මෙටාජෙනොමික් අනුක්රමණය -NGS
මෙටාජෙනෝමයක් යනු පාරිසරික හා මානව මෙටාජෙනෝම වැනි මිශ්ර ජීවීන්ගේ ප්රජාවක මුළු ජානමය ද්රව්ය එකතුවකි. එහි වගා කළ හැකි සහ වගා කළ නොහැකි ක්ෂුද්ර ජීවීන් යන දෙකෙහිම ජෙනෝම අඩංගු වේ. NGS සමඟ ෂොට්ගන් මෙටාජෙනෝමික් අනුක්රමණය මඟින් පාරිසරික සාම්පලවල තැන්පත් කර ඇති මෙම සංකීර්ණ ජානමය භූ දර්ශන අධ්යයනය කිරීමට හැකියාව ලබා දෙන අතර, වර්ගීකරණ පැතිකඩකරණයට වඩා වැඩි යමක් ලබා දීමෙන්, විශේෂ විවිධත්වය, බහුලතා ගතිකත්වය සහ සංකීර්ණ ජනගහන ව්යුහයන් පිළිබඳ කැටිති අවබෝධයක් ද ලබා දෙයි. වර්ගීකරණ අධ්යයනයන්ගෙන් ඔබ්බට, ෂොට්ගන් මෙටාජෙනෝමික්ස් ක්රියාකාරී ප්රවේණි විද්යා දෘෂ්ටිකෝණයක් ද ඉදිරිපත් කරයි, එමඟින් කේතනය කරන ලද ජාන සහ පාරිසරික ක්රියාවලීන්හි ඒවායේ උපකල්පිත භූමිකාවන් ගවේෂණය කිරීමට හැකි වේ. අවසාන වශයෙන්, ජානමය මූලද්රව්ය සහ පාරිසරික සාධක අතර සහසම්බන්ධතා ජාල ස්ථාපිත කිරීම ක්ෂුද්රජීවී ප්රජාවන් සහ ඒවායේ පාරිසරික පසුබිම අතර සංකීර්ණ අන්තර් ක්රියාකාරිත්වය පිළිබඳ පරිපූර්ණ අවබෝධයකට දායක වේ. අවසාන වශයෙන්, මෙටාජෙනෝමික් අනුක්රමණය විවිධ ක්ෂුද්රජීවී ප්රජාවන්ගේ ජානමය සංකීර්ණතා හෙළිදරව් කිරීම සඳහා ප්රධාන මෙවලමක් ලෙස පවතී, මෙම සංකීර්ණ පරිසර පද්ධති තුළ ජාන විද්යාව සහ පරිසර විද්යාව අතර බහුවිධ සම්බන්ධතා ආලෝකමත් කරයි.
වේදිකා: ඉලුමිනා නෝවාසෙක් සහ DNBSEQ-T7
සේවා වාසි
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයක්ෂුද්රජීවී ප්රජා පැතිකඩකරණය සඳහා හුදකලා කිරීම සහ වගා-නිදහස් ක්රමය: වගා කළ නොහැකි ජීවීන්ගෙන් ජානමය ද්රව්ය අනුපිළිවෙලට සකස් කිරීම.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයඉහළ විභේදනය: පාරිසරික සාම්පලවල අඩු බහුල විශේෂ හඳුනා ගන්න.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයවිස්තීර්ණ ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය:වර්ගීකරණ විවිධත්වය කෙරෙහි පමණක් නොව ප්රජාවේ ක්රියාකාරී විවිධත්වය කෙරෙහි ද අවධානය යොමු කළේය.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයපුළුල් අත්දැකීම්:විවිධ පර්යේෂණ ක්ෂේත්රවල බහු මෙටාජෙනොමික්ස් ව්යාපෘති සාර්ථකව වසා දැමීමේ සහ සාම්පල 200,000 කට වඩා සැකසීමේ වාර්තාවක් සමඟින්, අපගේ කණ්ඩායම සෑම ව්යාපෘතියකටම අත්දැකීම් සම්භාරයක් ගෙන එයි.
සේවා පිරිවිතර
| අනුක්රමික වේදිකාව | අනුපිළිවෙල උපාය මාර්ගය | නිර්දේශිත දත්ත | තත්ත්ව පාලනය |
| ඉලුමිනා නෝවාසෙක් හෝ DNBSEQ-T7 | PE150 යනු කුමක්ද? | 6-20 ජීබී | Q30≥85% |
සේවා අවශ්යතා
| සාන්ද්රණය (ng/µL) | මුළු මුදල (ng) | පරිමාව (µL) |
| ≥1 | ≥30 ≥30 යි | ≥20 |
● පස/රොන් මඩ: 2-3g
● බඩවැල් අන්තර්ගතය-සත්ව: 0.5-2g
● බඩවැල් අන්තර්ගතය - කෘමියා: 0.1-0.25g
● ශාක මතුපිට (සාරවත් අවසාදිත): 0.5-1g
● පැසවීම සුප් හොද්ද පොහොසත් අවසාදිතය): 0.2-0.5g
● මළපහ (විශාල සතුන්): 0.5-2g
● මළපහ (මීයා): ධාන්ය 3-5
● පෙනහළු ඇල්වෙයෝලර් සේදීමේ තරලය: පෙරහන් කඩදාසි
● යෝනි ස්පුබ්: 5-6 ස්පුබ්
● සම/ලිංගේන්ද්රිය ස්පුබ්/කෙල/මුඛ මෘදු පටක/ෆරින්ජියල් ස්පුබ්/ගුද මාර්ග ස්පුබ්: ස්පුබ් 2-3
● මතුපිට ක්ෂුද්ර ජීවීන්: ස්පුබ් 5-6ක්
● ජල කඳ/වාතය/ජෛව පටල: පෙරහන් කඩදාසි
● එන්ඩොෆයිට්: 2-3g
● දන්ත ඵලකය: 0.5-1g
සේවා වැඩ ප්රවාහය
සාම්පල භාරදීම
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
පහත විශ්ලේෂණයන් ඇතුළත් වේ:
● දත්ත තත්ත්ව පාලනය අනුක්රමණය කිරීම
● මෙටජෙනෝම එකලස් කිරීම සහ ජාන පුරෝකථනය
● ජාන විවරණය
● වර්ගීකරණ ඇල්ෆා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය
● ප්රජාවේ ක්රියාකාරී විශ්ලේෂණය: ජීව විද්යාත්මක ක්රියාකාරිත්වය, පරිවෘත්තීය, ප්රතිජීවක ප්රතිරෝධය
● ක්රියාකාරී සහ වර්ගීකරණ විවිධත්වය යන දෙකම පිළිබඳ විශ්ලේෂණය:
බීටා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය
අන්තර් කණ්ඩායම් විශ්ලේෂණය
සහසම්බන්ධතා විශ්ලේෂණය: පාරිසරික සාධක සහ OUT සංයුතිය සහ විවිධත්වය අතර
ක්රියාකාරී විශ්ලේෂණය: CARD ප්රතිජීවක ප්රතිරෝධය
KEGG පරිවෘත්තීය මාර්ගවල අවකල විශ්ලේෂණය: සැලකිය යුතු මාර්ගවල තාප සිතියම
වර්ගීකරණ ව්යාප්තියේ ඇල්ෆා විවිධත්වය: ACE දර්ශකය
වර්ගීකරණ ව්යාප්තියේ බීටා විවිධත්වය: PCoA
සංක්ෂිප්ත ප්රකාශන එකතුවක් හරහා ඉලුමිනා සමඟ BMKGene හි මෙටාජෙනෝම් අනුක්රමික සේවා මගින් පහසුකම් සපයන ලද දියුණුව ගවේෂණය කරන්න.
හායි, කියු. සහ තවත් අය (2023) 'විවිධ වගා ජල උෂ්ණත්වවලදී බෝවන රක්තපාත නෙරෝසිස් වෛරසයෙන් ආසාදනය වූ දේදුනු ට්රවුට් (ඔන්කොරින්චස් මයිකිස්) හි බඩවැල් අන්තර්ගතයේ සිදුවන වෙනස්කම් පිළිබඳ පරිවෘත්තීය හා පරිවෘත්තීය විශ්ලේෂණය',ක්ෂුද්රජීව විද්යාවේ මායිම්, 14, පිටුව 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
මාඕ, සී. සහ තවත් අය (2023) 'විවිධ කුසලාන තත්වයන්හි නාගරික විල්වල ක්ෂුද්ර ජීවී ප්රජාවන්, ප්රතිරෝධක ජාන සහ ප්රතිරෝධක අවදානම්: අභ්යන්තර සම්බන්ධතා සහ බාහිර බලපෑම්',අන්තරායකර ද්රව්ය දියුණුව පිළිබඳ සඟරාව, 9, පි. 100233. doi: 10.1016/J.HAZADV.2023.100233.
Su, M. et al. (2022) 'ද්රව-ආශ්රිත සහ ඝන-ආශ්රිත බැටළු රූමන් ක්ෂුද්ර ජීවීන් අතර සංයුතියේ සහ ක්රියාකාරිත්වයේ වෙනස්කම් පරිවෘත්තීය විශ්ලේෂණයෙන් හෙළි විය',ක්ෂුද්රජීව විද්යාවේ මායිම්, 13, පිටුව 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.
යින්, ජේ. සහ තවත් අය (2023) 'තරබාරු නිංෂියැං ඌරු-ව්යුත්පන්න ක්ෂුද්රජීව, කෙට්ටු DLY ඌරන් තුළ මාංශ පේශි මේද අම්ල තැන්පත් වීම ප්රවර්ධනය කිරීම සඳහා කානිටීන් පරිවෘත්තීය ක්රියාවලිය නැවත සකස් කරයි',නවෝත්පාදනය, 4(5), පි. 100486. doi: 10.1016/J.XINN.2023.100486.
ෂාඕ, එක්ස්. සහ තවත් අය (2023) 'චීනයේ හයිහේ මෝය කටේ ඉහළ සහ පහළ ප්රදේශවල නියෝජිත ජෛව/දිරාපත් නොවන ප්ලාස්ටික් සහ ප්ලාස්ටික් නොවන සුන්බුන් වල විභව අවදානම් පිළිබඳ පරිවෘත්තීය අවබෝධය',සම්පූර්ණ පරිසරය පිළිබඳ විද්යාව, 887, පි. 164026. doi: 10.1016/J.SCITOTENV.2023.164026.
