තාපය සිතියම
Matrix දත්ත ගොනුව තාප සිතියම් ඇඳීම සඳහා භාවිතා කරයි, එයට අනුකෘති දත්ත පෙරීමට, සාමාන්‍යකරණය කිරීමට සහ පොකුරු කිරීමට හැකිය.විවිධ සාම්පල අතර ජාන ප්‍රකාශන මට්ටම පිළිබඳ පොකුරු විශ්ලේෂණය සඳහා එය බොහෝ විට භාවිතා වේ.
ජාන විවරණය
විවිධ දත්ත සමුදායට එරෙහිව FASTA ගොනුවේ අනුපිළිවෙල සිතියම්ගත කිරීම මගින් ජාන ක්රියාකාරී විවරණය සිදු කෙරේ.
ජාන විවරණය
මූලික දේශීය පෙළගැස්ම සෙවුම් මෙවලම
CDS_UTR_Prediction
මෙම මෙවලම සැලසුම් කර ඇත්තේ දන්නා ප්රෝටීන් දත්ත ගබඩාව සහ ORF පුරෝකථනයට එරෙහිව පිපිරවීම මත පදනම්ව ලබා දී ඇති පිටපත් අනුපිළිවෙලෙහි කේතීකරණ කලාප (CDS) සහ කේතීකරණය නොවන කලාප (UTR) පුරෝකථනය කිරීමට ය.
මෑන්හැටන් ප්ලොට්
මෑන්හැටන් ප්ලොට් මඟින් දත්ත ලක්ෂ්‍ය විශාල සංඛ්‍යාවක් සමඟ දත්ත සංදර්ශන කිරීමට හැකියාව ලැබේ.එය සාමාන්‍යයෙන් ජෙනෝමය-පුළුල් සංගම් අධ්‍යයනයන්හි (GWAS) භාවිතා වේ.
සර්කෝස්
CIRCOS රූප සටහන මගින් ජෙනෝමය මත SNP, InDeL, SV, CNV බෙදාහැරීම් සෘජුව ඉදිරිපත් කිරීමට හැකියාව ලැබේ.
GO_ පොහොසත් කිරීම
TopGO යනු ක්රියාකාරී පොහොසත් කිරීම සඳහා නිර්මාණය කර ඇති මෙවලමකි.TopGO-Bioconductor පැකේජය අවකල ප්‍රකාශන විශ්ලේෂණය, GO පොහොසත් කිරීමේ විශ්ලේෂණය සහ ප්‍රතිඵල දෘශ්‍යකරණයෙන් සමන්විත වේ.එය topGO_BP, topGO_CC සහ topGO_MF සඳහා ප්‍රතිඵල අඩංගු "Graph" නම් ප්‍රතිදානය සහිත ෆෝල්ඩරයක් ජනනය කරනු ඇත.
WGCNA
WGCNA යනු ජාන සම ප්‍රකාශන මොඩියුල සොයා ගැනීම සඳහා බහුලව භාවිතා වන දත්ත කැණීම් ක්‍රමයකි.මීළඟ පරම්පරාවේ අනුපිළිවෙලින් ආරම්භ වූ ක්ෂුද්‍ර අරා දත්ත සහ ජාන ප්‍රකාශන දත්ත ඇතුළු විවිධ ප්‍රකාශන දත්ත කට්ටලයට එය අදාළ වේ.
InterProScan
InterPro ප්රෝටීන් අනුපිළිවෙල විශ්ලේෂණය සහ වර්ගීකරණය
GO_KEGG_පොහොසත් කිරීම
මෙම මෙවලම GO enrichment histogram, KEGG enrichment histogram සහ KEGG enrichment pathway ලබා දී ඇති ජාන කට්ටලය සහ අනුරූප විවරණ මත පදනම්ව ජනනය කිරීමට සැලසුම් කර ඇත.