जीनोम-वाइड एसोसिएशन विश्लेषण
कार्यप्रवाह
सेवाका फाइदाहरू
●व्यापक विशेषज्ञता र प्रकाशन रेकर्डहरू: GWAS मा संचित अनुभवको साथ, BMKGene ले जनसंख्या GWAS अनुसन्धानमा सयौं प्रजाति परियोजनाहरू पूरा गरेको छ, अनुसन्धानकर्ताहरूलाई १०० भन्दा बढी लेखहरू प्रकाशित गर्न सहयोग गरेको छ, र संचयी प्रभाव कारक ५०० पुगेको छ।
● व्यापक जैविक सूचना विज्ञान विश्लेषण: कार्यप्रवाहमा SNP-विशेषता संघ विश्लेषण समावेश छ, उम्मेदवार जीनहरूको सेट र तिनीहरूको सम्बन्धित कार्यात्मक एनोटेसन प्रदान गर्दै।
●उच्च कुशल बायोइन्फर्मेटिक्स टोली र छोटो विश्लेषण चक्र: उन्नत जीनोमिक्स विश्लेषणमा उत्कृष्ट अनुभवको साथ, BMKGene को टोलीले द्रुत टर्नअराउन्ड समयमा व्यापक विश्लेषणहरू प्रदान गर्दछ।
●बिक्री पछिको समर्थन:हाम्रो प्रतिबद्धता परियोजना पूरा हुनुभन्दा बाहिर ३ महिनाको बिक्री पछिको सेवा अवधिको साथ विस्तार हुन्छ। यस समयमा, हामी परिणामहरूसँग सम्बन्धित कुनै पनि प्रश्नहरूलाई सम्बोधन गर्न परियोजना अनुगमन, समस्या निवारण सहायता, र प्रश्नोत्तर सत्रहरू प्रदान गर्दछौं।
सेवा विशिष्टता र आवश्यकताहरू
| अनुक्रमणको प्रकार | सिफारिस गरिएको जनसंख्या मापन | अनुक्रम रणनीति | न्यूक्लियोटाइड आवश्यकताहरू |
| सम्पूर्ण जीनोम अनुक्रमण | २०० नमूनाहरू | १०x | एकाग्रता: ≥ १ एनजी/ µL कुल रकम≥ ३० ङ सीमित वा कुनै क्षय वा प्रदूषण छैन |
| विशिष्ट-लोकस एम्प्लीफाइड फ्र्यागमेन्ट (SLAF) | ट्याग गहिराई: १०x ट्यागहरूको संख्या: ४०० Mb भन्दा कम: WGS सिफारिस गरिन्छ < १ जीबी: १०० हजार ट्यागहरू १ जिबी > २ जीबी: ३०० हजार ट्यागहरू अधिकतम ५०० हजार ट्यागहरू | सांद्रता ≥ ५ एनजी/µलिटर कुल रकम ≥ ८० ङ.ग्रा. नानोड्रप OD260/280=1.6-2.5 एगारोज जेल: कुनै वा सीमित क्षय वा प्रदूषण छैन
|
सामग्री चयन
विभिन्न प्रजातिहरू, उप-प्रजातिहरू, भू-जातिहरू/जीनबैंकहरू/मिश्रित परिवारहरू/वन्य स्रोतहरू
विभिन्न प्रजातिहरू, उप-प्रजातिहरू, भू-जातिहरू
आधा-भाइ परिवार/पूर्ण-भाइ परिवार/वन्य स्रोतहरू
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिजाइन
नमुना डेलिभरी
आरएनए निकासी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
तथ्याङ्क विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
निम्न विश्लेषण समावेश गर्दछ:
- जीनोम-व्यापी संघ विश्लेषण: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM मोडेल
- उम्मेदवार जीनहरूको कार्यात्मक एनोटेसन
SNP-विशेषता संघ विश्लेषण - म्यानहट्टन कथानक
SNP-विशेषता संघ विश्लेषण - QQ प्लट
BMKGene को de GWAS सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरू प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत अन्वेषण गर्नुहोस्:
Lv, L. et al. (२०२३) 'जीनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययनद्वारा रेजर क्ल्याम सिनोनोभाकुला कन्स्ट्रक्टामा अमोनिया सहिष्णुताको आनुवंशिक आधारमा अन्तरदृष्टि',जलचर, ५६९, पृ. ७३९३५१। doi: १०.१०१६/J.AQUACULTURE.२०२३.७३९३५१।
Li, X. et al. (२०२२) '३९८ फक्सटेल बाजरा एक्सेसनहरूको बहु-ओमिक्स विश्लेषणले घरेलुकरण, मेटाबोलाइट विशेषताहरू, र एन्टी-इन्फ्लेमेटरी प्रभावहरूसँग सम्बन्धित जीनोमिक क्षेत्रहरू प्रकट गर्दछ',आणविक प्लान्ट, 15(8), पृ. 1367-1383। doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003।
ली, जे. एट अल. (२०२२) 'सुक्खा वातावरणमा हलेस बरेली फेनोटाइपहरूको जीनोम-वाइड एसोसिएसन म्यापिङ',वनस्पति विज्ञानमा सीमाहरू, १३, पृष्ठ ९२४८९२। doi: १०.३३८९/FPLS.२०२२.९२४८९२/BIBTEX।
झाओ, एक्स. एट अल. (२०२१) 'सल्फोट्रान्सफेरेजलाई एन्कोड गर्ने GmST1 ले सोयाबीन मोज़ेक भाइरस स्ट्रेन G2 र G3 लाई प्रतिरोध प्रदान गर्दछ',वनस्पति, कोष र वातावरण, ४४(८), पृ. २७७७–२७९२। doi: 10.1111/PCE.14066।
