-
મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગ -NGS
મેટાજેનોમ એ પર્યાવરણીય અને માનવ મેટાજેનોમ જેવા સજીવોના મિશ્ર સમુદાયની કુલ આનુવંશિક સામગ્રીનો સંગ્રહ છે. તેમાં ખેતી કરી શકાય તેવા અને બિનખેતી કરી શકાય તેવા બંને સુક્ષ્મસજીવોના જીનોમ છે. NGS સાથે શોટગન મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગ, વર્ગીકરણ રૂપરેખા કરતાં વધુ પ્રદાન કરીને પર્યાવરણીય નમૂનાઓમાં જડિત આ જટિલ જીનોમિક લેન્ડસ્કેપ્સના અભ્યાસને સક્ષમ કરે છે, જે પ્રજાતિઓની વિવિધતા, વિપુલતાની ગતિશીલતા અને જટિલ વસ્તી માળખામાં પણ દાણાદાર આંતરદૃષ્ટિ આપે છે. વર્ગીકરણ અભ્યાસ ઉપરાંત, શૉટગન મેટાજેનોમિક્સ કાર્યાત્મક જીનોમિક્સ પરિપ્રેક્ષ્ય પણ પ્રદાન કરે છે, જે એન્કોડેડ જનીનોની શોધખોળ અને ઇકોલોજીકલ પ્રક્રિયાઓમાં તેમની ભૂમિકાને સક્ષમ કરે છે. છેલ્લે, આનુવંશિક તત્વો અને પર્યાવરણીય પરિબળો વચ્ચે સહસંબંધ નેટવર્કની સ્થાપના માઇક્રોબાયલ સમુદાયો અને તેમની ઇકોલોજીકલ પૃષ્ઠભૂમિ વચ્ચેના જટિલ આંતરપ્રક્રિયાની સર્વગ્રાહી સમજમાં ફાળો આપે છે. નિષ્કર્ષમાં, મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગ વિવિધ માઇક્રોબાયલ સમુદાયોની જીનોમિક જટિલતાઓને ઉકેલવા માટેના મુખ્ય સાધન તરીકે છે, જે આ જટિલ ઇકોસિસ્ટમ્સમાં આનુવંશિકતા અને ઇકોલોજી વચ્ચેના બહુપક્ષીય સંબંધોને પ્રકાશિત કરે છે.
પ્લેટફોર્મ્સ: Illumina NovaSeq અને DNBSEQ-T7
-
મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગ-TGS
મેટાજેનોમ એ સજીવોના મિશ્ર સમુદાયની આનુવંશિક સામગ્રીનો સંગ્રહ છે, જેમ કે પર્યાવરણીય અને માનવ મેટાજેનોમ. તેમાં ખેતી કરી શકાય તેવા અને બિનખેતી કરી શકાય તેવા બંને સુક્ષ્મસજીવોના જીનોમ છે. મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગ વર્ગીકરણ કરતાં વધુ પ્રદાન કરીને ઇકોલોજીકલ નમૂનાઓમાં જડિત આ જટિલ જીનોમિક લેન્ડસ્કેપ્સના અભ્યાસને સક્ષમ કરે છે. તે એન્કોડેડ જનીનો અને પર્યાવરણીય પ્રક્રિયાઓમાં તેમની મહત્વની ભૂમિકાઓનું અન્વેષણ કરીને કાર્યાત્મક જીનોમિક્સ પરિપ્રેક્ષ્ય પણ પ્રદાન કરે છે. જ્યારે ઈલુમિના સિક્વન્સિંગ સાથેના પરંપરાગત શોટગન અભિગમોનો ઉપયોગ મેટાજેનોમિક અભ્યાસમાં વ્યાપકપણે કરવામાં આવે છે, ત્યારે નેનોપોર અને પેકબાયો લાંબા-વાંચેલા સિક્વન્સિંગના આગમનથી ક્ષેત્ર બદલાઈ ગયું છે. નેનોપોર અને PacBio ટેક્નોલોજી ડાઉનસ્ટ્રીમ બાયોઇન્ફોર્મેટીક વિશ્લેષણને વધારે છે, ખાસ કરીને મેટાજેનોમ એસેમ્બલી, વધુ સતત એસેમ્બલી સુનિશ્ચિત કરે છે. અહેવાલો સૂચવે છે કે નેનોપોર-આધારિત અને PacBio-આધારિત મેટાજેનોમિક્સે જટિલ માઇક્રોબાયોમ્સ (મોસ, EL, એટ અલ., નેચર બાયોટેક, 2020) માંથી સફળતાપૂર્વક સંપૂર્ણ અને બંધ બેક્ટેરિયલ જીનોમ્સ ઉત્પન્ન કર્યા છે. નેનોપોર રીડ્સને ઈલુમિના રીડ્સ સાથે એકીકૃત કરવાથી ભૂલ સુધારણા માટે વ્યૂહાત્મક અભિગમ પૂરો પાડે છે, નેનોપોરની સહજ ઓછી ચોકસાઈને ઘટાડી શકાય છે. આ સિનર્જિસ્ટિક સંયોજન દરેક સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મની શક્તિનો લાભ લે છે, સંભવિત મર્યાદાઓને દૂર કરવા અને મેટાજેનોમિક વિશ્લેષણની ચોકસાઇ અને વિશ્વસનીયતાને આગળ વધારવા માટે મજબૂત ઉકેલ પ્રદાન કરે છે.
પ્લેટફોર્મ: નેનોપોર પ્રોમેથિઅન 48, ઈલુમિયા અને પેકબાયો રેવિઓ
-
16S/18S/ITS એમ્પ્લિકન સિક્વન્સિંગ-PacBio
16S અને 18S rRNA જનીનો, આંતરિક ટ્રાન્સક્રિપ્ટેડ સ્પેસર (ITS) પ્રદેશ સાથે, અત્યંત સંરક્ષિત અને હાયપર-વેરિયેબલ પ્રદેશોના સંયોજનને કારણે મુખ્ય મોલેક્યુલર ફિંગરપ્રિન્ટિંગ માર્કર્સ તરીકે સેવા આપે છે, જે તેમને પ્રોકાર્યોટિક અને યુકેરીયોટિક સજીવોની લાક્ષણિકતા માટે અમૂલ્ય સાધનો બનાવે છે. આ પ્રદેશોનું એમ્પ્લીફિકેશન અને સિક્વન્સિંગ વિવિધ ઇકોસિસ્ટમ્સમાં માઇક્રોબાયલ કમ્પોઝિશન અને વિવિધતાની તપાસ માટે અલગતા-મુક્ત અભિગમ પ્રદાન કરે છે. જ્યારે ઈલુમિના સિક્વન્સિંગ સામાન્ય રીતે 16S અને ITS1 ના V3-V4 જેવા ટૂંકા હાયપરવેરિયેબલ પ્રદેશોને લક્ષ્ય બનાવે છે, તે દર્શાવવામાં આવ્યું છે કે 16S, 18S અને ITS ની સંપૂર્ણ લંબાઈને અનુક્રમ કરીને શ્રેષ્ઠ વર્ગીકરણ એનોટેશન પ્રાપ્ત કરી શકાય છે. આ વ્યાપક અભિગમ ચોક્કસ વર્ગીકૃત સિક્વન્સની ઊંચી ટકાવારીમાં પરિણમે છે, જે રીઝોલ્યુશનનું સ્તર હાંસલ કરે છે જે પ્રજાતિઓની ઓળખ સુધી વિસ્તરે છે. PacBioનું સિંગલ-મોલેક્યુલ રીઅલ-ટાઇમ (SMRT) સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ અત્યંત સચોટ લાંબા રીડ (HiFi) પ્રદાન કરીને અલગ છે જે ઇલુમિના સિક્વન્સિંગની ચોકસાઇને હરીફ કરીને, પૂર્ણ-લંબાઈના એમ્પ્લિકન્સને આવરી લે છે. આ ક્ષમતા સંશોધકોને એક અજોડ લાભ પ્રાપ્ત કરવા માટે પરવાનગી આપે છે - આનુવંશિક લેન્ડસ્કેપનું વિહંગમ દૃશ્ય. વિસ્તૃત કવરેજ, ખાસ કરીને બેક્ટેરિયલ અથવા ફંગલ સમુદાયોમાં, પ્રજાતિઓની ટીકામાં રિઝોલ્યુશનને નોંધપાત્ર રીતે વધારે છે, જે માઇક્રોબાયલ વસ્તીની જટિલતાઓની ઊંડી સમજને સક્ષમ કરે છે.
-
16S/18S/ITS એમ્પ્લિકન સિક્વન્સિંગ-NGS
ઇલ્યુમિના ટેક્નોલોજી સાથે એમ્પ્લિકોન સિક્વન્સિંગ, ખાસ કરીને 16S, 18S અને ITS આનુવંશિક માર્કર્સને લક્ષ્યાંકિત કરીને, માઇક્રોબાયલ સમુદાયોમાં ફાયલોજેની, વર્ગીકરણ અને પ્રજાતિઓની વિપુલતાને ઉકેલવા માટે એક શક્તિશાળી પદ્ધતિ છે. આ અભિગમમાં હાઉસકીપિંગ આનુવંશિક માર્કર્સના હાયપરવેરિયેબલ વિસ્તારોને અનુક્રમિત કરવાનો સમાવેશ થાય છે. દ્વારા મૂળરૂપે મોલેક્યુલર ફિંગરપ્રિન્ટ તરીકે રજૂ કરવામાં આવ્યું હતુંવેસીસ એટ અલ1977માં, આ ટેકનિકે આઇસોલેશન-ફ્રી એનાલિસિસને સક્ષમ કરીને માઇક્રોબાયોમ પ્રોફાઇલિંગમાં ક્રાંતિ લાવી છે. 16S (બેક્ટેરિયા), 18S (ફૂગ), અને ઇન્ટરનલ ટ્રાંસ્ક્રાઇબ્ડ સ્પેસર (ITS, ફૂગ) ના અનુક્રમ દ્વારા સંશોધકો માત્ર વિપુલ પ્રજાતિઓ જ નહીં પણ દુર્લભ અને અજાણી પ્રજાતિઓને પણ ઓળખી શકે છે. એક મુખ્ય સાધન તરીકે વ્યાપકપણે અપનાવવામાં આવ્યું છે, એમ્પ્લિકોન સિક્વન્સિંગ માનવ મોં, આંતરડા, સ્ટૂલ અને તેનાથી આગળના વિવિધ વાતાવરણમાં વિભેદક માઇક્રોબાયલ કમ્પોઝિશનને પારખવામાં નિમિત્ત બન્યું છે.
-
બેક્ટેરિયલ અને ફંગલ આખા જીનોમ રી-સિક્વન્સિંગ
બેક્ટેરિયલ અને ફંગલ આખા જીનોમ રી-સિક્વન્સિંગ પ્રોજેક્ટ્સ માઇક્રોબાયલ જીનોમ્સની પૂર્ણતા અને સરખામણીને સક્ષમ કરીને માઇક્રોબાયલ જીનોમિક્સને આગળ વધારવા માટે મુખ્ય છે. આ આથો એન્જિનિયરિંગ, ઔદ્યોગિક પ્રક્રિયાઓના ઑપ્ટિમાઇઝેશન અને ગૌણ ચયાપચયના માર્ગોની શોધની સુવિધા આપે છે. વધુમાં, દવા, કૃષિ અને પર્યાવરણીય વિજ્ઞાનમાં વ્યાપક અસરો સાથે, પર્યાવરણીય અનુકૂલનને સમજવા, તાણને ઑપ્ટિમાઇઝ કરવા અને આનુવંશિક ઉત્ક્રાંતિની ગતિશીલતાને ઉજાગર કરવા માટે ફંગલ અને બેક્ટેરિયલ રી-સિક્વન્સિંગ નિર્ણાયક છે.
-
પ્રોકાર્યોટિક આરએનએ સિક્વન્સિંગ
આરએનએ સિક્વન્સિંગ ચોક્કસ પરિસ્થિતિઓ હેઠળ કોષોની અંદર તમામ આરએનએ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સની વ્યાપક પ્રોફાઇલિંગને સશક્ત બનાવે છે. આ અદ્યતન ટેકનોલોજી એક શક્તિશાળી સાધન તરીકે કામ કરે છે, જટિલ જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ્સ, જનીન બંધારણો અને વિવિધ જૈવિક પ્રક્રિયાઓ સાથે સંકળાયેલ મોલેક્યુલર મિકેનિઝમ્સનું અનાવરણ કરે છે. મૂળભૂત સંશોધન, ક્લિનિકલ ડાયગ્નોસ્ટિક્સ અને ડ્રગ ડેવલપમેન્ટમાં વ્યાપકપણે અપનાવવામાં આવેલ, આરએનએ સિક્વન્સિંગ સેલ્યુલર ડાયનેમિક્સ અને આનુવંશિક નિયમનની જટિલતાઓમાં આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે. અમારી પ્રોકાર્યોટિક આરએનએ સેમ્પલ પ્રોસેસિંગ પ્રોકાર્યોટિક ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ્સ માટે તૈયાર કરવામાં આવી છે, જેમાં આરઆરએનએ ડિપ્લેશન અને ડાયરેક્શનલ લાઇબ્રેરીની તૈયારી સામેલ છે.
પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq
-
મેટાટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ
ઇલુમિના સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલૉજીનો ઉપયોગ કરીને, BMKGENE ની મેટાટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ સેવા માટી, પાણી, સમુદ્ર, સ્ટૂલ અને આંતરડા જેવા કુદરતી વાતાવરણમાં યુકેરીયોટ્સથી પ્રોકેરીયોટ્સ અને વાયરસ સુધી ફેલાયેલા સુક્ષ્મજીવાણુઓની વિવિધ શ્રેણીના ગતિશીલ જનીન અભિવ્યક્તિનું અનાવરણ કરે છે. અમારી વ્યાપક સેવા સંશોધકોને જટિલ માઇક્રોબાયલ સમુદાયોની સંપૂર્ણ જનીન અભિવ્યક્તિ રૂપરેખાઓનો અભ્યાસ કરવાની શક્તિ આપે છે. વર્ગીકરણ વિશ્લેષણ ઉપરાંત, અમારી મેટાટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ સેવા કાર્યાત્મક સંવર્ધનમાં અન્વેષણની સુવિધા આપે છે, જે વિભિન્ન રીતે વ્યક્ત જનીનો અને તેમની ભૂમિકાઓ પર પ્રકાશ પાડે છે. આ વિવિધ પર્યાવરણીય માળખામાં જનીન અભિવ્યક્તિ, વર્ગીકરણ વિવિધતા અને કાર્યાત્મક ગતિશીલતાના જટિલ લેન્ડસ્કેપ્સને નેવિગેટ કરતી વખતે જૈવિક આંતરદૃષ્ટિની સંપત્તિને ઉજાગર કરો.
-
ડી નોવો ફંગલ જીનોમ એસેમ્બલી
BMKGENE ફંગલ જીનોમ માટે બહુમુખી સોલ્યુશન્સ પ્રદાન કરે છે, વિવિધ સંશોધન જરૂરિયાતો અને ઇચ્છિત જીનોમ પૂર્ણતા પૂરી કરે છે. એકલા ટૂંકા-વાંચેલા ઇલુમિના સિક્વન્સિંગનો ઉપયોગ ડ્રાફ્ટ જીનોમ બનાવવાની મંજૂરી આપે છે. નેનોપોર અથવા પેકબિયોનો ઉપયોગ કરીને ટૂંકા વાંચન અને લાંબા વાંચન ક્રમને લાંબા કોન્ટિગ્સ સાથે વધુ શુદ્ધ ફૂગ જીનોમ માટે જોડવામાં આવે છે. વધુમાં, હાઈ-સી સિક્વન્સિંગને એકીકૃત કરવાથી ક્ષમતાઓમાં વધુ વધારો થાય છે, સંપૂર્ણ રંગસૂત્ર-સ્તરનો જીનોમ પ્રાપ્ત કરવામાં સક્ષમ બને છે.
-
ડી નોવો બેક્ટેરિયલ જીનોમ એસેમ્બલી
અમે સંપૂર્ણ બેક્ટેરિયલ જીનોમ એસેમ્બલી સેવા પ્રદાન કરીએ છીએ, 0 ગેપની ખાતરી આપીએ છીએ. એસેમ્બલી માટે નેનોપોર અને PacBio જેવી લાંબી-રીડ સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલોજીને એકીકૃત કરીને અને એસેમ્બલીની માન્યતા અને ONT રીડની ભૂલ સુધારણા માટે ઈલુમિના સાથે ટૂંકી-રીડ સિક્વન્સિંગ દ્વારા આ શક્ય છે. અમારી સેવા એસેમ્બલી, ફંક્શનલ એનોટેશન અને અદ્યતન બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણમાંથી સંપૂર્ણ બાયોઇન્ફોર્મેટિક વર્કફ્લો પ્રદાન કરે છે, ચોક્કસ સંશોધન લક્ષ્યોને પરિપૂર્ણ કરે છે. આ સેવા વિવિધ આનુવંશિક અને જીનોમિક અભ્યાસો માટે ચોક્કસ સંદર્ભ જીનોમના વિકાસને સક્ષમ કરે છે. વધુમાં, તે સ્ટ્રેઈન ઓપ્ટિમાઈઝેશન, આનુવંશિક ઈજનેરી અને માઇક્રોબાયલ ટેક્નોલોજી ડેવલપમેન્ટ જેવા કાર્યક્રમો માટે આધાર બનાવે છે, જે વૈજ્ઞાનિક આંતરદૃષ્ટિ અને બાયોટેક્નોલોજીકલ ઈનોવેશનને આગળ વધારવા માટે વિશ્વસનીય અને ગેપ-ફ્રી જીનોમિક ડેટાની ખાતરી કરે છે.