-
Urutan Metagenomik -NGS
Metagenom iku kumpulan materi genetik total saka komunitas campuran organisme, kayata metagenom lingkungan lan manungsa. Metagenom iki ngandhut genom mikroorganisme sing bisa ditandur lan ora bisa ditandur. Sekuensing metagenomik shotgun nganggo NGS ngidini panliten babagan lanskap genomik sing rumit iki sing dilebokake ing sampel lingkungan kanthi nyedhiyakake luwih saka profil taksonomi, uga menehi wawasan rinci babagan keragaman spesies, dinamika kelimpahan, lan struktur populasi sing kompleks. Saliyane panliten taksonomi, metagenomik shotgun uga nawakake perspektif genomik fungsional, sing ngidini eksplorasi gen sing dikodekake lan peran putatif ing proses ekologis. Pungkasan, pembentukan jaringan korelasi antarane unsur genetik lan faktor lingkungan nyumbang kanggo pangerten holistik babagan interaksi sing rumit antarane komunitas mikroba lan latar mburi ekologis. Kesimpulane, sekuensing metagenomik minangka instrumen penting kanggo mbukak kerumitan genomik saka macem-macem komunitas mikroba, sing madhangi hubungan multifaset antarane genetika lan ekologi ing ekosistem kompleks iki.
Platform: Illumina NovaSeq lan DNBSEQ-T7
-
Urutan Metagenomik-TGS
Metagenom iku kumpulan materi genetik saka komunitas campuran organisme, kayata metagenom lingkungan lan manungsa. Metagenom iki ngandhut genom mikroorganisme sing bisa dibudidayakake lan ora bisa dibudidayakake. Sekuensing metagenomik ngidini panliten babagan lanskap genomik sing rumit iki sing dilebokake ing sampel ekologis kanthi nyedhiyakake luwih saka profil taksonomi. Metagenom uga nawakake perspektif genomik fungsional kanthi njelajah gen sing dikodekake lan peran putatif ing proses lingkungan. Nalika pendekatan shotgun tradisional karo sekuensing Illumina wis digunakake sacara wiyar ing panliten metagenomik, munculé sekuensing maca dawa Nanopore lan PacBio wis ngganti lapangan kasebut. Teknologi Nanopore lan PacBio ningkatake analisis bioinformatik hilir, utamane perakitan metagenom, njamin perakitan sing luwih terus-terusan. Laporan nuduhake yen metagenomik berbasis Nanopore lan PacBio wis sukses ngasilake genom bakteri lengkap lan tertutup saka mikrobioma kompleks (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). Ngintegrasikan bacaan Nanopore karo bacaan Illumina nyedhiyakake pendekatan strategis kanggo koreksi kesalahan, nyuda akurasi Nanopore sing kurang. Kombinasi sinergis iki nggunakake kekuwatan saben platform sekuensing, menehi solusi sing kuat kanggo ngatasi watesan potensial lan ningkatake presisi lan linuwih analisis metagenomik.
Platform: Nanopore PromethION 48, Illumia lan PacBio Revio
-
Urutan Amplikon 16S/18S/ITS-PacBio
Gen rRNA 16S lan 18S, bebarengan karo wilayah Internal Transcribed Spacer (ITS), dadi penanda sidik jari molekuler sing penting amarga kombinasi wilayah sing lestari lan hiper-variabel, dadi alat sing ora ana regane kanggo menehi ciri organisme prokariotik lan eukariotik. Amplifikasi lan sekuensing wilayah kasebut nawakake pendekatan tanpa isolasi kanggo nyelidiki komposisi mikroba lan keragaman ing macem-macem ekosistem. Nalika sekuensing Illumina biasane nargetake wilayah hipervariabel cendhak kaya V3-V4 saka 16S lan ITS1, wis dibuktekake manawa anotasi taksonomi sing unggul bisa ditindakake kanthi sekuensing dawa lengkap 16S, 18S, lan ITS. Pendekatan komprehensif iki nyebabake persentase sing luwih dhuwur saka urutan sing diklasifikasikake kanthi akurat, entuk tingkat resolusi sing ngluwihi identifikasi spesies. Platform sekuensing Single-Molecule Real-Time (SMRT) PacBio unggul kanthi nyedhiyakake bacaan dawa (HiFi) sing akurat banget sing nutupi amplikon dawa lengkap, saingan karo presisi sekuensing Illumina. Kapabilitas iki ngidini para peneliti entuk kauntungan sing ora ana tandhingane — tampilan panorama lanskap genetik. Jangkoan sing luwih jembar nambah resolusi ing anotasi spesies, utamane ing komunitas bakteri utawa jamur, sing ndadekake pangerten sing luwih jero babagan seluk-beluk populasi mikroba.
-
Urutan Amplikon 16S/18S/ITS-NGS
Sekuensing amplikon nganggo teknologi Illumina, khusus nargetake penanda genetik 16S, 18S, lan ITS, minangka metode sing kuat kanggo ngungkap filogeni, taksonomi, lan kelimpahan spesies ing komunitas mikroba. Pendekatan iki kalebu sekuensing wilayah hipervariabel saka penanda genetik housekeeping. Wiwitane dikenalake minangka sidik jari molekuler deningWoeses lan liya-liyaneIng taun 1977, teknik iki wis ngrevolusi profil mikrobioma kanthi ngaktifake analisis tanpa isolasi. Liwat sekuensing 16S (bakteri), 18S (jamur), lan Internal Transcribed Spacer (ITS, jamur), para peneliti ora mung bisa ngenali spesies sing akeh nanging uga spesies langka lan ora dingerteni. Diadopsi sacara wiyar minangka alat penting, sekuensing amplikon wis dadi instrumental kanggo mbedakake komposisi mikroba sing beda-beda ing macem-macem lingkungan, kalebu cangkem manungsa, usus, feses, lan liya-liyane.
-
Urutan Ulang Genom Bakteri lan Jamur
Proyèk sekuensing ulang genom sakabèhé bakteri lan jamur iku penting banget kanggo ngembangaké genomik mikroba kanthi nggampangaké penyelesaian lan perbandingan genom mikroba. Iki nggampangaké rekayasa fermentasi, optimalisasi proses industri, lan eksplorasi jalur metabolisme sekunder. Salajengipun, sekuensing ulang jamur lan bakteri iku penting banget kanggo mangerteni adaptasi lingkungan, ngoptimalake galur, lan mbukak dinamika évolusi genetik, kanthi implikasi sing amba ing kedokteran, pertanian, lan ilmu lingkungan.
-
Urutan RNA Prokariotik
Sekuensing RNA nguatake profiling lengkap kabeh transkrip RNA ing njero sel ing kahanan tartamtu. Teknologi canggih iki dadi alat sing kuat, mbukak profil ekspresi gen sing rumit, struktur gen, lan mekanisme molekuler sing ana gandhengane karo macem-macem proses biologis. Diadopsi sacara wiyar ing riset dhasar, diagnostik klinis, lan pangembangan obat, sekuensing RNA nawakake wawasan babagan seluk-beluk dinamika seluler lan regulasi genetik. Pamrosesan sampel RNA prokariotik kita dirancang kanggo transkriptom prokariotik, sing nglibatake penipisan rRNA lan persiapan perpustakaan arah.
-
Urutan Metatranskriptom
Nggunakake teknologi sekuensing Illumina, layanan sekuensing metatranskriptom BMKGENE mbukak ekspresi gen dinamis saka macem-macem mikroba, wiwit eukariota nganti prokariota lan virus, ing lingkungan alami kayata lemah, banyu, segara, feses, lan usus. Layanan komprehensif kita nguatake para peneliti kanggo nyinaoni profil ekspresi gen lengkap komunitas mikroba sing kompleks. Saliyane analisis taksonomi, layanan sekuensing metatranskriptom kita nggampangake eksplorasi menyang pengayaan fungsional, menehi cahya babagan gen sing diekspresikan kanthi beda lan perane. Temokake akeh wawasan biologis nalika sampeyan navigasi lanskap kompleks ekspresi gen, keragaman taksonomi, lan dinamika fungsional ing ceruk lingkungan sing maneka warna iki.
-
Majelis Genome Jamur De novo
BMKGENE nawakake solusi serbaguna kanggo genom jamur, sing nyukupi kabutuhan riset sing maneka warna lan kelengkapan genom sing dikarepake. Nggunakake sekuensing Illumina sing diwaca cendhak wae ngidini generasi draf genom. Sekuensing sing diwaca cendhak lan dawa nggunakake Nanopore utawa Pacbio digabungake kanggo genom jamur sing luwih alus kanthi kontinjensi sing luwih dawa.
-
Majelis Genome Bakteri De novo
Kita nyedhiyakake layanan perakitan genom bakteri lengkap, njamin 0 celah. Iki bisa ditindakake kanthi nggabungake teknologi sekuensing maca dawa, kayata Nanopore lan PacBio kanggo perakitan lan sekuensing maca cendhak karo Illumina kanggo validasi perakitan lan koreksi kesalahan maca ONT. Layanan kita nyedhiyakake alur kerja bioinformatik lengkap saka perakitan, anotasi fungsional, lan analisis bioinformatik canggih, sing ngrampungake tujuan riset tartamtu. Layanan iki mbisakake pangembangan genom referensi sing tepat kanggo macem-macem studi genetik lan genomik. Kajaba iku, iki mbentuk basis kanggo aplikasi kayata optimasi galur, rekayasa genetika, lan pangembangan teknologi mikroba, njamin data genomik sing dipercaya lan bebas celah sing penting kanggo ngembangake wawasan ilmiah lan inovasi bioteknologi.
