१६S/१८S/ITS एम्पलिकन सिक्वेन्सिङ-प्याकबायो
सेवा सुविधाहरू
● अनुक्रमण प्लेटफर्म: PacBio Revio
● अनुक्रम मोड: CCS (HiFi पढाइ)
● HiFi SMRT बेल लाइब्रेरी तयारी गर्नु अघि लक्षित क्षेत्रको प्रवर्धन र त्यसपछि एम्पलिकनहरूको ट्यान्डम लिङ्किङ।
सेवाका फाइदाहरू
●उच्च वर्गीकरण रिजोल्युसन: Tहान सर्ट-एम्प्लिकन अनुक्रमण,प्रजाति स्तरमा उच्च OTU वर्गीकरण दरहरू सक्षम पार्दै।
●अत्यधिक सटीक आधार कलिङ: PacBio CCS मोड अनुक्रमण (HiFi पढ्छ)।
●आइसोलेसन-मुक्त: वातावरणीय नमूनाहरूमा सूक्ष्मजीव संरचनाको द्रुत पहिचान।
●व्यापक रूपमा लागू हुने: विविध सूक्ष्मजीव समुदाय अध्ययन।
●व्यापक जैविक सूचना विश्लेषण: डाटाबेस, एनोटेसन, OTU/ASV को सन्दर्भमा विविध विश्लेषणहरू सहितको नवीनतम QIIME2 प्याकेज (माइक्रोबियल पारिस्थितिकीमा मात्रात्मक अन्तर्दृष्टि)।
●व्यापक विशेषज्ञता: वार्षिक रूपमा हजारौं एम्प्लिकन सिक्वेन्सिङ परियोजनाहरू सञ्चालन गर्दै, BMKGENE ले एक दशक भन्दा बढीको अनुभव, उच्च कुशल विश्लेषण टोली, व्यापक सामग्री, र उत्कृष्ट बिक्री पछिको समर्थन ल्याउँछ।
सेवा निर्दिष्टीकरणहरू
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | सिफारिस गरिएको डेटा |
| एम्प्लिकन | प्याकबायो रेभियो | १०/३०/५० के ट्यागहरू (CCS) |
नमूना आवश्यकताहरू
| एकाग्रता (ng/µL) | कुल मात्रा (µg) | भोल्युम (µL) |
| ≥५ | ≥०.३ | ≥२० |
सिफारिस गरिएको नमुना डेलिभरी
नमूनाहरूलाई तरल नाइट्रोजनमा ३-४ घण्टाको लागि फ्रिज गर्नुहोस् र तरल नाइट्रोजन वा -८० डिग्रीदेखि लामो समयसम्मको लागि भण्डारण गर्नुहोस्। ड्राई-आइसको साथ नमूना ढुवानी आवश्यक छ।
सेवा कार्य प्रवाह
नमुना डेलिभरी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
तथ्याङ्क विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
निम्न विश्लेषण समावेश गर्दछ:
● कच्चा डेटा गुणस्तर नियन्त्रण
● OTU क्लस्टरिङ/डि-नोइज (ASV)
● OTU एनोटेसन
● अल्फा विविधता विश्लेषण: श्यानन, सिम्पसन र ACE सहित धेरै अनुक्रमणिकाहरू।
● बीटा विविधता विश्लेषण
● अन्तर-समूह विश्लेषण
● सहसम्बन्ध विश्लेषण: वातावरणीय कारकहरू र OUT संरचना र विविधता बीच
● १६S कार्यात्मक जीन भविष्यवाणी
वर्गीकरण वितरणको हिस्टोग्राम
सामुदायिक वितरण फाइलोजेनेटिक रूख
अल्फा विविधता विश्लेषण: ACE
अनुक्रमणिका
बीटा विविधता विश्लेषण: PCoA
अन्तरसमूह विश्लेषण: ANOVA
प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत PacBio सँग BMKGene को एम्प्लिकन सिक्वेन्सिङ सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरूको अन्वेषण गर्नुहोस्।
गाओ, एक्स. र वाङ, एच. (२०२३) 'अल्पाइन मेडोमा दुई बढ्दो चरणहरू भएका अल्पाइन मेरिनो भेडाहरूमा विभिन्न फेनोलोजी (रेग्रीन बनाम घाँसे) मा अनुकूलनको क्रममा रुमेन ब्याक्टेरिया प्रोफाइल र कार्यहरूको तुलनात्मक विश्लेषण', किण्वन, ९(१), पृष्ठ १६। doi: १०.३३९०/FERMENTATION9010016/S1।
Li, S. et al. (२०२३) 'कल्चरोमिक्स-आधारित मेटाजेनोमिक्स र उच्च-रिजोल्युसन विश्लेषण प्रयोग गरेर मरुभूमिको माटोमा सूक्ष्मजीव डार्क म्याटर क्याप्चर गर्ने', npj बायोफिल्म्स एण्ड माइक्रोबायोम्स २०२३ ९:१, ९(१), पृ. १–१४। doi: १०.१०३८/s४१५२२-०२३-००४३९-८।
मु, एल. एट अल. (२०२२) 'अल्फल्फा, धानको पराल र गहुँको चोकरबाट तयार पारिएको मिश्रित साइलेजको किण्वन विशेषताहरू, ब्याक्टेरियाको विविधता र एरोबिक स्थिरतामा फ्याटी एसिड लवणको प्रभाव', जर्नल अफ द साइन्स अफ फूड एण्ड एग्रीकल्चर, १०२(४), पृ. १४७५–१४८७। doi: १०.१००२/JSFA.११४८२।
याङ, जे. एट अल. (२०२३) 'वयस्क जेब्राफिसमा अक्साजोलोन-प्रेरित आन्द्राको अक्सिडेटिभ तनावमा सोनचस ब्राचियोटस डीसीबाट निकालिएको एन्टिअक्सिडेन्ट प्रभावमा अक्सिडेटिभ स्ट्रेस बायोमार्करहरू र आन्द्राको माइक्रोबायोटा बीचको अन्तरक्रिया', एन्टिअक्सिडेन्ट २०२३, खण्ड १२, पृष्ठ १९२, १२(१), पृष्ठ १९२। doi: १०.३३९०/ANTIOX१२०१०१९२।
