डे नोवो ब्याक्टेरियल जीनोम असेंबली
हामी पूर्ण ब्याक्टेरियल जीनोम एसेम्बली सेवा प्रदान गर्छौं, जसले ० ग्यापको ग्यारेन्टी दिन्छ। यो लामो-पढ्ने सिक्वेन्सिङ प्रविधिहरू, जस्तै नानोपोर र प्याकबायोलाई एसेम्बलीको लागि र छोटो-पढ्ने सिक्वेन्सिङलाई ONT रिडहरूको एसेम्बली प्रमाणीकरण र त्रुटि सुधारको लागि इलुमिनासँग एकीकृत गरेर सम्भव छ। हाम्रो सेवाले विशिष्ट अनुसन्धान लक्ष्यहरू पूरा गर्दै एसेम्बली, कार्यात्मक एनोटेसन, र उन्नत बायोइन्फर्मेटिक विश्लेषणबाट पूर्ण बायोइन्फर्मेटिक कार्यप्रवाह प्रदान गर्दछ। यो सेवाले विभिन्न आनुवंशिक र जीनोमिक अध्ययनहरूको लागि सटीक सन्दर्भ जीनोमहरूको विकासलाई सक्षम बनाउँछ। थप रूपमा, यसले स्ट्रेन अप्टिमाइजेसन, आनुवंशिक इन्जिनियरिङ, र माइक्रोबियल टेक्नोलोजी विकास जस्ता अनुप्रयोगहरूको लागि आधार बनाउँछ, वैज्ञानिक अन्तर्दृष्टि र जैवप्रविधिक नवप्रवर्तनलाई अगाडि बढाउनको लागि महत्त्वपूर्ण भरपर्दो र खाली-मुक्त जीनोमिक डेटा सुनिश्चित गर्दछ।
सेवा सुविधाहरू
● जीनोम पूर्णताको इच्छित डिग्रीको आधारमा छनौट गर्न दुई सम्भावित विकल्पहरू सहित।
● ड्राफ्ट जीनोम विकल्प: Illumina NovaSeq PE150 सँग छोटो-पढ्ने अनुक्रमण।
● ० ग्याप जीनोम पूरा गर्नुहोस्।
● जीनोम एसेम्बलीको लागि Nanopore PromethION 48 वा PacBio Revio मा लामो-पढिएको अनुक्रमण।
● जीनोम प्रमाणीकरण र त्रुटि सुधार (न्यानोपोर) को लागि वा ड्राफ्ट जीनोम उत्पन्न गर्न Illumina NovaSeq मा छोटो-पढ्ने अनुक्रमण।
सेवाका फाइदाहरू
●शून्य-ग्याप जीनोमको ग्यारेन्टी: यो लामो पठन अनुक्रमण (नानोपोर वा प्याकबायो) सँग इलुमिना अनुक्रमणको एकीकरणको कारणले हो।
●पूर्ण बायोइन्फर्मेटिक्स कार्यप्रवाह:यसमा जीनोम एसेम्बली र धेरै जीनोमिक तत्वहरूको भविष्यवाणी, कार्यात्मक जीन एनोटेसन, र सर्कस प्लट जस्ता जीनोम दृश्यावलोकनहरू समावेश छन्।
●व्यापक विशेषज्ञता: २०,००० भन्दा बढी माइक्रोबियल जीनोमहरू भेला भएको, BMKGENE ले एक दशक भन्दा बढीको अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टोली, व्यापक सामग्री, र उत्कृष्ट बिक्री पछि समर्थन ल्याउँछ।
●बिक्री पछिको समर्थन:हाम्रो प्रतिबद्धता परियोजना पूरा हुनुभन्दा बाहिर ३ महिनाको बिक्री पछिको सेवा अवधिको साथ विस्तार हुन्छ। यस समयमा, हामी परिणामहरूसँग सम्बन्धित कुनै पनि प्रश्नहरूलाई सम्बोधन गर्न परियोजना अनुगमन, समस्या निवारण सहायता, र प्रश्नोत्तर सत्रहरू प्रदान गर्दछौं।
●धेरै अनुक्रम रणनीतिहरू उपलब्ध छन्:जीनोम पूर्णताको विभिन्न अनुसन्धान लक्ष्यहरू र आवश्यकताहरूको लागि।
सेवा निर्दिष्टीकरणहरू
| सेवा | अनुक्रम रणनीति |
| ड्राफ्ट जीनोम | इलुमिना PE150 100x |
| ० ग्याप जीनोम | नानोपोर १००x + इलुमिना PE१५० १००x Or प्याकबियो हाईफाइ ३०x + इलुमिना PE१५० १००x (वैकल्पिक) |
नमूना आवश्यकताहरू:
| एकाग्रता (ng/µL) | कुल मात्रा (µg) | भोल्युम (µL) | OD260/280 को लागि सोधपुछ पेश गर्नुहोस्, हामी तपाईंलाई 24 घण्टामा सम्पर्क गर्नेछौं। | OD260/230 को लागि सोधपुछ पेश गर्नुहोस्, हामी तपाईंलाई 24 घण्टामा सम्पर्क गर्नेछौं। | |
| प्याकबायो | ≥२० | ≥१.२ | ≥२० | १.७-२.२ | ≥१.० |
| नानोपोर | ≥४० | ≥२ | ≥२० | १.७-२.२ | १.०-३.० |
| इलुमिना | ≥१ | ≥०.०६ | ≥२० | - | - |
· ब्याक्टेरिया: ≥३.५x१०10 कोषहरू
सेवा कार्य प्रवाह
नमुना डेलिभरी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
तथ्याङ्क विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
निम्न विश्लेषण समावेश गर्दछ:
● अनुक्रमण डेटा गुणस्तर नियन्त्रण
● जीनोम असेम्ब्ली
● जीनोम कम्पोनेन्ट विश्लेषण: CDS र बहु जीनोमिक तत्वहरूको भविष्यवाणी
● धेरै सामान्य डाटाबेसहरू (GO, KEGG, आदि) र उन्नत डाटाबेसहरू (CARD, VFDB, आदि) सँग कार्यात्मक एनोटेसन।
● जीनोम दृश्यावलोकन
हामी जीनोमलाई सजिलै पहुँचयोग्य फास्टा ढाँचा र जीनोम एनोटेसन फाइल (gff) मा प्रदान गर्छौं।
जीन एनोटेसन – GO
जीन एनोटेसन - CAZY कार्बोहाइड्रेट
जीनोम दृश्यावलोकन - सर्कस प्लट
BMKGene को ब्याक्टेरिया जीनोम एसेम्बली सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरूको प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत अन्वेषण गर्नुहोस्।
Dai, W. et al. (२०२३) 'स्वस्थ मानव कोलोनबाट अल्सरेटिभ कोलाइटिसको उपचारको लागि सुरक्षित र नयाँ प्रोबायोटिक ब्याक्टेरियाको रूपमा ब्याक्टेरोइड्स युनिफर्मिस F18-22 को खोज',आणविक विज्ञानको अन्तर्राष्ट्रिय जर्नल, २४(१९), पृष्ठ १४६६९। doi: १०.३३९०/IJMS241914669/S1।
काङ, क्यू. एट अल. (२०२१) 'चीनमा वन्यजन्तुबाट ब्लाओएक्सए-१ र ब्लाएनडीएम-१ बोक्ने बहुऔषधि प्रतिरोधी प्रोटियस मिराबिलिस आइसोलेट्स: बढ्दो जनस्वास्थ्य जोखिम',एकीकृत प्राणीशास्त्र, 16(6), pp. 798-809। doi: 10.1111/1749-4877.12510।
वाङ, टीटी एट अल। (२०१७) 'एन्डोफाइट ब्यासिलस फ्लेक्सस केएलबीएमपी ४९४१ को पूर्ण जीनोम अनुक्रमले यसको बिरुवा वृद्धि प्रवर्द्धन संयन्त्र र नुन सहनशीलताको लागि आनुवंशिक आधार प्रकट गर्दछ',जर्नल अफ बायोटेक्नोलोजी, 260, पृ। 38-41। doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001।
वाङ, एक्स. एट अल. (२०२१) 'क्लेब्सिएलाको बहु-प्रतिकृति प्रतिरोध प्लाज्मिडले एन्टिमाइक्रोबियल जीनको व्यापक प्रसार मध्यस्थता गर्दछ',सूक्ष्मजीव विज्ञानमा सीमाहरू, १२, पृ। 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX।
