-
Genome-wide සංගම් විශ්ලේෂණය
Genome-wide ආශ්‍රිත අධ්‍යයනය (GWAS) අරමුණු කරන්නේ විශේෂිත ගතිලක්ෂණ (ෆීනෝටයිප්) සමඟ සම්බන්ධ වන ප්‍රවේණි ප්‍රභේද (ප්‍රවේණික) හඳුනා ගැනීමයි.GWAS අධ්‍යයනය මගින් පුද්ගලයන් විශාල සංඛ්‍යාවකගේ සම්පූර්ණ ජෙනෝමය හරහා ජානමය සලකුණු විමර්ශනය කරන අතර ජනගහන මට්ටමින් සංඛ්‍යානමය විශ්ලේෂණය මගින් ප්‍රවේණි-රූපී සංගම් පුරෝකථනය කරයි.එය මානව රෝග පිළිබඳ පර්යේෂණ සහ සතුන්ගේ හෝ ශාකවල සංකීර්ණ ගති ලක්ෂණ මත ක්‍රියාකාරී ජාන කැණීම් සඳහා පුළුල් ලෙස යොදා ගෙන ඇත.
-
Single-nucleus RNA අනුක්‍රමණය
තනි සෛල ග්‍රහණය කර ගැනීමේ ප්‍රගතිය සහ තනි පුද්ගල පුස්තකාල ඉදිකිරීමේ තාක්‍ෂණය ඉහළ-නිලදායිතා අනුපිළිවෙල සමඟ ඒකාබද්ධ වීම සෛලයෙන් සෛල පදනමින් ජාන ප්‍රකාශන අධ්‍යයනයට ඉඩ සලසයි.එය සංකීර්ණ සෛල ජනගහනය පිළිබඳ ගැඹුරු සහ සම්පූර්ණ පද්ධති විශ්ලේෂණයක් සක්‍රීය කරයි, එමඟින් සියලුම සෛලවල සාමාන්‍ය ලබා ගැනීමෙන් ඒවායේ විෂමජාතීත්වය වසං කිරීම බොහෝ දුරට වළක්වයි.
කෙසේ වෙතත්, සමහර සෛල තනි සෛල අත්හිටුවීම බවට පත් කිරීමට සුදුසු නොවේ, එබැවින් වෙනත් නියැදි සකස් කිරීමේ ක්‍රම අවශ්‍ය වේ - පටක වලින් න්‍යෂ්ටිය නිස්සාරණය කිරීම, එනම්, න්‍යෂ්ටිය කෙලින්ම පටක හෝ සෛල වලින් නිස්සාරණය කර තනි-න්‍යෂ්ටික අත්හිටුවීම සඳහා සකස් කරනු ලැබේ. සෛල අනුපිළිවෙල.
BMK 10× Genomics Chromium TM පාදක තනි සෛල RNA අනුක්‍රමික සේවාව සපයයි.ප්‍රතිශක්තිකරණ සෛල විභේදනය, පිළිකා විෂමතාවය, පටක වර්ධනය යනාදී රෝග ආශ්‍රිත අධ්‍යයනයන්හි මෙම සේවාව බහුලව භාවිතා වී ඇත.
අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ චිපය: 10× ජෙනොමික්ස්
වේදිකාව: Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
ශාක/සත්ව සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුක්‍රමණය
සම්පූර්ණ ප්‍රවේණි ප්‍රති-අනුක්‍රමණය, WGS ලෙසද හැඳින්වේ, තනි නියුක්ලියෝටයිඩ බහුරූපතාව (SNP), ඇතුළත් කිරීම් මකාදැමීම (InDel), ව්‍යුහ විචලනය (SV) සහ පිටපත් සංඛ්‍යා විචලනය (CNV) ඇතුළුව සමස්ත ජානයේම පොදු සහ දුර්ලභ විකෘති දෙකම හෙළිදරව් කිරීමට හැකියාව ලැබේ. )SVs SNP වලට වඩා විචල්‍ය පදනමේ විශාල කොටසක් සෑදී ඇති අතර ජීවී ජීවීන් කෙරෙහි සැලකිය යුතු බලපෑමක් ඇති ජෙනෝමය කෙරෙහි වැඩි බලපෑමක් ඇති කරයි.Tandem repeats, GC/AT පොහොසත් කලාප සහ අධි-විචල්‍ය කලාප වැනි සංකීර්ණ ප්‍රදේශ හරහා වර්ණදේහ හරස් කිරීම දිගු කියවීම් පහසු කරන බැවින් දිගු කියවීම් අනුක්‍රමික විශාල කොටස් සහ සංකීර්ණ වෙනස්කම් වඩාත් නිවැරදිව හඳුනා ගැනීමට ඉඩ සලසයි.
වේදිකාව: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 අවකාශීය පිටපත
සෛලවල අවකාශීය සංවිධානය ප්‍රතිශක්තිකරණ ආක්‍රමණය, කළල වර්ධනය වැනි විවිධ ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන්හි වැදගත් කාර්යභාරයක් ඉටු කරයි. අවකාශීය පිහිටීම පිළිබඳ තොරතුරු රඳවා ගනිමින් ජාන ප්‍රකාශන පැතිකඩ පෙන්නුම් කරන අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙල, පිටපත් මට්ටමේ පටක ගෘහ නිර්මාණ ශිල්පය පිළිබඳ විශාල අවබෝධයක් ලබා දෙයි.තාක්‍ෂණයේ දියුණුවත් සමඟ, අතිශය පැහැදිලි පටක රූප විද්‍යාව සහ අවකාශීය අණුක ප්‍රකාශනයේ සැබෑ ව්‍යුහාත්මක වෙනස ඉහළ විභේදනයකින් අධ්‍යයනය කළ යුතුය.BMKGENE නියැදි සිට ජීව විද්‍යාත්මක තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය දක්වා විස්තීර්ණ, එක්-නැවතුම් අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ අනුක්‍රමික සේවාවක් සපයයි.
විෂම සාම්පලවල අවකාශීය අන්තර්ගතය සමඟ ජාන ප්‍රකාශන පැතිකඩ නිරාකරණය කිරීම මගින් අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ තාක්ෂණයන් විවිධ පර්යේෂණ ක්ෂේත්‍රයේ නව ඉදිරිදර්ශන බල ගැන්වීය.
අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ චිපය: BMKMANU S1000
වේදිකාව: Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
10x Genomics Visium අවකාශීය පිටපත් කිරීම
Visium Spatial Gene Expression යනු සම්පූර්ණ mRNA මත පදනම්ව පටක වර්ගීකරණය කිරීම සඳහා වන ප්‍රධාන ධාරාවේ අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ අනුක්‍රමික තාක්ෂණයකි.සාමාන්‍ය වර්ධනය, රෝග ව්‍යාධි විද්‍යාව සහ සායනික පරිවර්තන පර්යේෂණ පිළිබඳ නව තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය සොයා ගැනීමට රූප විද්‍යාත්මක සන්දර්භය සමඟ සම්පූර්ණ පිටපත සිතියම්ගත කරන්න.BMKGENE නියැදි සිට ජීව විද්‍යාත්මක තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය දක්වා විස්තීර්ණ, එක්-නැවතුම් අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ අනුක්‍රමික සේවාවක් සපයයි.
විෂම සාම්පලවල අවකාශීය අන්තර්ගතය සමඟ ජාන ප්‍රකාශන පැතිකඩ නිරාකරණය කිරීම මගින් අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ තාක්ෂණයන් විවිධ පර්යේෂණ ක්ෂේත්‍රය තුළ නව ඉදිරිදර්ශන සවිබල ගැන්වීය..
අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ චිපය: 10x Genomics Visium
වේදිකාව:Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
සම්පූර්ණ දිග mRNA අනුක්‍රමණය-නැනෝපෝර්
RNA අනුක්‍රමණය විස්තීරණ පිටපත් විශ්ලේෂණය සඳහා අගනා මෙවලමක් වී ඇත.සැකයකින් තොරව, සාම්ප්‍රදායික කෙටි-කියවන අනුක්‍රමය මෙහි බොහෝ වැදගත් දියුණුවක් ලබා ඇත.එසේ වුවද, එය බොහෝ විට පූර්ණ-දිග සමස්ථානික හඳුනාගැනීම්, ප්‍රමාණකරණය, PCR පක්ෂග්‍රාහී සීමාවන්ට මුහුණ දෙයි.
නැනෝපෝර් අනුක්‍රමණය අනෙකුත් අනුක්‍රමික වේදිකා වලින් වෙන්කර හඳුනා ගනී, නියුක්ලියෝටයිඩ DNA සංස්ලේෂණයකින් තොරව කෙලින්ම කියවන අතර කිලෝබේස් දස ගණනකින් දිගු කියවීමක් ජනනය කරයි.මෙය පූර්ණ-දිග පිටපත් හරස් කිරීම සහ සමස්ථානික මට්ටමේ අධ්‍යයනයන්හි අභියෝගවලට මුහුණ දීම සඳහා සෘජුව කියවීමට බලය ලබා දෙයි.
වේදිකාව：Nanopore PromethION
පුස්තකාලය:cDNA-PCR
-
සම්පූර්ණ දිග mRNA අනුක්‍රමණය -PacBio
ද නවෝපූර්ණ-දිග පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙල ලෙසද හැඳින්වේද නවෝIso-Seq PacBio අනුක්‍රමයේ කියවීමේ දිගෙහි වාසි ලබා ගනී, එමඟින් කිසිදු බිඳීමකින් තොරව පූර්ණ-දිග cDNA අණු අනුක්‍රමණය කිරීමට හැකියාව ලැබේ.මෙය පිටපත් එකලස් කිරීමේ පියවරේදී ජනනය වන ඕනෑම දෝෂයක් සම්පූර්ණයෙන් වළක්වන අතර සමස්ථානික මට්ටමේ විභේදනය සහිත යුනිජීන් කට්ටල ගොඩනඟයි.මෙම යුනිජීන කට්ටලය ප්‍රබල ජානමය තොරතුරු "යොමු ජෙනෝමය" ලෙස පිටපත් මට්ටමින් සපයයි.මීට අමතරව, ඊළඟ පරම්පරාවේ අනුක්‍රමික දත්ත සමඟ ඒකාබද්ධ කිරීම, මෙම සේවාව සමස්ථානික මට්ටමේ ප්‍රකාශනයේ නිවැරදි ප්‍රමාණකරණයක් බල ගන්වයි.
වේදිකාව: PacBio Sequel IIපුස්තකාලය: SMRT සීනු පුස්තකාලය -
යුකැරියෝටික් mRNA අනුක්‍රමණය-ඉලුමිනා
mRNA අනුක්‍රමණය විශේෂිත තත්ත්‍වයන් යටතේ සෛල වලින් පිටපත් කරන ලද සියලුම mRNA වල පැතිකඩ සැකසීම සක්‍රීය කරයි.එය ජාන ප්‍රකාශන පැතිකඩ, ජාන ව්‍යුහයන් සහ ඇතැම් ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන්හි අණුක යාන්ත්‍රණ හෙළිදරව් කිරීම සඳහා ප්‍රබල තාක්ෂණයකි.අද වන විට, mRNA අනුක්‍රමණය මූලික පර්යේෂණ, සායනික රෝග විනිශ්චය, ඖෂධ සංවර්ධනය යනාදිය තුළ බහුලව භාවිතා කර ඇත.
වේදිකාව: Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
යොමු නොවන mRNA අනුක්‍රමණය-Illumina
mRNA අනුක්‍රමණය සමහර විශේෂ කාර්යයන් සක්‍රිය කරන නිශ්චිත කාල පරිච්ෙඡ්දයකදී පණිවිඩකරු RNA(mRNA) ආකෘතිය Eukaryote ග්‍රහණය කර ගැනීමට මීළඟ පරම්පරාවේ අනුක්‍රමික තාක්‍ෂණය (NGS) භාවිතා කරයි.දිගම පිටපත් කිරීම 'යුනිජීන්' ලෙස හැඳින්වූ අතර පසුව විශ්ලේෂණය සඳහා යොමු අනුපිළිවෙල ලෙස භාවිතා කරන ලදී, එය සඳහනකින් තොරව විශේෂයේ අණුක යාන්ත්‍රණය සහ නියාමන ජාලය අධ්‍යයනය කිරීමට ඵලදායී මාධ්‍යයකි.
පිටපත් දත්ත එකලස් කිරීම සහ යුනිජීන් ක්‍රියාකාරී විවරණයෙන් පසුව
(1)SSR විශ්ලේෂණය, CDS පුරෝකථනය සහ ජාන ව්‍යුහය පෙර සැකසෙනු ඇත.
(2)එක් එක් නියැදිය තුළ ඒකජාතික ප්‍රකාශනය ප්‍රමාණ කිරීම සිදු කරනු ලැබේ.
(3) සාම්පල (හෝ කණ්ඩායම්) අතර වෙනස් ලෙස ප්‍රකාශිත යුනිජීන ඒකජාතික ප්‍රකාශනය මත පදනම්ව සොයා ගනු ලැබේ.
(4) වෙනස් ලෙස ප්‍රකාශිත යුනිජීනවල පොකුරු කිරීම, ක්‍රියාකාරී විවරණ සහ සුපෝෂණය විශ්ලේෂණය සිදු කරනු ලැබේ.
-
දිගු කේත-නොවන අනුපිළිවෙල-ඉලුමිනා
දිගු කේතීකරණය නොවන RNA (lncRNAs) යනු 200 nt ට වැඩි දිගකින් යුත් RNA අණු වර්ගයකි, ඒවා ඉතා අඩු කේතීකරණ විභවයකින් සංලක්ෂිත වේ.LncRNA, කේතීකරණය නොවන RNA වල ප්‍රධාන සාමාජිකයෙකු ලෙස, ප්‍රධාන වශයෙන් න්‍යෂ්ටිය සහ ප්ලාස්මා වල දක්නට ලැබේ.අනුක්‍රමික තාක්‍ෂණයේ සහ ජෛව තොරතුරු විද්‍යාවේ දියුණුව නව lncRNA ගණනාවක් හඳුනා ගැනීමට සහ ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාකාරකම් සමඟ සම්බන්ධ කිරීමට හැකි වේ.සමුච්චිත සාක්ෂි මගින් පෙන්නුම් කරන්නේ lncRNA එපිජෙනටික් නියාමනය, පිටපත් කිරීමේ නියාමනය සහ පශ්චාත් පිටපත් කිරීමේ නියාමනය සඳහා පුළුල් ලෙස සම්බන්ධ වී ඇති බවයි.
-
කුඩා RNA අනුක්‍රමණය - Illumina
කුඩා RNA යනු මයික්‍රෝ ආර්එන්ඒ (miRNA), කුඩා මැදිහත්වීම් RNA (siRNA) සහ piwi-interacting RNA (piRNA) ඇතුළුව සාමාන්‍යයෙන් 200nt ට වඩා අඩු දිගකින් යුත් කේතීකරණය නොවන RNA අණු පන්තියකි.
MicroRNA (miRNA) යනු සෛල තුළ විවිධ වැදගත් නියාමන භූමිකාවන් ඉටු කරන 20-24nt පමණ දිගකින් යුත් ආවේණික කුඩා RNA කාණ්ඩයකි.miRNA බොහෝ ජීව ක්‍රියාවලීන් සඳහා සම්බන්ධ වන අතර එමඟින් පටක - විශේෂිත සහ වේදිකාව - විශේෂිත ප්‍රකාශනය සහ විවිධ විශේෂවල ඉතා සංරක්ෂණය කර ඇත.
-
circRNA අනුක්‍රමණය - Illumina
CircRNAs (චක්‍රලේඛන RNA) යනු 5′ end cap සහ 3′ end poly(A) tail ට අඩු කේත නොවන RNA අණු වර්ගයකි.CircRNAs RNA exonuclease ජීර්ණයට එරෙහිව තත්ත්වය වන සහසංයුජ බන්ධනය මගින් වෘත්තාකාර ව්‍යුහය සිදු කරයි.ජීවීන්ගේ වර්ධනය හා සංවර්ධනය සහ බාහිර පරිසරයට ඔවුන්ගේ ප්රතිරෝධය තුළ circRNA වැදගත් කාර්යභාරයක් ඉටු කරයි.
CircRNA හට බොහෝ ක්‍රියාකාරකම් ඇත, ඒවා තරඟකාරී ලෙස miRNA බන්ධනය කළ හැකි අතර, ceRNA හි නියාමන කාර්යය ක්‍රියාත්මක කරයි, ජාන ප්‍රකාශනය නියාමනය කරයි.මෑත වසරවලදී, එය රෝග ඇතිවීම හා වර්ධනයට සමීපව සම්බන්ධ වන බව ද සොයාගෙන ඇති අතර, රෝග විනිශ්චය සලකුණුකරණයේ දිශාවට විශාල යෙදුම් අපේක්ෂාවන් ඇත.
