Metaxenómica (NGS)

A metaxenómica de shotgun con Illumina é unha ferramenta popular para estudar microbiomas mediante a secuenciación directa de ADN de mostras complexas, o que permite o estudo tanto da diversidade taxonómica como funcional. A canle de metaxenómica (NGS) de BMKCloud comeza co control de calidade e a ensamblaxe do metaxenoma, a partir dos cales se predín os xenes e se agrupan en conxuntos de datos non redundantes que se anotan para a súa función e taxonomía utilizando múltiples bases de datos. Esta información utilízase para analizar a diversidade taxonómica dentro da mostra (diversidade alfa) e a diversidade entre mostras (diversidade beta). A análise diferencial entre grupos atopa OTU e funcións biolóxicas que difiren entre os dous grupos utilizando probas paramétricas e non paramétricas, mentres que a análise de correlación relaciona estas diferenzas con factores ambientais.