उत्पादनहरू

*यहाँ देखाइएका डेमो परिणामहरू सबै BMKGENE सँग प्रकाशित जीनोमहरूका हुन्

1. इभोलुसन विश्लेषणले आनुवंशिक भिन्नताहरूमा आधारित फाइलोजेनेटिक रूख, जनसंख्या संरचना र PCA को निर्माण समावेश गर्दछ।

फाइलोजेनेटिक रूखले सामान्य पुर्खाको साथ प्रजातिहरू बीच वर्गीकरण र विकास सम्बन्धलाई प्रतिनिधित्व गर्दछ।
PCA ले उप-जनसंख्याहरू बीचको निकटताको कल्पना गर्ने लक्ष्य राख्छ।
जनसंख्या संरचनाले एलेल फ्रिक्वेन्सीको सन्दर्भमा आनुवंशिक रूपमा फरक उप-जनसंख्याको उपस्थिति देखाउँछ।

चेन, आदि।al.,PNAS, २०२०

2. चयनात्मक स्वीप

चयनात्मक स्वीपले एक प्रक्रियालाई बुझाउँछ जसद्वारा एक लाभदायक साइट चयन गरिन्छ र लिङ्क गरिएका तटस्थ साइटहरूको फ्रिक्वेन्सी बढाइन्छ र अनलिङ्क गरिएका साइटहरूको कमी हुन्छ, परिणामस्वरूप क्षेत्रीय घटाइन्छ।

चयनात्मक स्वीप क्षेत्रहरूमा जीनोम-वाइड पत्ता लगाउने कार्य निश्चित चरण (10 Kb) मा स्लाइडिङ विन्डो (100 Kb) भित्र सबै SNPs को जनसंख्या आनुवंशिक सूचकांक (π，Fst, Tajima's D) गणना गरेर प्रशोधन गरिन्छ।

न्यूक्लियोटाइड विविधता (π)

ताजिमाको डी

फिक्सेशन इन्डेक्स (Fst)

वू, आदि।al.,आणविक बिरुवा, 2018

3. जीन प्रवाह

वू, आदि।al.,आणविक बिरुवा, 2018

4. जनसांख्यिकीय इतिहास

झाङ, आदि।al.,प्रकृति पारिस्थितिकी र विकास, २०२१

5. विचलन समय

झाङ, आदि।al.,प्रकृति पारिस्थितिकी र विकास, २०२१

BMK केस

जीनोमिक भिन्नता नक्साले वसन्त चाइनिज क्याबेज (ब्रासिका रापा एसएसपी पेकिनेन्सिस) चयनको आनुवंशिक आधारमा अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दछ।

प्रकाशित: आणविक बिरुवा, 2018

अनुक्रम रणनीति:

अनुकरण: अनुक्रम गहिराई: 10 ×

प्रमुख परिणामहरू

यस अध्ययनमा, 10× को औसत गहिराईको साथ पुन: अनुक्रमणिका लागि 194 चिनियाँ बन्दाबीहरू प्रशोधन गरिएको थियो, जसले 1,208,499 SNPs र 416,070 InDels उत्पादन गर्यो।यी 194 रेखाहरूमा फाइलोजेनेटिक विश्लेषणले देखाएको छ कि यी रेखाहरूलाई तीन इकोटाइप, वसन्त, गर्मी र शरदमा विभाजित गर्न सकिन्छ।थप रूपमा, जनसंख्या संरचना र PCA विश्लेषणले संकेत गर्यो कि वसन्त चिनियाँ बन्दागोभी चीनको शान्डोङमा शरद बन्दाकोबीबाट उत्पन्न भएको थियो।यी पछि कोरिया र जापानमा परिचय गराइयो, स्थानीय रेखाहरूसँग पार गरियो र ती मध्ये केही ढिलो-बोल्टिङ प्रजातिहरू चीनमा फिर्ता पेश गरियो र अन्ततः वसन्त चिनियाँ बन्दागोभी भयो।

चयनमा वसन्त चिनियाँ बन्दागोभी र शरद बन्दाबीहरूमा जीनोम-वाइड स्क्यानिङले 23 जीनोमिक लोकीहरू पत्ता लगाए जुन बलियो चयनबाट गुज्रिएको थियो, जसमध्ये दुई QTL- म्यापिङमा आधारित बोल्टिङ-समय नियन्त्रण क्षेत्रसँग ओभरल्याप गरिएको थियो।यी दुई क्षेत्रहरूमा फूल फुल्ने, BrVIN3.1 र BrFLC1 को नियमन गर्ने प्रमुख जीनहरू पाइयो।यी दुई जीनहरू ट्रान्सक्रिप्टोम अध्ययन र ट्रान्सजेनिक प्रयोगहरूद्वारा बोल्टिङ टाइममा संलग्न भएको पुष्टि भयो।

चिनियाँ गोभीमा जनसंख्या संरचना विश्लेषण

चिनियाँ गोभी चयनमा आनुवंशिक जानकारी