हिटम्याप
हीटम्याप उपकरणले म्याट्रिक्स डेटा फाइललाई इनपुटको रूपमा स्वीकार गर्दछ र प्रयोगकर्ताहरूलाई डेटा फिल्टर, सामान्यीकरण र क्लस्टर गर्न अनुमति दिन्छ। हीटम्यापको लागि प्राथमिक प्रयोग केस विभिन्न नमूनाहरू बीच जीन अभिव्यक्ति स्तरको क्लस्टर विश्लेषण हो।
जीन एनोटेसन
जीन एनोटेसन उपकरणले विभिन्न डाटाबेसहरू विरुद्ध इनपुट FASTA फाइलहरूको अनुक्रम पङ्क्तिबद्धताको आधारमा जीन एनोटेसन प्रदर्शन गर्दछ।
आधारभूत स्थानीय पङ्क्तिबद्धता खोज उपकरण (BLAST)
BLAST उपकरण NCBI BLAST को BMKCloud एकीकृत संस्करण हो र BMKCloud खातामा अपलोड गरिएको डेटा प्रयोग गरेर समान कार्यहरू गर्न प्रयोग गर्न सकिन्छ।
CDS_UTR भविष्यवाणी
CDS_UTR भविष्यवाणी उपकरण ज्ञात प्रोटीन डाटाबेस र ORF भविष्यवाणी परिणामहरू विरुद्ध BLAST परिणामहरूको आधारमा दिइएको ट्रान्सक्रिप्ट अनुक्रमहरूमा कोडिङ क्षेत्रहरू (CDS) र गैर-कोडिङ क्षेत्रहरू (UTR) को भविष्यवाणी गर्न डिजाइन गरिएको हो।
म्यानहट्टन प्लट
म्यानहट्टन प्लट उपकरणले उच्च नमूना प्रयोगहरूको प्रदर्शन सक्षम बनाउँछ र सामान्यतया जीनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययन (GWAS) मा प्रयोग गरिन्छ।
सर्कस रेखाचित्र
CIRCOS रेखाचित्र उपकरणले जीनोममा जीनोमिक विशेषताहरू कसरी वितरण गरिन्छ भन्ने कुशल दृश्यावलोकन प्रदान गर्दछ। सामान्य सुविधाहरूमा मात्रात्मक लोकी, SNPs, InDels, संरचनात्मक र प्रतिलिपि संख्या भेरियन्टहरू समावेश छन्।
जीन ओन्टोलोजी (GO) संवर्धन
GO Enrichment उपकरणले कार्यात्मक संवर्धन विश्लेषण प्रदान गर्दछ। यस उपकरणमा रहेको प्राथमिक सफ्टवेयर TopGO-Bioconductor प्याकेज हो, जसमा भिन्न अभिव्यक्ति विश्लेषण, GO संवर्धन विश्लेषण र परिणामहरूको दृश्यावलोकन समावेश छ।
भारित जीन सह-अभिव्यक्ति नेटवर्क विश्लेषण (WGCNA)
WGCNA जीन सह-अभिव्यक्ति मोड्युलहरू पत्ता लगाउनको लागि व्यापक रूपमा प्रयोग हुने डेटा माइनिङ विधि हो। यो माइक्रोएरे र NGS जीन अभिव्यक्ति डेटा सहित विभिन्न अभिव्यक्ति डेटासेटमा लागू हुन्छ।
इन्टरप्रोस्क्यान
इन्टरप्रोस्क्यान उपकरणले इन्टरप्रो प्रोटीन अनुक्रम विश्लेषण र वर्गीकरण प्रदान गर्दछ।
GO KEGG संवर्धन
GO KEGG Enrichment उपकरण प्रदान गरिएको जीन सेट र सम्बन्धित एनोटेसनको आधारमा GO Enrichment Histogram, KEGG Enrichment Histogram र KEGG Enrichment Pathway उत्पन्न गर्न डिजाइन गरिएको हो।