mRNA-seq (NGS) kalayan génom rujukan
RNA-seq nyaéta alat standar dina élmu kahirupan sareng pepelakan, anu ngahubungkeun jurang antara génom sareng protéom. Kakuatanana aya dina mendakan transkrip énggal sareng ngitung éksprési na dina hiji uji coba. Éta seueur dianggo pikeun studi transkriptomik komparatif, ngajelaskeun gén anu aya hubunganana sareng rupa-rupa sipat atanapi fenotipe, sapertos ngabandingkeun mutan sareng tipe liar atanapi ngungkabkeun éksprési gén dina kaayaan anu khusus. BMKCloud mRNA (Referensi) APP ngahijikeun kuantifikasi éksprési, analisis éksprési diferensial (DEG), sareng analisis struktur runtuyan kana pipa bioinformatika mRNA-seq (NGS) sareng ngahijikeun kakuatan parangkat lunak anu sami, mastikeun genah sareng ramah-pangguna. Pangguna tiasa unggah data RNA-seq na ka awan, dimana Aplikasi nawiskeun solusi analisis bioinformatik hiji-eureun anu komprehensif. Salaku tambahan, éta ngutamakeun pangalaman palanggan, nawiskeun operasi anu dipersonalisasi anu disaluyukeun pikeun kabutuhan khusus pangguna. Pangguna tiasa nyetél parameter sareng ngalebetkeun misi pipa ku nyalira, mariksa laporan interaktif, ningali data/diagram sareng ngalengkepan panambangan data, sapertos: pamilihan gén target, klaster fungsional, diagram, jsb.
Platform:Illumina, MGI
Strategi:RNA-Seq
Tata letak: Disampurnakeun, data anu bersih.
Jenis perpustakaan:fr-unstranded, fr-firststrand atawa fr-secondstrand
Panjang maca:150 bp
Jenis file:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz atanapi *.fq.gz. Sistemna bakalotomatis masangkeun file .fastq numutkeun nami filena,contona *_1.fastq dipasangkan sareng *._2.fastq.
Jumlah sampel:Teu aya larangan dina jumlahnasampel, tapi waktos analisis bakal ningkat sairing jumlah sampel anusampelna tumuwuh.
Jumlah Data anu Disarankeun:6G per sampel
