा चिनेन्सिस यांच्यातील तुलनात्मक जीनोमिक्स विश्लेषणामध्ये मोठ्या प्रमाणात भिन्नता दिसून आली, जी गुलाबांमधील महत्त्वपूर्ण वैशिष्ट्यांशी संबंधित आहेत.NAC आणि FAR1/FRS जनुक कुटुंबातील अनोखा विस्तार काळ्या डागांच्या प्रतिकाराशी संबंधित असण्याची दाट शक्यता होती.

झोंग, एम. , इ."काटेशिवाय गुलाब: ओलावा अनुकूलतेशी संबंधित जीनोमिक अंतर्दृष्टी"राष्ट्रीय विज्ञान पुनरावलोकन, 2021;, nwab092.