-
Dilyniannu Genom De novo Planhigion/Anifeiliaid
De novomae dilyniannu yn cyfeirio at adeiladu genom cyfan rhywogaeth gan ddefnyddio technolegau dilyniannu, ee PacBio, Nanopore, NGS, ac ati, yn absenoldeb genom cyfeirio.Mae'r gwelliant rhyfeddol yn hyd darllen technolegau dilyniannu trydydd cenhedlaeth wedi dod â chyfleoedd newydd wrth gydosod genomau cymhleth, megis y rhai â heterozygosity uchel, cymhareb uchel o ranbarthau ailadroddus, polyploidau, ac ati. Gyda hyd darllen ar lefel degau o kilobases, mae'r darlleniadau dilyniannu hyn yn galluogi datrys elfennau ailadroddus, rhanbarthau â chynnwys GC annormal a rhanbarthau hynod gymhleth eraill.
Llwyfan: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Cynulliad Genom wedi'i seilio ar Hi-C
Mae Hi-C yn ddull sydd wedi'i gynllunio i ddal cyfluniad cromosomau trwy gyfuno rhyngweithiadau treiddgar yn seiliedig ar agosrwydd a dilyniannu trwybwn uchel.Credir bod cydberthynas negyddol rhwng dwyster y rhyngweithiadau hyn a phellter ffisegol ar gromosomau.Felly, gallai data Hi-C arwain clystyru, trefnu a chyfeiriannu dilyniannau wedi'u cydosod mewn genom drafft ac angori'r rheini ar nifer penodol o gromosomau.Mae'r dechnoleg hon yn grymuso cynulliad genom ar lefel cromosom yn absenoldeb map genetig sy'n seiliedig ar boblogaeth.Mae angen Hi-C ar bob genom.
Llwyfan: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Geneteg Esblygiadol
Mae geneteg esblygiadol yn wasanaeth dilyniannu llawn a gynlluniwyd ar gyfer darparu dehongliad cynhwysfawr o wybodaeth esblygiadol o ddeunyddiau penodol yn seiliedig ar amrywiadau genetig, gan gynnwys SNPs, InDels, SVs a CNVs.Mae'n darparu'r holl ddadansoddiad sylfaenol sy'n ofynnol ar gyfer disgrifio newidiadau esblygiadol a nodweddion genetig poblogaethau, megis strwythur poblogaeth, amrywiaeth genetig, perthnasoedd ffylogeni, ac ati Mae hefyd yn cynnwys astudiaethau ar lif genynnau, sy'n grymuso amcangyfrif maint poblogaeth effeithiol, amser dargyfeirio.
-
Genomeg Gymharol
Mae genomeg gymharol yn llythrennol yn golygu cymharu dilyniannau genomau cyflawn a strwythurau gwahanol rywogaethau.Nod y ddisgyblaeth hon yw datgelu esblygiad rhywogaethau, swyddogaeth genynnau, mecanwaith rheoleiddio genynnau ar lefel genom trwy nodi'r strwythurau dilyniant a'r elfennau a warchododd neu a wahaniaethodd ar draws gwahanol rywogaethau.Mae astudiaeth genomeg gymharol nodweddiadol yn cynnwys dadansoddiadau o deulu genynnau, datblygiad esblygiadol, dyblygu genom cyfan, pwysau dethol, ac ati.
-
Dadansoddiad Arwahanol Swmpus
Mae dadansoddiad arwahanyddion swmpus (BSA) yn dechneg a ddefnyddir i nodi marcwyr genetig cysylltiedig â ffenoteip yn gyflym.Mae prif lif gwaith BSA yn cynnwys dewis dau grŵp o unigolion â ffenoteipiau hynod wrthwynebol, gan gyfuno DNA pob unigolyn i ffurfio dau swmp o DNA, gan nodi dilyniannau gwahaniaethol rhwng dau bwll.Defnyddiwyd y dechneg hon yn helaeth i nodi marcwyr genetig a gysylltir yn gryf gan enynnau wedi'u targedu mewn genomau planhigion/anifeiliaid.
