Metagenomic අනුපිළිවෙල -NGS
මෙටජෙනෝමයක් යනු පාරිසරික හා මානව මෙටජෙනෝම වැනි මිශ්‍ර ජීවීන්ගේ ප්‍රජාවක සම්පූර්ණ ජානමය ද්‍රව්‍යවල එකතුවකි. එහි වගා කළ හැකි සහ වගා කළ නොහැකි ක්ෂුද්ර ජීවීන්ගේ ජෙනෝම අඩංගු වේ. NGS සමඟින් ෂොට්ගන් මෙටජෙනොමික් අනුක්‍රමණය මඟින් වර්ගීකරණ පැතිකඩවලට වඩා වැඩි යමක් ලබා දීමෙන් පාරිසරික සාම්පලවල තැන්පත් කර ඇති මෙම සංකීර්ණ ප්‍රවේණික භූ දර්ශන අධ්‍යයනය කිරීමට හැකි වන අතර විශේෂ විවිධත්වය, බහුල ගතිකය සහ සංකීර්ණ ජනගහන ව්‍යුහයන් පිළිබඳ කැටිති අවබෝධයක් ද ලබා දේ. වර්ගීකරණ අධ්‍යයනයෙන් ඔබ්බට, වෙඩි බෙහෙත් මෙටජෙනොමික්ස් මඟින් ක්රියාකාරී ප්‍රවේණික ඉදිරිදර්ශනයක් ද ඉදිරිපත් කරයි, කේතනය කරන ලද ජාන ගවේෂණය කිරීම සහ පාරිසරික ක්‍රියාවලීන්හි ඒවායේ අනුකාරක භූමිකාවන් සක්‍රීය කරයි. අවසාන වශයෙන්, ප්‍රවේණික මූලද්‍රව්‍ය සහ පාරිසරික සාධක අතර සහසම්බන්ධතා ජාල පිහිටුවීම ක්ෂුද්‍රජීවී ප්‍රජාවන් සහ ඒවායේ පාරිසරික පසුබිම අතර ඇති සංකීර්ණ අන්තර් ක්රියාකාරිත්වය පිළිබඳ පරිපූර්ණ අවබෝධයක් සඳහා දායක වේ. අවසාන වශයෙන්, මෙම සංකීර්ණ පරිසර පද්ධති තුළ ජාන විද්‍යාව සහ පරිසර විද්‍යාව අතර බහුවිධ සම්බන්ධතා ආලෝකමත් කරමින් විවිධ ක්ෂුද්‍රජීවී ප්‍රජාවන්ගේ ප්‍රවේණික සංකීර්ණතා හෙළිදරව් කිරීම සඳහා ප්‍රධාන මෙවලමක් ලෙස මෙටාජෙනොමික් අනුක්‍රමය පවතී.
වේදිකා: Illumina NovaSeq සහ DNBSEQ-T7
සේවා වාසි
●ක්ෂුද්‍රජීවී ප්‍රජා පැතිකඩ සඳහා හුදකලා කිරීම සහ වගා කිරීම-නිදහස් ක්‍රමය: වගා කළ නොහැකි ජීවීන්ගෙන් ජානමය ද්‍රව්‍ය අනුක්‍රමණය කිරීම සක්‍රීය කිරීම.
●අධි විභේදනය: පාරිසරික සාම්පලවල අඩු බහුල විශේෂ හඳුනා ගන්න.
●සවිස්තරාත්මක ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය:වර්ගීකරණ විවිධත්වය කෙරෙහි පමණක් නොව ප්‍රජාවේ ක්රියාකාරී විවිධත්වය කෙරෙහි ද අවධානය යොමු කර ඇත.
●පුළුල් අත්දැකීම්:විවිධ පර්යේෂණ වසම්වල බහු මෙටජෙනොමික්ස් ව්‍යාපෘති සාර්ථකව වසා දැමීම සහ සාම්පල 200,000කට වඩා වැඩි ප්‍රමාණයක් සැකසීමේ වාර්තාවක් සමඟින්, අපගේ කණ්ඩායම සෑම ව්‍යාපෘතියකටම අත්දැකීම් සම්භාරයක් ගෙන එයි.
සේවා පිරිවිතර
| අනුක්‍රමික වේදිකාව | අනුක්‍රමික උපාය මාර්ගය | නිර්දේශිත දත්ත | තත්ත්ව පාලනය |
| Illumina NovaSeq හෝ DNBSEQ-T7 | PE150 | 6-20Gb | Q30≥85% |
සේවා අවශ්යතා
| සාන්ද්රණය (ng/µL) | මුළු මුදල (ng) | පරිමාව (µL) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● පස / රොන්මඩ: 2-3g
● බඩවැල් අන්තර්ගතය-සත්ව: 0.5-2g
● බඩවැල් අන්තර්ගතය-කෘමියා: 0.1-0.25g
● ශාක මතුපිට (සාරවත් අවසාදිත): 0.5-1g
● පැසවීම සුප් හොද්ද පොහොසත් අවසාදිතය): 0.2-0.5g
● මලපහ (විශාල සතුන්): 0.5-2g
● මලපහ (මූසිකය): 3-5 ධාන්ය
● පුඵ්ඵුසීය ඇල්වෙයෝලර් සේදීමේ තරලය: පෙරහන කඩදාසි
● යෝනි ස්පුබ්: 5-6 swabs
● සම/ලිංගික ස්පුබ්/කෙල/මුඛ මෘදු පටක/ෆරින්ජියල් ස්පුබ්/රෙක්ටල් ස්පුබ්: ස්පුබ් 2-3
● මතුපිට ක්ෂුද්ර ජීවීන්: 5-6 swabs
● ජලය/වාතය/ජෛව පටල: පෙරහන් කඩදාසි
● එන්ඩොෆයිට්: 2-3g
● දන්ත ඵලකය: 0.5-1g
සේවා වැඩ ප්රවාහය
සාම්පල භාරදීම
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
පහත විශ්ලේෂණය ඇතුළත් වේ:
● දත්ත තත්ත්ව පාලනය අනුක්‍රමණය කිරීම
● Metagenome එකලස් කිරීම සහ ජාන අනාවැකි
● ජාන විවරණ
● වර්ගීකරණ ඇල්ෆා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය
● ප්රජාවගේ ක්රියාකාරී විශ්ලේෂණය: ජීව විද්යාත්මක ක්රියාකාරිත්වය, පරිවෘත්තීය, ප්රතිජීවක ප්රතිරෝධය
● ක්රියාකාරී සහ වර්ගීකරණ විවිධත්වය පිළිබඳ විශ්ලේෂණය:
බීටා විවිධත්වය විශ්ලේෂණය
අන්තර් කණ්ඩායම් විශ්ලේෂණය
සහසම්බන්ධතා විශ්ලේෂණය: පාරිසරික සාධක සහ පිටත සංයුතිය සහ විවිධත්වය අතර
ක්රියාකාරී විශ්ලේෂණය: CARD ප්රතිජීවක ප්රතිරෝධය
KEGG පරිවෘත්තීය මාර්ගවල අවකල විශ්ලේෂණය: සැලකිය යුතු මාර්ගවල තාප සිතියම
වර්ගීකරණ ව්‍යාප්තියේ ඇල්ෆා විවිධත්වය: ACE දර්ශකය
වර්ගීකරණ ව්‍යාප්තියේ බීටා විවිධත්වය: PCoA
සකස් කරන ලද ප්‍රකාශන එකතුවක් හරහා Illumina සමඟ BMKGene හි මෙටජිනොම් අනුක්‍රමික සේවා මගින් පහසුකම් සපයන දියුණුව ගවේෂණය කරන්න.
Hai, Q. et al. (2023) 'විවිධ සංස්කෘතියේ ජල උෂ්ණත්වවලදී බෝවන hematopoietic necrosis වෛරසය ආසාදනය වූ රේන්බෝ ට්‍රවුට් (Oncorhynchus mykiss) හි බඩවැල් අන්තර්ගතයේ වෙනස්වීම් පිළිබඳ පරිවෘත්තීය හා පරිවෘත්තීය විශ්ලේෂණය',ක්ෂුද්‍රජීව විද්‍යාවේ මායිම්, 14, පි. 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
Mao, C. et al. (2023) 'විවිධ කුසලාන ප්‍රාන්තවල නාගරික විල්වල ක්ෂුද්‍රජීවී ප්‍රජාවන්, ප්‍රතිරෝධක ජාන සහ ප්‍රතිරෝධක අවදානම්: අභ්‍යන්තර සම්බන්ධතා සහ බාහිර බලපෑම්',අන්තරායකර ද්‍රව්‍ය අත්තිකාරම් සඟරාව, 9, පි. 100233. doi: 10.1016/J.HAZADV.2023.100233.
Su, M. et al. (2022) 'ද්‍රව ආශ්‍රිත සහ ඝන ආශ්‍රිත ක්ෂුද්ර ජීවීන්ගේ බැටළු රුමේන් අතර සංයුතියේ සහ ක්‍රියාකාරීත්වයේ වෙනස්කම් හෙළිදරව් කරන ලද Metagenomic Analysis',ක්ෂුද්‍රජීව විද්‍යාවේ මායිම්, 13, පි. 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.
යින්, ජේ. සහ අල්. (2023) 'තරබාරු Ningxiang ඌරු-ව්‍යුත්පන්න ක්ෂුද්‍රජීවය, කෙට්ටු DLY ඌරන් තුළ මාංශ පේශි මේද අම්ල තැන්පත් වීම ප්‍රවර්ධනය කිරීම සඳහා carnitine පරිවෘත්තීය නැවත සකස් කරයි',නවෝත්පාදනය, 4(5), පි. 100486. doi: 10.1016/J.XINN.2023.100486.
Zhao, X. et al. (2023) 'චීනයේ හයිහේ මෝයහි ඉහළ සහ පහළ ප්‍රදේශවල නියෝජිත ජෛව/ දිරාපත් නොවන ප්ලාස්ටික් සහ ප්ලාස්ටික් නොවන අපද්‍රව්‍යවල ඇති විය හැකි අවදානම් පිළිබඳ පරිවෘත්තීය අවබෝධය',සමස්ත පරිසරයේ විද්‍යාව, 887, පි. 164026. doi: 10.1016/J.SCITOTENV.2023.164026.
