-
Metagenomic Sequencing -NGS
Metagenom minangka kumpulan materi genetik total saka komunitas campuran organisme, kayata metagenom lingkungan lan manungsa. Isine génom mikroorganisme sing bisa dibudidaya lan ora bisa dibudidaya. Urutan metagenomik senapan karo NGS mbisakake nyinaoni lanskap genomik rumit iki sing diselehake ing conto lingkungan kanthi menehi luwih saka profiling taksonomi, menehi uga wawasan granular babagan keragaman spesies, dinamika kelimpahan, lan struktur populasi sing kompleks. Ngluwihi studi taksonomi, metagenomics shotgun uga nawakake perspektif genomik fungsional, ngidini eksplorasi gen sing dikode lan peran sing diduga ing proses ekologis. Pungkasan, panyiapan jaringan korélasi antarane unsur genetik lan faktor lingkungan nyumbang kanggo pemahaman holistik babagan interaksi rumit antarane komunitas mikroba lan latar mburi ekologis. Kesimpulane, urutan metagenomik minangka instrumen penting kanggo ngungkapake kerumitan genom saka komunitas mikroba sing maneka warna, madhangi hubungan multifaset antarane genetika lan ekologi ing ekosistem kompleks kasebut.
Platform: Illumina NovaSeq lan DNBSEQ-T7
-
Metagenomic Sequencing-TGS
Metagenom minangka koleksi materi genetik saka komunitas campuran organisme, kayata metagenom lingkungan lan manungsa. Isine génom mikroorganisme sing bisa dibudidaya lan ora bisa dibudidaya. Urutan metagenomik mbisakake nyinaoni lanskap genom rumit iki sing diselehake ing conto ekologis kanthi menehi luwih saka profiling taksonomi. Uga nawakake perspektif genomik fungsional kanthi njelajah gen sing dikode lan peran putative ing proses lingkungan. Nalika pendekatan shotgun tradisional karo urutan Illumina wis akeh digunakake ing pasinaon metagenomic, tekane saka Nanopore lan PacBio long-maca urutan wis ngganti lapangan. Teknologi Nanopore lan PacBio ningkatake analisis bioinformatika hilir, utamane perakitan metagenome, njamin rakitan sing luwih terus-terusan. Laporan nuduhake yen metagenomik basis Nanopore lan PacBio wis kasil ngasilake genom bakteri lengkap lan tertutup saka mikrobioma kompleks (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). Nggabungake maca Nanopore karo maca Illumina nyedhiyakake pendekatan strategis kanggo koreksi kesalahan, nyuda akurasi rendah Nanopore. Kombinasi sinergis iki nggunakake kekuwatan saben platform urutan, menehi solusi sing kuat kanggo ngatasi watesan potensial lan ningkatake presisi lan linuwih analisis metagenomik.
Platform: Nanopore PromethION 48, Illumia lan PacBio Revio
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Gen 16S lan 18S rRNA, bebarengan karo wilayah Internal Transcribed Spacer (ITS), dadi penanda sidik jari molekul sing penting amarga kombinasi wilayah sing banget konservasi lan hiper-variabel, nggawe piranti kasebut minangka alat sing penting kanggo menehi ciri organisme prokariotik lan eukariotik. Amplifikasi lan urutan wilayah kasebut menehi pendekatan bebas isolasi kanggo nyelidiki komposisi lan keragaman mikroba ing macem-macem ekosistem. Nalika urutan Illumina biasane nargetake wilayah hypervariable cendhak kaya V3-V4 saka 16S lan ITS1, wis dituduhake manawa anotasi taksonomi sing unggul bisa ditindakake kanthi ngurutake dawa lengkap 16S, 18S, lan ITS. Pendekatan komprehensif iki ngasilake persentase sing luwih dhuwur saka urutan sing diklasifikasikake kanthi akurat, entuk tingkat resolusi sing ngluwihi identifikasi spesies. Platform sekuensing Single-Molecule Real-Time (SMRT) PacBio kanthi nyediakake bacaan dawa (HiFi) sing akurat banget sing nutupi amplikon lengkap, saingan karo presisi urutan Illumina. Kapabilitas iki ngidini peneliti entuk keuntungan sing ora cocog - tampilan panorama lanskap genetik. Jangkoan lengkap nambah resolusi ing anotasi spesies, utamane ing komunitas bakteri utawa jamur, supaya bisa ngerteni luwih jero babagan kerumitan populasi mikroba.
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
Urutan amplicon karo teknologi Illumina, khusus nargetake tandha genetik 16S, 18S, lan ITS, minangka cara sing kuat kanggo mbongkar filogeni, taksonomi, lan kelimpahan spesies ing komunitas mikroba. Pendekatan iki kalebu urutan wilayah hypervariable saka penanda genetik housekeeping. Originally dikenalaké minangka sidik jari molekul deningWoeses et aling 1977, technique iki wis revolutionized microbiome profiling dening mbisakake isolasi-free analisis. Lumantar urutan 16S (bakteri), 18S (jamur), lan Internal Transcribed Spacer (ITS, jamur), peneliti bisa ngenali ora mung spesies sing akeh banget nanging uga sing langka lan ora dingerteni. Diadopsi sacara wiyar minangka alat pivotal, urutan amplicon wis dadi instrumental kanggo mbedakake komposisi mikroba sing beda ing macem-macem lingkungan, kalebu cangkeme manungsa, usus, bangkekan, lan liya-liyane.
-
Bakteri lan Jamur Kabèh Genome Re-Sequencing
Proyèk re-sequencing kabèh-genom bakteri lan jamur minangka pivotal kanggo maju genomik mikroba kanthi ngaktifake completion lan mbandingaken genom mikroba. Iki ndadekake rekayasa fermentasi, optimalisasi proses industri, lan eksplorasi jalur metabolisme sekunder. Salajengipun, urutan ulang jamur lan bakteri penting kanggo mangerteni adaptasi lingkungan, ngoptimalake galur, lan mbukak dinamika evolusi genetik, kanthi implikasi sing wiyar ing obat, pertanian, lan ilmu lingkungan.
-
Urutan RNA Prokariotik
Urutan RNA nguatake profil lengkap kabeh transkrip RNA ing sel ing kahanan tartamtu. Teknologi mutakhir iki minangka alat sing kuat, mbukak profil ekspresi gen sing rumit, struktur gen, lan mekanisme molekuler sing ana gandhengane karo proses biologi sing beda-beda. Diadopsi sacara umum ing riset dhasar, diagnostik klinis, lan pangembangan obat, urutan RNA nawakake wawasan babagan seluk-beluk dinamika seluler lan regulasi genetik. Pangolahan sampel RNA prokariotik kita dicocogake kanggo transkriptom prokariotik, sing nglibatake penipisan rRNA lan persiapan perpustakaan arah.
Platform: Illumina NovaSeq
-
Urutan Metatranscriptome
Nggunakake teknologi urutan Illumina, layanan sekuensing metatranscriptome BMKGENE mbukak ekspresi gen dinamis saka macem-macem mikroba, kalebu eukariota nganti prokariota lan virus, ing lingkungan alam kayata lemah, banyu, segara, bangkekan, lan usus. Layanan lengkap kita menehi kekuwatan marang peneliti kanggo nyelidiki profil ekspresi gen lengkap komunitas mikroba kompleks. Ngluwihi analisis taksonomi, layanan urutan metatranscriptome kita nggampangake eksplorasi menyang pengayaan fungsional, nudhuhake gen sing ditulis kanthi beda lan perane. Temokake akeh wawasan biologi nalika sampeyan nelusuri lanskap kompleks ekspresi gen, keragaman taksonomi, lan dinamika fungsional ing macem-macem relung lingkungan kasebut.
-
Majelis Genome Jamur De novo
BMKGENE nawakake solusi serbaguna kanggo génom jamur, nyukupi kabutuhan riset sing manéka warna lan kelengkapan génom sing dikarepake. Nggunakake urutan Illumina sing diwaca cekak mung ngidini nggawe draf génom. Urutan maca cekak lan dawa maca nggunakake Nanopore utawa Pacbio digabungake kanggo génom jamur sing luwih olahan kanthi contigs sing luwih dawa. Kajaba iku, nggabungake urutan Hi-C luwih nambah kapabilitas, supaya bisa nggayuh genom tingkat kromosom sing lengkap.
-
Majelis Genome Bakteri De novo
Kita nyedhiyakake layanan perakitan genom bakteri lengkap, njamin 0 kesenjangan. Iki bisa ditindakake kanthi nggabungake teknologi urutan sing wis suwe diwaca, kayata Nanopore lan PacBio kanggo perakitan lan urutan maca cekak karo Illumina kanggo validasi perakitan lan koreksi kesalahan maca ONT. Layanan kita nyedhiyakake alur kerja bioinformatik lengkap saka perakitan, anotasi fungsional, lan analisis bioinformatik majeng, nggayuh tujuan riset tartamtu. Layanan iki ngidini pangembangan génom referensi sing tepat kanggo macem-macem studi genetik lan genom. Kajaba iku, dadi dhasar kanggo aplikasi kayata optimisasi galur, rekayasa genetika, lan pangembangan teknologi mikroba, njamin data genomik sing dipercaya lan bebas celah sing penting kanggo nambah wawasan ilmiah lan inovasi bioteknologi.
