-
Metagenomic අනුපිළිවෙල -NGS
මෙටජෙනෝමයක් යනු පාරිසරික හා මානව මෙටජෙනෝම වැනි මිශ්ර ජීවීන් ප්රජාවක සම්පූර්ණ ජානමය ද්රව්යවල එකතුවකි. එහි වගා කළ හැකි සහ වගා කළ නොහැකි ක්ෂුද්ර ජීවීන්ගේ ජෙනෝම අඩංගු වේ. NGS සමඟින් ෂොට්ගන් මෙටජෙනොමික් අනුක්රමණය මඟින් වර්ගීකරණ පැතිකඩවලට වඩා වැඩි යමක් ලබා දීමෙන් පාරිසරික සාම්පලවල තැන්පත් කර ඇති මෙම සංකීර්ණ ප්රවේණික භූ දර්ශන අධ්යයනය කිරීමට හැකි වන අතර විශේෂ විවිධත්වය, බහුල ගතිකය සහ සංකීර්ණ ජනගහන ව්යුහයන් පිළිබඳ කැටිති අවබෝධයක් ද ලබා දේ. වර්ගීකරණ අධ්යයනයෙන් ඔබ්බට, වෙඩි බෙහෙත් මෙටජෙනොමික්ස් මඟින් ක්රියාකාරී ප්රවේණික ඉදිරිදර්ශනයක් ද ඉදිරිපත් කරයි, කේතනය කරන ලද ජාන ගවේෂණය කිරීම සහ පාරිසරික ක්රියාවලීන්හි ඒවායේ අනුකාරක භූමිකාවන් සක්රීය කරයි. අවසාන වශයෙන්, ප්රවේණික මූලද්රව්ය සහ පාරිසරික සාධක අතර සහසම්බන්ධතා ජාල පිහිටුවීම ක්ෂුද්රජීවී ප්රජාවන් සහ ඒවායේ පාරිසරික පසුබිම අතර ඇති සංකීර්ණ අන්තර් ක්රියාකාරිත්වය පිළිබඳ පරිපූර්ණ අවබෝධයක් සඳහා දායක වේ. අවසාන වශයෙන්, මෙම සංකීර්ණ පරිසර පද්ධති තුළ ජාන විද්යාව සහ පරිසර විද්යාව අතර බහුවිධ සම්බන්ධතා ආලෝකමත් කරමින් විවිධ ක්ෂුද්රජීවී ප්රජාවන්ගේ ප්රවේණික සංකීර්ණතා හෙළිදරව් කිරීම සඳහා ප්රධාන මෙවලමක් ලෙස මෙටාජෙනොමික් අනුක්රමය පවතී.
වේදිකා: Illumina NovaSeq සහ DNBSEQ-T7
-
Metagenomic Sequencing-TGS
මෙටජෙනෝමයක් යනු පාරිසරික හා මානව මෙටජෙනෝම වැනි මිශ්ර ජීවීන්ගේ ප්රජාවක ජානමය ද්රව්යවල එකතුවකි. එහි වගා කළ හැකි සහ වගා කළ නොහැකි ක්ෂුද්ර ජීවීන්ගේ ජෙනෝම අඩංගු වේ. මෙටජෙනොමික් අනුක්රමණය මගින් වර්ගීකරණ පැතිකඩවලට වඩා වැඩි යමක් ලබා දීමෙන් පාරිසරික සාම්පලවල තැන්පත් කර ඇති මෙම සංකීර්ණ ප්රවේණික භූ දර්ශන අධ්යයනය කිරීමට හැකියාව ලැබේ. එය කේතනය කරන ලද ජාන සහ පාරිසරික ක්රියාවලීන්හි ඒවායේ ප්රබල භූමිකාවන් ගවේෂණය කිරීමෙන් ක්රියාකාරී ජාන විද්යා ඉදිරිදර්ශනයක් ද ඉදිරිපත් කරයි. ඉලුමිනා අනුක්රමණය සමඟ සම්ප්රදායික වෙඩි බෙහෙත් ප්රවේශයන් මෙටාජෙනොමික් අධ්යයනයන්හි බහුලව භාවිතා වන අතර, නැනෝපෝර් සහ පැක්බයෝ දිගු-කියවන අනුපිළිවෙලෙහි පැමිණීම ක්ෂේත්රය වෙනස් කර ඇත. Nanopore සහ PacBio තාක්ෂණය මගින් පහළ ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණ වැඩි දියුණු කරයි, විශේෂයෙන් මෙටජිනෝම් එකලස් කිරීම, වඩාත් අඛණ්ඩ එකලස් කිරීම් සහතික කරයි. Nanopore-පාදක සහ PacBio-පදනම් වූ metagenomics මගින් සංකීර්ණ ක්ෂුද්ර ජීවින් (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020) සම්පූර්ණ සහ සංවෘත බැක්ටීරියා ජෙනෝම සාර්ථකව ජනනය කර ඇති බව වාර්තා පෙන්වා දෙයි. ඉලුමිනා කියවීම් සමඟ නැනෝපෝර් කියවීම් ඒකාබද්ධ කිරීම දෝෂ නිවැරදි කිරීම සඳහා උපායමාර්ගික ප්රවේශයක් සපයයි, නැනෝපෝර්ගේ ආවේනික අඩු නිරවද්යතාවය අවම කරයි. මෙම සමමුහුර්ත සංයෝජනය එක් එක් අනුක්රමික වේදිකාවේ ශක්තීන් උත්තේජනය කරයි, විභව සීමාවන් මඟහරවා ගැනීමට ශක්තිමත් විසඳුමක් ඉදිරිපත් කරයි සහ මෙට්ජෙනොමික් විශ්ලේෂණවල නිරවද්යතාවය සහ විශ්වසනීයත්වය වැඩි දියුණු කරයි.
වේදිකාව: Nanopore PromethION 48, Illumia සහ PacBio Revio
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S සහ 18S rRNA ජාන, අභ්යන්තර පිටපත් කළ ස්පේසර් (ITS) කලාපය සමඟ, ඉතා සංරක්ෂිත සහ අධි-විචල්ය කලාපවල සංයෝජනය හේතුවෙන් ප්රධාන අණුක ඇඟිලි සලකුණු සලකුණු ලෙස ක්රියා කරයි, ඒවා ප්රෝකැරියෝටික් සහ යුකැරියෝටික් ජීවීන් සංලක්ෂිත කිරීම සඳහා මිල කළ නොහැකි මෙවලම් බවට පත් කරයි. මෙම කලාපවල විස්තාරණය සහ අනුපිළිවෙල විවිධ පරිසර පද්ධති හරහා ක්ෂුද්රජීවී සංයුතිය සහ විවිධත්වය විමර්ශනය කිරීම සඳහා හුදකලා-නිදහස් ප්රවේශයක් ලබා දෙයි. Illumina අනුක්රමණය සාමාන්යයෙන් 16S හි V3-V4 සහ ITS1 වැනි කෙටි අධිවිචල්ය කලාප ඉලක්ක කරන අතර, 16S, 18S සහ ITS හි සම්පූර්ණ දිග අනුපිළිවෙලින් අනුපිළිවෙලින් උසස් වර්ගීකරණ විවරණයක් ලබා ගත හැකි බව පෙන්නුම් කර ඇත. මෙම විස්තීරණ ප්රවේශය මඟින් නිවැරදිව වර්ගීකරණය කරන ලද අනුපිළිවෙලෙහි ඉහළ ප්රතිශතයක් ඇති කරයි, විශේෂ හඳුනාගැනීම දක්වා විහිදෙන විභේදන මට්ටමක් සාක්ෂාත් කර ගනී. PacBio හි Single-Molecule Real-Time (SMRT) අනුක්රමික වේදිකාව කැපී පෙනෙන්නේ Illumina අනුක්රමයේ නිරවද්යතාවයට ප්රතිවිරුද්ධව, පූර්ණ-දිග ඇම්ප්ලිකන් ආවරණය කරන ඉතා නිවැරදි දිගු කියවීම් (HiFi) ලබා දීමෙනි. මෙම හැකියාව පර්යේෂකයන්ට අසමසම වාසියක් ලබා ගැනීමට ඉඩ සලසයි - ජානමය භූ දර්ශනයේ පරිදර්ශක දසුනක්. විස්තීරණ ආවරණය මගින් විශේෂ විවරණයේ විභේදනය සැලකිය යුතු ලෙස ඉහළ නංවයි, විශේෂයෙන් බැක්ටීරියා හෝ දිලීර ප්රජාවන් තුළ, ක්ෂුද්රජීවී ගහනයේ සංකීර්ණතා පිළිබඳ ගැඹුරු අවබෝධයක් ලබා ගැනීමට හැකි වේ.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Illumina තාක්ෂණය සමඟ ඇම්ප්ලිකන් අනුක්රමණය, විශේෂයෙන් 16S, 18S සහ ITS ජාන සලකුණු ඉලක්ක කර ගැනීම, ක්ෂුද්රජීවී ප්රජාවන් තුළ ඇති ෆයිලොජනි, වර්ගීකරණය සහ විශේෂ බහුලත්වය හෙළිදරව් කිරීම සඳහා ප්රබල ක්රමයකි. මෙම ප්රවේශයට ගෘහ පාලනයේ ජාන සලකුණු වල අධිවිචල්ය කලාප අනුක්රමණය කිරීම ඇතුළත් වේ. විසින් අණුක ඇඟිලි සලකුණක් ලෙස මුලින් හඳුන්වා දෙන ලදීWoeses et al1977 දී, මෙම තාක්ෂණය හුදකලා-නිදහස් විශ්ලේෂණයන් සක්රීය කිරීම මගින් ක්ෂුද්ර ජීවී පැතිකඩ විප්ලවීය වෙනසක් ඇති කළේය. 16S (බැක්ටීරියා), 18S (දිලීර) සහ අභ්යන්තර පිටපත් කරන ලද ස්පේසර් (ITS, දිලීර) අනුපිළිවෙලින් පර්යේෂකයන්ට බහුල විශේෂ පමණක් නොව දුර්ලභ හා හඳුනා නොගත් ඒවා ද හඳුනාගත හැකිය. ප්රධාන මෙවලමක් ලෙස පුළුල් ලෙස සම්මත කර ඇති, ඇම්ප්ලිකන් අනුක්රමය මිනිස් මුඛය, බඩවැල්, මලපහ සහ ඉන් ඔබ්බට ඇතුළු විවිධ පරිසරයන් හරහා අවකල්ය ක්ෂුද්රජීවී සංයුතීන් හඳුනා ගැනීමට උපකාරී වී ඇත.
-
බැක්ටීරියා සහ දිලීර සම්පූර්ණ ජෙනෝමය නැවත අනුක්රමණය කිරීම
ක්ෂුද්රජීවී ජෙනෝම සම්පූර්ණ කිරීම සහ සංසන්දනය කිරීම සක්රීය කිරීම මගින් ක්ෂුද්රජීවී ප්රවේණි විද්යාව දියුණු කිරීම සඳහා බැක්ටීරියා සහ දිලීර සම්පූර්ණ-ජීනෝම ප්රති-අනුක්රමණය කිරීමේ ව්යාපෘති මූලික වේ. මෙය පැසවීම ඉංජිනේරු විද්යාව, කාර්මික ක්රියාවලීන් ප්රශස්ත කිරීම සහ ද්විතියික පරිවෘත්තීය මාර්ග ගවේෂණය සඳහා පහසුකම් සපයයි. තවද, වෛද්ය විද්යාව, කෘෂිකර්මාන්තය සහ පාරිසරික විද්යාව තුළ පුළුල් ඇඟවුම් සහිත පාරිසරික අනුවර්තනය, වික්රියා ප්රශස්ත කිරීම සහ ජාන පරිණාමයේ ගතිකත්වය හෙළිදරව් කිරීම සඳහා දිලීර සහ බැක්ටීරියා නැවත අනුක්රමණය ඉතා වැදගත් වේ.
-
Prokaryotic RNA අනුක්රමණය
RNA අනුක්රමණය නිශ්චිත කොන්දේසි යටතේ සෛල තුළ ඇති සියලුම RNA පිටපත්වල විස්තීර්ණ පැතිකඩ සවිබල ගන්වයි. මෙම අති නවීන තාක්ෂණය විවිධ ජීව විද්යාත්මක ක්රියාවලීන් හා සම්බන්ධ සංකීර්ණ ජාන ප්රකාශන පැතිකඩ, ජාන ව්යුහයන් සහ අණුක යාන්ත්රණ එළිදක්වන ප්රබල මෙවලමක් ලෙස සේවය කරයි. මූලික පර්යේෂණ, සායනික රෝග විනිශ්චය සහ ඖෂධ සංවර්ධනය සඳහා පුළුල් ලෙස භාවිතා කරන, RNA අනුක්රමණය සෛලීය ගතිකත්වයේ සහ ජාන නියාමනයේ සංකීර්ණතා පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දෙයි. අපගේ ප්රොකරියෝටික් RNA සාම්පල සැකසීම rRNA ක්ෂය වීම සහ දිශානුගත පුස්තකාලය සකස් කිරීම සම්බන්ධව ප්රොකැරියෝටික් පිටපත් සඳහා සකස් කර ඇත.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq
-
Metatranscriptome අනුපිළිවෙල
Illumina අනුක්රමික තාක්ෂණය උපයෝගී කරගනිමින්, BMKGENE හි මෙටැට්රාන්ස්ක්රිප්ටෝම් අනුක්රමික සේවාව මගින් පස, ජලය, මුහුද, මලපහ සහ බඩවැලේ වැනි ස්වභාවික පරිසරයන් තුළ යුකැරියෝට ප්රොකැරියෝට සහ වෛරස් දක්වා විහිදෙන විවිධ ක්ෂුද්ර ජීවීන් සමූහයක ගතික ජාන ප්රකාශනය හෙළිදරව් කරයි. අපගේ විස්තීර්ණ සේවාව මගින් සංකීර්ණ ක්ෂුද්රජීවී ප්රජාවන්ගේ සම්පූර්ණ ජාන ප්රකාශන පැතිකඩයන් ගැන සොයා බැලීමට පර්යේෂකයන්ට බලය ලබාදේ. වර්ගීකරණ විශ්ලේෂණයෙන් ඔබ්බට, අපගේ මෙට්රාන්ස්ක්රිප්ටෝම් අනුක්රමික සේවාව ක්රියාකාරී සුපෝෂණයට ගවේෂණයට පහසුකම් සපයයි, වෙනස් ලෙස ප්රකාශිත ජාන සහ ඒවායේ භූමිකාවන් කෙරෙහි ආලෝකය විහිදුවයි. ඔබ මෙම විවිධ පාරිසරික ස්ථාන තුළ ජාන ප්රකාශනය, වර්ගීකරණ විවිධත්වය සහ ක්රියාකාරී ගතිකත්වය යන සංකීර්ණ භූ දර්ශනවල සැරිසැරීමේදී ජීව විද්යාත්මක අවබෝධයන් රාශියක් අනාවරණය කරගන්න.
-
De novo Fungal Genome එකලස් කිරීම
BMKGENE විවිධ පර්යේෂණ අවශ්යතා සහ අපේක්ෂිත ජෙනෝම සම්පූර්ණත්වය සඳහා දිලීර ජෙනෝම සඳහා බහුකාර්ය විසඳුම් ඉදිරිපත් කරයි. කෙටි-කියවන Illumina අනුක්රමණය භාවිතා කිරීම පමණක් කෙටුම්පත් ජෙනෝමයක් ජනනය කිරීමට ඉඩ සලසයි. Nanopore හෝ Pacbio භාවිතයෙන් කෙටි කියවීම් සහ දිගු-කියවන අනුපිළිවෙල දිගු කොන්ටිග්ස් සහිත වඩාත් පිරිපහදු කළ දිලීර ජෙනෝමයක් සඳහා ඒකාබද්ධ වේ. එපමනක් නොව, Hi-C අනුපිළිවෙල අනුකලනය කිරීම මගින් හැකියාවන් තව දුරටත් වැඩි දියුණු කරයි, සම්පූර්ණ වර්ණදේහ මට්ටමේ ජෙනෝමයක් ලබා ගැනීමට හැකි වේ.
-
De novo බැක්ටීරියා ජෙනෝම එකලස් කිරීම
අපි සම්පූර්ණ බැක්ටීරියා ජෙනෝම එකලස් කිරීමේ සේවාවක් සපයන අතර, 0 හිඩැස් සහතික කරමු. එකලස් කිරීම සඳහා Nanopore සහ PacBio වැනි දිගු-කියවන අනුක්රමික තාක්ෂණයන් සහ Illumina සමඟ කෙටි කියවීමේ අනුක්රමය එකලස් කිරීම වලංගු කිරීම සහ ONT කියවීම් වල දෝෂ නිවැරදි කිරීම සඳහා ඒකාබද්ධ කිරීමෙන් මෙය කළ හැකිය. අපගේ සේවාව නිශ්චිත පර්යේෂණ ඉලක්ක සපුරා ගනිමින් එකලස් කිරීම, ක්රියාකාරී විවරණ සහ උසස් ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණයෙන් සම්පූර්ණ ජෛව තොරතුරු කාර්ය ප්රවාහය සපයයි. විවිධ ප්රවේණික සහ ප්රවේණික අධ්යයනයන් සඳහා නිරවද්ය විමර්ශන ප්රවේණික වර්ධනයට මෙම සේවාව මඟින් හැකියාව ලැබේ. මීට අමතරව, එය වික්රියා ප්රශස්තිකරණය, ජාන ඉංජිනේරු විද්යාව සහ ක්ෂුද්රජීවී තාක්ෂණ සංවර්ධනය වැනි යෙදුම් සඳහා පදනම සකසයි, විද්යාත්මක තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය සහ ජෛව තාක්ෂණික නවෝත්පාදනයන් ඉදිරියට ගෙන යාම සඳහා තීරණාත්මක විශ්වාසදායක සහ පරතරයකින් තොර ජානමය දත්ත සහතික කරයි.
