条形banner-03

Produk

Sekuensing DNA/RNA – Sekuensing Nanopore

Sekuensing ONT nyaéta téknologi sekuensing sinyal listrik real-time molekul tunggal dumasar kana nanopori, prinsip sekuensing unggal platform sami. DNA/RNA untaian ganda bakal ngabeungkeut kana protéin nanopori anu dipasang dina biofilm sareng ngaleupaskeun handapeun kalungguhan protéin motor, dina aksi bédana tegangan ti dua sisi biofilm, untaian DNA/RNA ngaliwat protéin saluran nanopori dina laju anu tangtu. Kusabab bédana sipat kimia tina basa anu béda dina untaian DNA/RNA, nalika hiji basa atanapi molekul DNA ngaliwat saluran nanopori, éta bakal nyababkeun parobahan sinyal listrik anu béda. Ku cara ngadeteksi sareng saluyu sareng sinyal ieu, jinis basa anu saluyu tiasa diitung, sareng deteksi real-time tina runtuyan tiasa réngsé.


Rincian Layanan

Hasil Démo

Fitur Rincian Layanan

Platform

Ukuran Perpustakaan

Hasil Data Téoritis (Per Sél)

Akurasi Dasar Tunggal

Aplikasi

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90Gb/Sél

85-92%

Panggero SV, De novo, Sekuensing lengkep, Iso-Seq, Anotasi gén, Deteksi metilasi DNA

Kauntungan Layanan

● Pangalaman langkung ti 5 taun dina platform sekuensing PacBio sareng rébuan proyék tertutup kalayan rupa-rupa spésiés.
● BMKGENE nyaéta mitra resmi Oxford Nanopore, kalayan sertifikasi RNA/DNA platform ganda.
● Aya modél sequencer umum anu dilengkepan ku alat anu lengkep sareng throughput sequencing anu cekap.
● Dumasar kana platform Nanopore, langkung ti 10 panilitian Denovo ngeunaan sasatoan sareng pepelakan parantos diterbitkeun dina jurnal anu kasohor sacara internasional.

Sarat Conto


Jenis Sampel

Jumlah

Konséntrasi (Qubit ®)

Volume

Kamurnian

Anu sanésna

DNA génomik

Gumantung kana Sarat Data

 ≥20ng/µl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

Puncak anu jelas dina 260 nm, teu aya kontaminasi

Konsentrasi perlu diukur ku Qubit sareng Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA total

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; teu aya kontaminasi

Nilai RIN ≥7.5

 

Alur Kerja Layanan

persiapan sampel

Persiapan sampel

Persiapan Perpustakaan

Pangwangunan perpustakaan

Urutan

Urutan

Analisis data

Analisis data

QC conto

Pangiriman proyék


  • Saméméhna:
  • Teras:

  • Penilaian Kualitas Data Sampel DNA

    Tabel 1. Statistik ngeunaan data anu bersih.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    cleanN50Len

    cleanN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25.90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Penilaian Kualitas Data Sampel RNA

    Tabel 1. Statistik ngeunaan data anu bersih.

    Nami file

    ID Klien

    MacaNumber

    BaseNumber

    N50

    Panjang Rata-rata

    Panjang Maks

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Gambar 1. Sebaran panjang baca

    A3

    Gambar 2. Distribusi skor kualitas data bersih

    A4

    Gambar 3. Distribusi skor panjang sareng kualitas data anu bersih

    A5

    kéngingkeun kutipan

    Tulis pesen anjeun di dieu sareng kirimkeun ka kami

    Kirimkeun pesen anjeun ka kami: