●Análise conxunta de ARNm e ARNlnc: combinando a cuantificación das transcricións de ARNm co estudo do ARNlnc e os seus obxectivos, é posible obter unha visión xeral do mecanismo regulador subxacente á resposta celular.
●Amplia experiencia: O noso equipo aporta unha gran experiencia a cada proxecto, cun historial de procesamento de máis de 23.000 mostras en BMK que abarcan diversos tipos de mostras e proxectos de lncRNA.
●Control de Calidade Riguroso: Implementamos puntos de control básicos en todas as etapas, desde a preparación de mostras e bibliotecas ata a secuenciación e a bioinformática. Este seguimento minucioso garante a entrega de resultados de alta calidade constantemente.
●Soporte posvenda: O noso compromiso vai máis aló da finalización do proxecto cun período de servizo posvenda de 3 meses. Durante este tempo, ofrecemos seguimento do proxecto, asistencia para a resolución de problemas e sesións de preguntas e respostas para resolver calquera dúbida relacionada cos resultados.
Biblioteca | Plataforma | Datos recomendados | QC de datos |
Biblioteca direccional esgotada de ARNr | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Conc. (ng/μl) | Cantidade (μg) | Pureza | Integridade |
≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Contaminación limitada ou nula de proteínas ou ADN no xel. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevación de referencia limitada ou nula |
● Plantas:
Raíz, talo ou pétalo: 450 mg
Folla ou semente: 300 mg
Froita: 1,2 g
● Animal:
Corazón ou Intestino: 450 mg
Vísceras ou cerebro: 240 mg
Músculo: 600 mg
Ósos, cabelo ou pel: 1,5 g
● Artrópodos:
Insectos: 9 g
Crustáceos: 450 mg
● Sangue enteiro:2 tubos
● Células: 106 células
● Soro e Plasma: 6 ml
Entrega de mostra recomendada
Recipiente: tubo de centrífuga de 2 ml (non se recomenda papel de aluminio)
Etiquetaxe da mostra: grupo+réplica, por exemplo, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Envío:
1. Xeo seco: as mostras deben ser embaladas en bolsas e enterradas en xeo seco.
2. Tubos RNAstable: as mostras de ARN pódense secar nun tubo de estabilización de ARN (por exemplo, RNAstable®) e enviarse a temperatura ambiente.
Bioinformática
Análise da expresión xenética diferencial (DEG).
Cuantificación da expresión de lncRNA - agrupación
Enriquecemento dos xenes diana do lncRNA
Análise da posición do ARNm e do ARNlc conxunta: gráfico de Circos (o círculo medio é ARNm e o círculo interno é ARNlc)
Explore os avances facilitados polos servizos de secuenciación de lncRNA de BMKGene a través dunha colección de publicacións seleccionada.
Ji, H. et al. (2020) "Identificación, predición funcional e verificación clave de lncRNA dos lncRNAs relacionados co estrés frío no fígado de ratas", Scientific Reports 2020 10:1, 10(1), pp. 1-14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) "A análise transcriptómica integrada revela o mecanismo inmune para unha cepa de carpa común resistente a CyHV-3", Frontiers in Immunology, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Priorización baseada na integración de Multi-Omics de redes de regulación de ARN endóxeno competitivas no cancro de pulmón de células pequenas: características moleculares e candidatos a medicamentos', Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) "Disección xenética da rede de coexpresión xenética subxacente á fotosíntese en Populus", Plant Biotechnology Journal, 18 (4), pp. 1015-1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'A Global Regulatory Network for Disregulated Gene Expression and Annormal Metabolic Signaling in Immune Cells in the Microenvironment of Graves' Disease and Hashimoto's Thyroiditis', Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.