Метатранскриптомын дараалал
Үйлчилгээний онцлог
● rRNA-ийн хомсдол, дараа нь чиглэлтэй мРНХ номын сангийн бэлтгэл.
● Illumina NovaSeq дээр дараалал тогтоох.
Үйлчилгээний давуу тал
●Нарийн төвөгтэй бичил биетний бүлгүүдийн өөрчлөлтийг судлах:Энэ нь транскрипцийн түвшинд тохиолддог бөгөөд боломжит шинэ генийг судлах.
●Хүрээлэн буй орчин эсвэл бичил биетний нийгэмлэгийн харилцан үйлчлэлийг тайлбарлах.
●Био-информатикийн цогц шинжилгээ: Энэ нь нийгэмлэгийн ангилал зүй, функциональ найрлага, мөн дифференциал генийн экспрессийн шинжилгээний талаархи ойлголтыг өгдөг.
●Өргөн хүрээний генийн тайлбар:Бичил биетний бүлгүүдийн генийн экспрессийн мэдээлэлд зориулж хамгийн сүүлийн үеийн генийн функцын мэдээллийн санг ашиглах.
●Борлуулалтын дараах дэмжлэг:Бидний амлалт нь төслийн гүйцэтгэлээс давж, борлуулалтын дараах 3 сарын үйлчилгээний хугацаа юм. Энэ хугацаанд бид үр дүнтэй холбоотой аливаа асуултыг шийдвэрлэхийн тулд төслийн хяналт, алдааг олж засварлах, асуулт хариултын сессүүдийг санал болгодог.
Үйлчилгээний үзүүлэлтүүд
| Дараалсан платформ | Дараалал тогтоох стратеги | Өгөгдлийг санал болгож байна | Өгөгдлийн чанарын хяналт |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12 Гб | Q30≥85% |
Загвар шаардлага
| Концентраци (нг/мкл) | Нийт хэмжээ (мкг) | Эзлэхүүн (μL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Үйлчилгээний ажлын урсгал
Дээж хүргэх
Номын сангийн барилга
Дараалал
Өгөгдлийн шинжилгээ
Борлуулалтын дараах үйлчилгээ
Дараах шинжилгээг багтаасан болно.
● Өгөгдлийн чанарын хяналтыг дараалалд оруулах
● Бичлэгийн чуулган
● Таксономын тэмдэглэгээ ба элбэг дэлбэг байдал
● Функциональ тайлбар ба элбэг дэлбэг байдал
● Илэрхийллийн тоо хэмжээ ба дифференциал шинжилгээ
Дээж бүрийн ангилал зүйн тархалт:
Бета олон янз байдлын шинжилгээ: UPGMA
Функциональ тэмдэглэгээ – GO элбэг дэлбэг байдал
Дифференциал ангилал зүйн элбэг дэлбэг байдал – LEFSE
BMKGene-ийн мета транскриптомикийн дэс дарааллын үйлчилгээнд тусгагдсан дэвшлүүдтэй танилцаарай.
Лу, З. нар. (2023) 'Bacteroidales бүлгийн лактат хэрэглэдэг бактерийн хүчилд тэсвэртэй байдал нь өндөр концентрацитай хоолонд дасан зохицсон ямааны хивэгний ацидозоос урьдчилан сэргийлэхэд хувь нэмэр оруулдаг',Амьтны тэжээл, 14, хуудас 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) "Өндөр дамжуулалттай ампликон ба метатранскриптомийн дарааллаар уламжлалт хатуу төлөвт исгэх үндсэн функциональ микробиотыг задлах",Микробиологийн хил хязгаар, 8(7-р сар). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/БҮРЭН.
Ван, В. нар. (2022) "Фитопатоген алтернариа мөөгөнцрийн метатранскриптомийн судалгаагаар олдсон шинэ миковирусууд",Вирусууд, 14(11), х. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) "Зэрэгцээ метатранскриптомын шинжилгээ нь цох хорхойнууд болон тэдгээрийн гэдэсний симбионтоор ургамлын хоёрдогч метаболитыг задалдаг болохыг харуулж байна",Молекул Экологи, 31(15), хуудас 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
