Metatranscriptome අනුපිළිවෙල
සේවා විශේෂාංග
● rRNA ක්ෂය වීම සහ දිශානුගත mRNA පුස්තකාලය සකස් කිරීම.
● Illumina NovaSeq හි අනුපිළිවෙල.
සේවා වාසි
●සංකීර්ණ ක්ෂුද්රජීවී ප්රජාවන්ගේ වෙනස්කම් අධ්යයනය කරන්න:මෙය පිටපත් කිරීමේ මට්ටමින් සිදු වන අතර විභව නව ජාන ගවේෂණය කරයි.
●සත්කාරක හෝ පරිසරය සමඟ ක්ෂුද්රජීවී ප්රජා අන්තර්ක්රියා පැහැදිලි කිරීම.
●සවිස්තරාත්මක ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය: මෙමගින් ප්රජා වර්ගීකරණ සහ ක්රියාකාරී සංයුති මෙන්ම අවකල ජාන ප්රකාශන විශ්ලේෂණය පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දේ.
●විස්තීර්ණ ජාන විවරණ:ක්ෂුද්රජීවී ප්රජාවන්ගේ තොරතුරු ජාන ප්රකාශන තොරතුරු සඳහා යාවත්කාලීන ජාන ක්රියාකාරී දත්ත සමුදායන් භාවිතා කිරීම.
●අලෙවියෙන් පසු සහාය:අපගේ කැපවීම ව්යාපෘති නිම කිරීමෙන් ඔබ්බට මාස 3ක අලෙවියෙන් පසු සේවා කාලසීමාවක් සමඟින් විහිදේ. මෙම කාලය තුළ, අපි ව්යාපෘති පසු විපරම්, දෝශ නිරාකරණ සහාය, සහ ප්රතිඵලවලට අදාළ ඕනෑම විමසීමක් විසඳීමට ප්රශ්න සහ පිළිතුරු සැසි පිරිනමන්නෙමු.
සේවා පිරිවිතර
| අනුක්රමික වේදිකාව | අනුක්රමික උපාය මාර්ගය | නිර්දේශිත දත්ත | දත්ත තත්ත්ව පාලනය |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | Q30≥85% |
නියැදි අවශ්යතා
| සාන්ද්රණය (ng/µL) | මුළු මුදල (µg) | පරිමාව (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
සේවා වැඩ ප්රවාහය
සාම්පල භාරදීම
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
පහත විශ්ලේෂණය ඇතුළත් වේ:
● අනුක්රමික දත්ත තත්ත්ව පාලනය
● පිටපත් එකලස් කිරීම
● වර්ගීකරණ විවරණ සහ බහුලත්වය
● ක්රියාකාරී විවරණ සහ බහුලත්වය
● ප්රකාශන ප්රමාණකරණය සහ අවකල විශ්ලේෂණය
එක් එක් නියැදියේ වර්ගීකරණ ව්යාප්තිය:
බීටා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය: UPGMA
ක්රියාකාරී විවරණ - GO බහුලත්වය
අවකල වර්ගීකරණය බහුලත්වය - LEFSE
සකස් කරන ලද ප්රකාශන එකතුවක් හරහා BMKGene හි මෙටා ට්රාන්ස්ක්රිප්ටොමික්ස් අනුක්රමික සේවා මගින් පහසුකම් සපයන දියුණුව ගවේෂණය කරන්න.
Lu, Z. et al. (2023) 'බැක්ටීරොයිඩේල්ස් අනුපිළිවෙලෙහි ලැක්ටේට් භාවිත කරන බැක්ටීරියා වල අම්ල ඉවසීම ඉහළ සාන්ද්ර ආහාරයකට අනුවර්තනය වූ එළුවන්ගේ රුමිනල් ඇසිඩෝසිස් වැළැක්වීමට දායක වේ',සත්ව පෝෂණය, 14, පිටු 130-140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
ගීතය, Z. et al. (2017) 'සාම්ප්රදායික ඝණ-තත්ර පැසවීමේදී මූලික ක්රියාකාරී ක්ෂුද්රජීවය අධි-ත්රිපුට් ඇම්ප්ලිකන් සහ මෙට්රාන්ස්ක්රිප්ටොමික්ස් අනුපිළිවෙලින් ලිහා ගැනීම',ක්ෂුද්රජීව විද්යාවේ මායිම්, 8 (ජූලි). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
වැන්ග්, ඩබ්ලිව්. සහ අල්. (2022) 'Fytopathogenic Alternaria දිලීරයේ Metatranscriptomics සමීක්ෂණයකින් නව Mycoviruses සොයා ගන්නා ලදී',වෛරස්, 14(11), පි. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'සමාන්තර පාරදෘශ්ය විශ්ලේෂණ මගින් කුරුමිණියන් සහ ඔවුන්ගේ අන්ත්ර සහජීවීන් මගින් ශාක ද්විතියික පරිවෘත්තීය ක්ෂය වීම හෙළි කරයි',අණුක පරිසර විද්යාව, 31(15), පි. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
