Produtos

Un metaxenoma é unha colección do material xenético dunha comunidade mixta de organismos, como os metaxenomas ambientais e humanos. Contén xenomas de microorganismos cultivables e non cultivables. A secuenciación metaxenómica permite o estudo destas intrincadas paisaxes xenómicas integradas en mostras ecolóxicas ao proporcionar algo máis que a elaboración de perfís taxonómicos. Tamén ofrece unha perspectiva xenómica funcional ao explorar os xenes codificados e os seus posibles papeis nos procesos ambientais. Aínda que as abordaxes tradicionais de escopeta coa secuenciación Illumina foron amplamente utilizadas en estudos metaxenómicos, a chegada da secuenciación de lectura longa Nanopore e PacBio cambiou o campo. A tecnoloxía Nanopore e PacBio mellora as análises bioinformáticas posteriores, especialmente a ensamblaxe de metaxenomas, garantindo ensamblaxes máis continuas. Os informes indican que a metaxenómica baseada en Nanopore e PacBio xerou con éxito xenomas bacterianos completos e pechados a partir de microbiomas complexos (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). A integración de lecturas de Nanopore con lecturas Illumina proporciona unha abordaxe estratéxica para a corrección de erros, mitigando a baixa precisión inherente de Nanopore. Esta combinación sinérxica aproveita os puntos fortes de cada plataforma de secuenciación, ofrecendo unha solución robusta para superar as posibles limitacións e mellorar a precisión e a fiabilidade das análises metaxenómicas.

Plataforma: Nanopore PromethION 48, Illumia e PacBio Revio