उच्च थ्रुपुट सिक्वेन्सिङ (ATAC-seq) सहितको ट्रान्सपोसेज-एक्सेसिबल क्रोमेटिनको लागि परख
सेवा सुविधाहरू
● सेवाको लागि DNA-प्रोटिन अन्तरक्रियाहरू सुरक्षित गर्न निकालिएको न्यूक्लिक एसिडको सट्टा तन्तु नमूनाहरू आवश्यक पर्दछ।
● ATAC विधिमा तन्तु पृथक्करण, त्यसपछि केन्द्रक पृथक्करण, Tn5 उपचार र शुद्धीकरण, PCR प्रवर्धन, आकार चयन र अनुक्रमण समावेश छ।
● इलुमिना नोभासेकमा अनुक्रमण
सेवाका फाइदाहरू
●उच्च संवेदनशीलता:पुस्तकालय तयारी र अनुक्रमणको लागि कम सुरुवाती सेल मात्रा पर्याप्त छ।
●अत्यधिक जानकारीमूलक प्रविधि: खुला क्रोमेटिन र ट्रान्सक्रिप्शन कारक बाइन्डिङ साइटहरू जस्ता सक्रिय नियामक तत्वहरूको जीनोमिक स्थानहरू एकै साथ प्रकट गर्दछ।
●राम्रो प्रयोगात्मक प्रजनन क्षमता: प्राविधिक प्रतिकृतिहरूले उत्कृष्ट दोहोरिने क्षमता देखाउँछन्।
●व्यापक विशेषज्ञता: सयौं ATAC सिक्वेन्सिङ परियोजनाहरू सफलतापूर्वक सम्पन्न भएपछि, BMKGENE ले एक दशकभन्दा बढीको अनुभव, उच्च कुशल विश्लेषण टोली, व्यापक सामग्री, र उत्कृष्ट बिक्री पछिको समर्थन ल्याउँछ।
●ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स विश्लेषणमा सामेल हुने सम्भावना: RNA-seq जस्ता अन्य ओमिक्स डेटासँग ATAC seq को एकीकृत विश्लेषणको लागि अनुमति दिँदै।
● व्यापक जैविक सूचना विश्लेषण: क्रोमेटिनको खुला क्षेत्रहरू र तिनीहरूको सम्बन्धित कार्यक्षमता (प्रवर्द्धकहरू, UTs, एक्सनहरू, इन्ट्रोनहरू) को पहिचान मात्र होइन तर नमूनाहरू बीच क्रोमेटिन खुला क्षेत्रहरू बीचको भिन्नताहरूको विश्लेषण पनि सक्षम पार्दै।
सेवा निर्दिष्टीकरणहरू
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | सिफारिस गरिएको डेटा आउटपुट | गुणस्तर नियन्त्रण |
| ATAC-seq | इलुमिना PE150 | > २० मिलियन पठनहरू जीनोम आकारमा निर्भर गर्दै (मानव: ५० एम पढाइ) | Q30≥85% |
नमूना आवश्यकताहरू
नमूना प्रकार: तन्तु, जीवित वा जमेका कोषहरू, रगत
● सेल नम्बर: ≥ १०6कोषहरू
● तन्तुको तौल: ≥ २०० मिलीग्राम ताजा तन्तु
● रगत: ≥ ४ एमएल
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिजाइन
नमुना डेलिभरी
डीएनए निकासी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
तथ्याङ्क विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
निम्न विश्लेषण समावेश गर्दछ:
● कच्चा डेटा गुणस्तर नियन्त्रण;
● सन्दर्भ जीनोमको म्यापिङमा आधारित शिखर कलिङ;
● शिखर स्थानमा जीन एनोटेसन;
● मोटिफ विश्लेषण: ट्रान्सक्रिप्शन फ्याक्टर बाइन्डिङ साइटहरू (TFBS) को पहिचान;
● भिन्न शिखर विश्लेषण र एनोटेसन।
१. ATAC मा रहेको हिटम्यापले TSS र छेउछाउका क्षेत्रहरूमा वितरण पढ्छ (±३ kb)
२. विभिन्न जीनोम घटकहरूमा खुला क्रोमेटिन क्षेत्रको वितरण
३. समूहहरू बीचको भिन्न शिखर कलिङ
BMKGene को ATAC अनुक्रम सेवाहरू द्वारा प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत सहजीकरण गरिएको अनुसन्धान प्रगतिहरूको अन्वेषण गर्नुहोस्।
फु, ए।आदि।(२०२३) 'तीतो खरबुजाको टेलोमेरे-देखि-टेलोमेरे जीनोम एसेम्बली (मोमोर्डिका चरन्टिया एल. प्रकार संक्षिप्त रूप सेर.) ले फलको विकास, संरचना र पाक्ने आनुवंशिक विशेषताहरू प्रकट गर्दछ',बागवानी अनुसन्धान, १०(१)। doi: 10.1093/HR/UHAC228।
गोङ, बि.आदि।(२०२३) 'ग्लियोमामा ओन्कोजीनको रूपमा सेक्रेटरी काइनेज FAM20C को एपिजेनेटिक र ट्रान्सक्रिप्शनल सक्रियता',जेनेटिक्स र जीनोमिक्स जर्नल, ५०(६), पृष्ठ ४२२–४३३। doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008।
उनी, वाई।आदि।(२०२३) 'ब्युटाइरेटले कोलोरेक्टल क्यान्सरमा फेरोप्टोसिस प्रतिरोधलाई उल्ट्याउँछ सी-फोस-निर्भर xCT दमनलाई प्रेरित गरेर',रेडक्स जीवविज्ञान, ६५, पृष्ठ १०२८२२। doi: १०.१०१६/J.REDOX.२०२३.१०२८२२।
