-
Tutuwuhan / Sato De novo Génom Sequencing
De novosequencing nujul kana pangwangunan sakabéh génom spésiés ngagunakeun téhnologi sequencing, misalna PacBio, Nanopore, NGS, jsb, dina henteuna génom rujukan.Perbaikan anu luar biasa dina panjang baca téknologi sequencing generasi katilu geus mawa kasempetan anyar dina assembling génom kompléks, kayaning jalma kalawan heterozygosity tinggi, rasio luhur wewengkon repetitive, polyploids, jsb Kalawan panjang dibaca dina tingkat puluhan kilobases, sequencing ieu maca ngamungkinkeun. ngarengsekeun elemen repetitive, wewengkon kalawan eusi GC abnormal jeung wewengkon kacida kompléks séjénna.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Hi-C dumasar Génom Majelis
Hi-C mangrupikeun metode anu dirancang pikeun nangkep konfigurasi kromosom ku cara ngahijikeun interaksi dumasar-deukeut probing sareng urutan throughput tinggi.Inténsitas interaksi ieu dipercaya aya hubunganana négatip sareng jarak fisik dina kromosom.Ku alatan éta, data Hi-C bisa pituduh clustering, susunan jeung orienting runtuyan dirakit dina draf génom sarta anchoring maranéhanana kana jumlah tangtu kromosom.Téknologi ieu nguatkeun rakitan génom tingkat kromosom dina henteuna peta genetik dumasar populasi.Unggal génom tunggal peryogi Hi-C.
Platform: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Genetika évolusionér
Genetika évolusionér nyaéta layanan sequencing dipak dirancang pikeun nyadiakeun interpretasi komprehensif on évolusionér informasi bahan dibikeun dumasar kana variasi genetik, kaasup SNPs, InDels, SVs na CNVs.Eta nyadiakeun sagala analisis fundamental diperlukeun pikeun ngajéntrékeun parobahan évolusionér jeung fitur genetik populasi, kayaning struktur populasi, diversity genetik, hubungan filogén, jsb Ieu ogé ngandung studi on aliran gén, nu empowers estimasi ukuran populasi éféktif, divergence waktos.
-
Génomics komparatif
Génomi komparatif sacara harfiah ngandung harti ngabandingkeun runtuyan génom lengkep jeung struktur spésiés béda.Disiplin ieu boga tujuan pikeun nembongkeun évolusi spésiés, fungsi gén, mékanisme pangaturan gén dina tingkat génom ku cara ngaidentipikasi struktur runtuyan jeung elemen anu dilestarikan atawa dibédakeun sakuliah spésiés béda.Ulikan génomics komparatif has ngawengku analisa dina kulawarga gén, ngembangkeun évolusionér, duplikasi génom sakabeh, tekanan selektif, jsb.
-
Analisis Segregant Bulked
Analisis segregant Bulked (BSA) mangrupikeun téknik anu dianggo pikeun gancang ngaidentipikasi fénotip spidol genetik anu aya hubunganana.Alur kerja utama BSA ngandung milih dua kelompok individu sareng fenotipe anu kontras pisan, ngahijikeun DNA sadaya individu pikeun ngabentuk dua bulk DNA, ngaidentipikasi sekuen diferensial antara dua kolam renang.Téhnik ieu parantos dianggo sacara éksténsif dina ngaidentipikasi spidol genetik anu dikaitkeun pisan ku gén anu dituju dina génom tutuwuhan/sato.
