-
Analisis Asosiasi Génom-lega
Studi asosiasi genom-lebar (GWAS) tujuanana pikeun ngaidentipikasi varian genetik (genotip) anu aya hubunganana sareng sipat khusus (fenotip).Ulikan GWAS nalungtik spidol genetik meuntas genom sajumlah ageung individu sareng ngaramal asosiasi genotip-fenotip ku analisa statistik dina tingkat populasi.Geus loba dilarapkeun dina panalungtikan ngeunaan kasakit manusa jeung pertambangan gén fungsional dina sipat kompléks sato atawa tutuwuhan.
-
Sequencing RNA inti tunggal
Kamajuan dina néwak sél tunggal sareng téknik konstruksi perpustakaan individu digabungkeun sareng urutan throughput tinggi ngamungkinkeun studi éksprési gén dina dasar sél-demi-sél.Éta ngamungkinkeun analisa sistem anu langkung jero sareng lengkep dina populasi sél kompléks, dimana éta umumna ngahindarkeun masking heterogénitasna ku cara nyandak rata-rata sadaya sél.
Sanajan kitu, sababaraha sél henteu cocog pikeun dijadikeun suspénsi sél tunggal, jadi métode persiapan sampel séjén - ékstraksi inti tina jaringan diperlukeun, nyaeta, inti langsung sasari tina jaringan atawa sél jeung disiapkeun kana gantung-inti tunggal pikeun single- runtuyan sél.
BMK nyadiakeun 10 × Genomics Chromium TM dumasar jasa sequencing RNA sél tunggal.Ladenan ieu seueur dianggo dina studi ngeunaan studi anu aya hubunganana sareng panyakit, sapertos diferensiasi sél imun, heterogenitas tumor, pangembangan jaringan, jsb.
Chip transcriptome spasial: 10 × Genomics
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Tutuwuhan / Sasatoan sakabeh Génom Sequencing
Urutan ulang génom sakabeh, ogé katelah WGS, ngamungkinkeun pikeun nembongkeun mutasi umum jeung langka dina sakabéh génom kaasup Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure Variation (SV), jeung Copy Number Variation (CNV). ).SV ngabentuk bagian gedé tina basa variasi ti SNPs sarta boga dampak gede dina génom, nu boga pangaruh signifikan dina organisme hirup.Resequencing lila-dibaca ngamungkinkeun pikeun idéntifikasi leuwih tepat fragmen badag sarta variasi pajeulit sabab maca panjang ngajadikeun leuwih gampang kromosom nyebrang ngaliwatan wewengkon pajeulit kayaning ulang tandem, GC / AT-euyeub wewengkon, sarta wewengkon hyper-variabel.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Organisasi spasial sél maénkeun peran penting dina sagala rupa prosés biologis, kayaning infiltrasi imun, ngembangkeun embrio, jsb spasial transcriptome sequencing, nu nunjukkeun profil ekspresi gén bari nahan informasi posisi spasial, geus nyadiakeun wawasan hébat kana arsitektur jaringan transcriptome-tingkat.Kalayan kamajuan téknologi, morfologi jaringan ultra-jelas sareng bédana struktural nyata éksprési molekular spasial kedah ditaliti kalayan résolusi anu langkung luhur.BMKGENE nyadiakeun komprehensif, hiji-eureun layanan transcriptome spasial sequencing tina sampel pikeun wawasan biologis.
Téknologi transcriptomics spasial empowered perspéktif novél dina rupa-rupa arena panalungtikan ku resolving profil ekspresi gén kalawan eusi spasial dina sampel hétérogén.
Chip transcriptome spasial: BMKMANU S1000
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Visium Spatial Gene Expression mangrupikeun téknologi pangurutan transkriptom spasial mainstream pikeun ngagolongkeun jaringan dumasar kana total mRNA.Peta sakabeh transkriptom kalawan konteks morfologis pikeun manggihan wawasan novél kana ngembangkeun normal, Patologi kasakit, sarta panalungtikan translasi klinis.BMKGENE nyadiakeun komprehensif, hiji-eureun layanan transcriptome spasial sequencing tina sampel pikeun wawasan biologis.
Téknologi transkriptomi spasial nguatkeun perspéktif novel dina rupa-rupa aréna panalungtikan ku cara ngabéréskeun profil éksprési gén kalayan eusi spasial dina sampel hétérogén..
Chip transkriptom spasial: 10x Genomics Visium
Platform:Platform Illumina NovaSeq
-
Full-Panjang mRNA Sequencing-Nanopore
Sequencing RNA mangrupikeun alat anu teu ternilai pikeun analisis transkriptom komprehensif.Mamang, sekuen bacaan pondok tradisional ngahontal seueur pangembangan penting di dieu.Tapi, éta sering mendakan watesan dina idéntifikasi isoform panjang, kuantifikasi, bias PCR.
Sequencing nanopore ngabedakeun diri ti platform sequencing séjén, nu nukléotida dibaca langsung tanpa sintésis DNA jeung ngahasilkeun dibaca lila dina puluhan kilobase.Ieu empowers langsung maca-kaluar nyebrang transkrip full-panjangna jeung tackling tantangan dina studi isoform-tingkat.
Platform:Nanopore PromethION
Perpustakaan:cDNA-PCR
-
Runtuyan mRNA panjangna pinuh -PacBio
De novosequencing transcriptome full-panjangna, ogé katelahDe novoIso-Seq nyandak kauntungan tina PacBio sequencer dina panjang dibaca, anu ngamungkinkeun sequencing molekul cDNA full-length tanpa jeda.Ieu lengkep ngahindarkeun sagala kasalahan anu dibangkitkeun dina léngkah-léngkah rakitan transkrip sareng ngawangun set unigene kalayan resolusi tingkat isoform.Set unigene ieu nyayogikeun inpormasi genetik anu kuat salaku "genom rujukan" dina tingkat transkriptom.Sajaba ti éta, ngagabungkeun jeung data urutan generasi saterusna, layanan ieu empowers hiji kuantitas akurat ekspresi isoform-tingkat.
Platform: PacBio Sequel IIPerpustakaan: perpustakaan bel SMRT -
Eukariot mRNA Sequencing-Illumina
Urutan mRNA ngamungkinkeun profil sadaya mRNA anu ditranskrip tina sél dina kaayaan khusus.Téknologi anu kuat pikeun nembongkeun profil ekspresi gen, struktur gén sareng mékanisme molekular tina prosés biologis anu tangtu.Nepi ka ayeuna, sekuen mRNA parantos seueur dianggo dina panalungtikan dasar, diagnostik klinis, pamekaran ubar, jsb.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Non-Referensi dumasar mRNA Sequencing-Illumina
Pangurutan mRNA ngadopsi téknik pangurutan generasi saterusna (NGS) pikeun nangkep RNA (mRNA) utusan tina bentuk Eukariota dina période husus anu diaktipkeun sababaraha fungsi husus.Transkrip pangpanjangna disambung disebut 'Unigene' sarta dipaké salaku runtuyan rujukan pikeun analisis saterusna, nu mangrupakeun sarana éféktif pikeun nalungtik mékanisme molekular jeung jaringan pangaturan spésiés tanpa rujukan.
Saatos assembly data transcriptome sarta annotation fungsi unigene
(1) Analisis SSR, prediksi CDS jeung struktur gén bakal preformed.
(2) Kuantitas éksprési unigén dina unggal sampel bakal dilakukeun.
(3) Unigenes dikedalkeun béda antara sampel (atawa grup) bakal kapanggih dumasar kana ekspresi unigenes.
(4) Klastering, anotasi fungsional sareng analisis pengayaan unigenes anu dikedalkeun sacara béda bakal dilaksanakeun
-
Long non-coding sequencing-Illumina
RNA non-coding panjang (lncRNAs) mangrupikeun jinis molekul RNA anu panjangna langkung ti 200 nt, anu dicirikeun ku poténsi pengkodean anu rendah pisan.LncRNA, salaku anggota konci dina non-coding RNAs, utamana kapanggih dina inti jeung plasma.Kamekaran dina téknologi pangurutan sareng bioinformtik ngamungkinkeun idéntifikasi sababaraha lncRNAs novel sareng ngahubungkeun anu ngagaduhan fungsi biologis.Bukti akumulatif nunjukkeun yén lncRNA loba kalibet dina régulasi épigénétik, régulasi transkripsi sareng régulasi pasca-transkripsi.
-
Leutik RNA sequencing-Illumina
RNA leutik ngarujuk kana kelas molekul RNA non-coding anu panjangna biasana kirang ti 200nt, kalebet RNA mikro (miRNA), RNA interferensi leutik (siRNA), sareng RNA anu berinteraksi piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) nyaéta kelas RNA leutik endogenous kalayan panjang kira-kira 20-24nt, anu maénkeun rupa-rupa peran pangaturan penting dina sél.miRNA aub dina loba prosés kahirupan nu nembongkeun jaringan - spésifik jeung panggung - éksprési husus sarta pohara dilestarikan dina spésiés béda.
-
circRNA sequencing-Illumina
CircRNAs (Circular RNAs) nyaéta salah sahiji kelas molekul RNA non-coding anu pondokna 5′ tutup tungtung sareng 3′ tungtung poli(A) buntut.CircRNAs ngalakukeun struktur sirkular ku beungkeut kovalén nu status ngalawan RNA exonuclease nyerna.circRNA muterkeun hiji peran penting dina tumuwuhna ngembangkeun organisme sarta lalawanan maranéhna pikeun lingkungan éksternal.
CircRNA ngagaduhan seueur fungsi, anu tiasa bersaing sacara kompetitif ngabeungkeut miRNA, ngalaksanakeun fungsi pangaturan ceRNA, pikeun ngatur ekspresi gen.Dina taun anyar, éta ogé geus kapanggih yén éta téh raket patalina jeung lumangsungna sarta ngembangkeun kasakit, sarta boga prospek aplikasi hébat dina arah spidol diagnosis kasakit jeung saterusna.
