条形banner-03

Produtos

Secuenciación longa non codificante-Illumina

Os ARN longos non codificantes (ARNlnc) son máis longos que 200 nucleótidos que posúen un potencial de codificación mínimo e son elementos fundamentais dentro do ARN non codificante. Atopados no núcleo e no citoplasma, estes ARN desempeñan un papel crucial na regulación epixenética, transcripcional e post-transcripcional, o que subliña a súa importancia na configuración dos procesos celulares e moleculares. A secuenciación do LncRNA é unha poderosa ferramenta na diferenciación celular, ontoxénese e enfermidades humanas.

Plataforma: Illumina NovaSeq


Detalles do servizo

Bioinformática

Resultados da demostración

Publicacións destacadas

Vantaxes do servizo

Análise conxunta de ARNm e ARNlnc: combinando a cuantificación das transcricións de ARNm co estudo do ARNlnc e os seus obxectivos, é posible obter unha visión xeral do mecanismo regulador subxacente á resposta celular.

Amplia experiencia: O noso equipo aporta unha gran experiencia a cada proxecto, cun historial de procesamento de máis de 23.000 mostras en BMK que abarcan diversos tipos de mostras e proxectos de lncRNA.

Control de Calidade Riguroso: Implementamos puntos de control básicos en todas as etapas, desde a preparación de mostras e bibliotecas ata a secuenciación e a bioinformática. Este seguimento minucioso garante a entrega de resultados de alta calidade constantemente.

Soporte posvenda: O noso compromiso vai máis aló da finalización do proxecto cun período de servizo posvenda de 3 meses. Durante este tempo, ofrecemos seguimento do proxecto, asistencia para a resolución de problemas e sesións de preguntas e respostas para resolver calquera dúbida relacionada cos resultados.

Requisitos de mostra e entrega

Biblioteca

Plataforma

Datos recomendados

QC de datos

Biblioteca direccional esgotada de ARNr

Illumina PE150

10-16 Gb

Q30≥85%

Nucleótidos:

Conc. (ng/μl)

Cantidade (μg)

Pureza

Integridade

≥ 80

≥ 0,8

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Contaminación limitada ou nula de proteínas ou ADN no xel.

RIN≥6,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

elevación de referencia limitada ou nula

● Plantas:

Raíz, talo ou pétalo: 450 mg

Folla ou semente: 300 mg

Froita: 1,2 g

● Animal:

Corazón ou Intestino: 450 mg

Vísceras ou cerebro: 240 mg

Músculo: 600 mg

Ósos, cabelo ou pel: 1,5 g

● Artrópodos:

Insectos: 9 g

Crustáceos: 450 mg

● Sangue enteiro:2 tubos

● Células: 106 células

● Soro e Plasma: 6 ml

Entrega de mostra recomendada

Recipiente: tubo de centrífuga de 2 ml (non se recomenda papel de aluminio)

Etiquetaxe da mostra: grupo+réplica, por exemplo, A1, A2, A3; B1, B2, B3.

Envío:

1. Xeo seco: as mostras deben ser embaladas en bolsas e enterradas en xeo seco.

2. Tubos RNAstable: as mostras de ARN pódense secar nun tubo de estabilización de ARN (por exemplo, RNAstable®) e enviarse a temperatura ambiente.

Fluxo de traballo do servizo

QC de mostra

Deseño de experimentos

entrega da mostra

Entrega da mostra

Experimento piloto

extracción de ARN

Preparación da biblioteca

Construción da biblioteca

Secuenciación

Secuenciación

Análise de datos

Análise de datos

Servizos posvenda

Servizos posvenda


  • Anterior:
  • Seguinte:

  • Bioinformática

    wps_doc_12

     

    Análise da expresión xenética diferencial (DEG).

     

     图片30

     

     

    Cuantificación da expresión de lncRNA - agrupación

     

    图片31 

     

    Enriquecemento dos xenes diana do lncRNA

     

     图片32

     

    Análise da posición do ARNm e do ARNlc conxunta: gráfico de Circos (o círculo medio é ARNm e o círculo interno é ARNlc)

     

     图片33

    Explore os avances facilitados polos servizos de secuenciación de lncRNA de BMKGene a través dunha colección de publicacións seleccionada.

     

    Ji, H. et al. (2020) "Identificación, predición funcional e verificación clave de lncRNA dos lncRNAs relacionados co estrés frío no fígado de ratas", Scientific Reports 2020 10:1, 10(1), pp. 1-14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.

    Jia, Z. et al. (2021) "A análise transcriptómica integrada revela o mecanismo inmune para unha cepa de carpa común resistente a CyHV-3", Frontiers in Immunology, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.

    Wang, XJ et al. (2022) 'Priorización baseada na integración de Multi-Omics de redes de regulación de ARN endóxeno competitivas no cancro de pulmón de células pequenas: características moleculares e candidatos a medicamentos', Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.

    Xiao, L. et al. (2020) "Disección xenética da rede de coexpresión xenética subxacente á fotosíntese en Populus", Plant Biotechnology Journal, 18 (4), pp. 1015-1026. doi: 10.1111/PBI.13270.

    Zheng, H. et al. (2022) 'A Global Regulatory Network for Disregulated Gene Expression and Annormal Metabolic Signaling in Immune Cells in the Microenvironment of Graves' Disease and Hashimoto's Thyroiditis', Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.

    obter unha cotización

    Escribe aquí a túa mensaxe e envíanolo

    Envíanos a túa mensaxe: