विकासवादी आनुवंशिकी
सेवाका फाइदाहरू
ताकागी आदि,बिरुवा जर्नल, २०१३
●व्यापक जैविक सूचनात्मक विश्लेषण:आनुवंशिक विविधताको अनुमानलाई सक्षम पार्दै, जसले प्रजातिहरूको विकासवादी क्षमतालाई प्रतिबिम्बित गर्दछ, र अभिसरण विकास र समानान्तर विकासको न्यूनतम प्रभाव भएका प्रजातिहरू बीचको भरपर्दो फाइलोजेनेटिक सम्बन्ध प्रकट गर्दछ।
●वैकल्पिक अनुकूलित विश्लेषण: जस्तै न्यूक्लियोटाइड र एमिनो एसिड स्तरमा भिन्नताहरूको आधारमा विचलन समय र गतिको अनुमान।
●व्यापक विशेषज्ञता र प्रकाशन रेकर्डहरू: BMKGene ले १५ वर्षभन्दा बढी समयदेखि जनसंख्या र विकासवादी आनुवंशिकी परियोजनाहरूमा ठूलो अनुभव जम्मा गरेको छ, जसले हजारौं प्रजातिहरू, आदिलाई समेट्छ र नेचर कम्युनिकेसन्स, आणविक प्लान्टहरू, प्लान्ट बायोटेक्नोलोजी जर्नल, आदिमा प्रकाशित १००० भन्दा बढी उच्च-स्तरीय परियोजनाहरूमा योगदान पुर्याएको छ।
● उच्च कुशल बायोइन्फर्मेटिक्स टोली र छोटो विश्लेषण चक्र: उन्नत जीनोमिक्स विश्लेषणमा उत्कृष्ट अनुभवको साथ, BMKGene को टोलीले द्रुत टर्नअराउन्ड समयमा व्यापक विश्लेषणहरू प्रदान गर्दछ।
● बिक्री पछिको समर्थन:हाम्रो प्रतिबद्धता परियोजना पूरा हुनुभन्दा बाहिर ३ महिनाको बिक्री पछिको सेवा अवधिको साथ विस्तार हुन्छ। यस समयमा, हामी परिणामहरूसँग सम्बन्धित कुनै पनि प्रश्नहरूलाई सम्बोधन गर्न परियोजना अनुगमन, समस्या निवारण सहायता, र प्रश्नोत्तर सत्रहरू प्रदान गर्दछौं।
सेवा निर्दिष्टीकरण र आवश्यकताहरू
| अनुक्रमणको प्रकार | सिफारिस गरिएको जनसंख्या मापन | अनुक्रम रणनीति | न्यूक्लियोटाइड आवश्यकताहरू |
| सम्पूर्ण जीनोम अनुक्रमण | ≥ ३० जना, प्रत्येक उपसमूहबाट ≥ १० जना
| १०x | एकाग्रता: ≥ १ एनजी/ µL कुल रकम≥ ३० ङ सीमित वा कुनै क्षय वा प्रदूषण छैन |
| विशिष्ट-लोकस एम्प्लीफाइड फ्र्यागमेन्ट (SLAF) | ट्यागको गहिराइ: १०x ट्यागहरूको संख्या: <४०० Mb: WGS सिफारिस गरिन्छ <१Gb: १००K ट्यागहरू १ जिबी >२ जीबी: ३०० हजार ट्यागहरू अधिकतम ५०० हजार ट्यागहरू | सांद्रता ≥ ५ एनजी/µलिटर कुल रकम ≥ ८० ङ.ग्रा. नानोड्रप OD260/280=1.6-2.5 एगारोज जेल: कुनै वा सीमित क्षय वा प्रदूषण छैन
|
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिजाइन
नमुना डेलिभरी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
तथ्याङ्क विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
सेवामा जनसंख्या संरचनाको विश्लेषण (फाइलोजेनेटिक ट्री, पीसीए, जनसंख्या स्तरीकरण चार्ट), जनसंख्या विविधता, र जनसंख्या चयन (लिङ्केज असन्तुलन, लाभदायक स्थलहरूको चयनात्मक स्वीप-चयन) समावेश छ। सेवामा अनुकूलित विश्लेषण (जस्तै विचलन समय, जीन प्रवाह) पनि समावेश गर्न सकिन्छ।
*यहाँ देखाइएका डेमो नतिजाहरू सबै BMKGENE सँग प्रकाशित जीनोमहरूबाट हुन्।
१. विकास विश्लेषणमा आनुवंशिक भिन्नताहरूमा आधारित फाइलोजेनेटिक रूख, जनसंख्या संरचना र PCA को निर्माण समावेश छ।
फाइलोजेनेटिक रूखले साझा पुर्खा भएका प्रजातिहरू बीच वर्गीकरण र विकासवादी सम्बन्धलाई प्रतिनिधित्व गर्दछ।
PCA ले उप-जनसंख्या बीचको निकटताको कल्पना गर्ने लक्ष्य राख्छ।
जनसंख्या संरचनाले एलिल फ्रिक्वेन्सीको हिसाबले आनुवंशिक रूपमा भिन्न उप-जनसंख्याको उपस्थिति देखाउँछ।
चेन, आदि,पीएनएएस, २०२०
२. छनौट स्वीप
छनौट स्वीप भन्नाले एउटा प्रक्रियालाई बुझाउँछ जसद्वारा लाभदायक साइट चयन गरिन्छ र लिङ्क गरिएका तटस्थ साइटहरूको आवृत्ति बढाइन्छ र अनलिङ्क गरिएका साइटहरूको आवृत्ति घटाइन्छ, जसले गर्दा क्षेत्रीय घट्छ।
चयनात्मक स्वीप क्षेत्रहरूमा जीनोम-व्यापी पत्ता लगाउने प्रक्रिया निश्चित चरण (१० Kb) मा स्लाइडिङ विन्डो (१०० Kb) भित्र सबै SNP हरूको जनसंख्या आनुवंशिक सूचकांक (π, Fst, ताजिमाको D) गणना गरेर प्रशोधन गरिन्छ।
न्यूक्लियोटाइड विविधता (π)
ताजिमाको डी
फिक्सेसन इन्डेक्स (Fst)
वू, आदि,आणविक प्लान्ट, २०१८
३.जीन प्रवाह
वू, आदि,आणविक प्लान्ट, २०१८
४. जनसांख्यिकीय इतिहास
झाङ, आदि,प्रकृति पारिस्थितिकी र विकास, २०२१
५. भिन्नता समय
झाङ, आदि,प्रकृति पारिस्थितिकी र विकास, २०२१
प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत BMKGene को विकासवादी आनुवंशिकी सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरूको अन्वेषण गर्नुहोस्:
हसन्यार, एके एट अल। (२०२३) 'होल-जीनोम रिसिक्वेन्सिङद्वारा एपिस सेराना सेराना लार्भामा स्याकब्रुड भाइरस प्रतिरोधसँग सम्बन्धित SNP आणविक मार्करहरू र उम्मेदवार जीनहरूको खोज',आणविक विज्ञानको अन्तर्राष्ट्रिय जर्नल, २४(७)। doi: 10.3390/IJMS24076238।
चाई, जे. एट अल. (२०२२) 'जंगली, आनुवंशिक रूपमा शुद्ध चिनियाँ विशाल स्यालामेन्डरको खोजले नयाँ संरक्षण अवसरहरू सिर्जना गर्दछ',प्राणी अनुसन्धान, २०२२, खण्ड ४३, अंक ३, पृष्ठहरू: ४६९-४८०, ४३(३), पृष्ठ ४६९–४८०। doi: १०.२४२७२/J.ISSN.२०९५-८१३७.२०२२.१०१।
हान, एम. एट अल. (२०२२) 'किङघाई-तिब्बती पठारमा आदिवासी एलिमस सिबिरिकस एल. को फिलोजोग्राफिकल ढाँचा र जनसंख्या विकास इतिहास',वनस्पति विज्ञानमा सीमाहरू, १३, पृ. ८८२६०१। doi: १०.३३८९/FPLS.२०२२.८८२६०१/BIBTEX।
वाङ, जे. एट अल. (२०२२) 'क्रोमोजोम-स्तरको जीनोम एसेम्बलीबाट लोङ्गान विकासमा जीनोमिक अन्तर्दृष्टि र लोङ्गान एक्सेसनको जनसंख्या जीनोमिक्स',बागवानी अनुसन्धान, ९. डोइ: १०.१०९३/एचआर/यूएचएसी०२१।
