secuenciación de ARNm (NGS) con xenoma de referencia
RNA-seq é unha ferramenta estándar nas ciencias da vida e dos cultivos, que reduce a brecha entre os xenomas e os proteomas. A súa forza reside en descubrir novos transcritos e cuantificar a súa expresión nun só ensaio. Úsase amplamente para estudos transcriptómicos comparativos, arroxando luz sobre xenes relacionados con varios trazos ou fenotipos, como comparar mutantes con tipos salvaxes ou revelar a expresión xénica en condicións específicas. A aplicación BMKCloud mRNA (Reference) integra a cuantificación da expresión, a análise da expresión diferencial (DEG) e as análises da estrutura da secuencia na canle bioinformática de mRNA-seq (NGS) e combina os puntos fortes de software similar, garantindo a comodidade e a facilidade de uso. Os usuarios poden cargar os seus datos de RNA-seq á nube, onde a aplicación ofrece unha solución integral de análise bioinformática. Ademais, prioriza a experiencia do cliente, ofrecendo operacións personalizadas adaptadas ás necesidades específicas dos usuarios. Os usuarios poden establecer parámetros e enviar a misión da canle por si mesmos, consultar o informe interactivo, ver datos/diagramas e completar a minería de datos, como: selección de xenes diana, agrupamento funcional, diagramación, etc.


Plataforma:Illumina, MGI
Estratexia:ARN-Seq
Maquetación: Comparado, datos limpos.
Tipo de biblioteca:fr-sen cadea, fr-primeira cadea ou fr-segunda cadea
Lonxitude de lectura:150 pb
Tipo de ficheiro:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz ou *.fq.gz. O sistemaemparella automaticamente os ficheiros .fastq segundo os seus nomes de ficheiro,por exemplo, *_1.fastq emparellado con *._2.fastq.
Número de mostras:Non hai restricións no númerode mostras, pero o tempo de análise aumentará a medida que aumente o número deas mostras medran.
Cantidade de datos recomendada:6G por mostra