DNA/RNA Sequencing – Nanopore Sequencer

Sequencing ONT mangrupikeun molekul tunggal téknologi pangurutan sinyal listrik sacara real-time dumasar kana nanopores, prinsip pangurutan unggal platform sami.Ganda-stranded DNA / RNA bakal ngabeungkeut protéin nanoporous study dina biofilm jeung unwinding handapeun kalungguhan protéin motor, dina aksi béda tegangan ti dua sisi biofilm nu, untaian DNA / RNA ngaliwatan protéin channel nanopore dina tangtu. meunteun.Kusabab bédana sipat kimia basa béda dina untaian DNA / RNA, nalika basa tunggal atawa molekul DNA ngaliwatan saluran nanopore, éta bakal ngabalukarkeun parobahan sinyal listrik béda.Ku ngadeteksi sareng pakait sareng sinyal-sinyal ieu, jinis dasar anu cocog tiasa diitung, sareng deteksi sacara real-time tina sekuen tiasa réngsé.

Taros Kami

Rincian Service

Hasil demo

Fitur Rincian Service

Platform	Ukuran Perpustakaan	Ngahasilkeun Data Téoritis (Per Sél)	Akurasi dasar tunggal	Aplikasi
Nanoporé	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/Sél	85-92%	SV nelepon, De novo, Full-panjangna sequencing, Iso-Seq, annotation gén, Detéksi métilasi DNA

Kaunggulan Service

● Leuwih 5 taun pangalaman dina platform sequencing PacBio kalawan rébuan proyék katutup jeung sagala rupa spésiés.
● BMKGENE mangrupa pasangan resmi Oxford Nanopore, kalawan dual platform RNA / sertifikasi DNA.
● Aya model mainstream of sequencers kalawan parabot lengkep sareng throughput sequencing cukup.
● Dumasar kana platform Nanopore, leuwih ti 10 sato jeung tutuwuhan Denovo researches geus diterbitkeun dina jurnal internasional renowned.

Sarat Sampel

Tipe Sampel

Jumlah

Konsentrasi (Qubit ®)

Jilid

Kasucian

Lain

DNA génomik

Gumantung kana Sarat Data

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.2;

OD260/230≥1.5；

Puncak jelas dina 260 nm, euweuh kontaminasi

Konsentrasi kedah diukur ku Qubit sareng Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA total

≥1,2 μg

≥100 μg / μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.5;

OD260/230 = 0.5-2.5; euweuh kontaminasi

nilai RIN ≥7.5

Alur Palayanan

Persiapan sampel

Pangwangunan perpustakaan

Sequencing

Analisis data

Pangiriman proyék

saméméhna: DNA/RNA Sequencing – Illumina Sequencer

Teras: Spésifik-Locus Amplified Fragmén Sequencing (SLAF-Seq)

Penilaian Kualitas Data Sampel DNA

meja 1. Statistik dina data bersih.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	bersihN50Len	cleanN90Len	bersihMeanLen	beresihMaxLen	bersihMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25.90	28.014	15.764	23.090	143.181	9