mRNA-seq (NGS) bi genoma referansê
RNA-seq amrazek standard e li seranserê zanistên jiyan û çandiniyê, ku pira di navbera genom û proteoman de vedike. Hêza wê di kifşkirina transkrîptên nû û pîvandina îfadeya wan di yek ceribandinê de ye. Ew bi berfirehî ji bo lêkolînên transkrîptomîk ên berawirdî tê bikar anîn, ronîkirina genên têkildarî taybetmendî an fenotipên cûda, mîna berawirdkirina mutantan bi celebên kovî an eşkerekirina îfadeya genan di bin şert û mercên taybetî de. APP-ya mRNA (Reference) ya BMKCloud pîvandina îfadeyê, analîza îfadeya cûda (DEG), û analîzên avahiya rêzê di nav lûleya biyoenformatîkê ya mRNA-seq (NGS) de entegre dike û hêzên nermalava wekhev dike yek, rehetî û dostaniya bikarhêner-bikarhêner misoger dike. Bikarhêner dikarin daneyên xwe yên RNA-seq bar bikin ewr, li wir Serlêdan çareseriyek analîza biyoenformatîkî ya yek-rawestî ya berfireh pêşkêşî dike. Wekî din, ew ezmûna xerîdar dide pêşîniyê, operasyonên kesane yên ku li gorî hewcedariyên taybetî yên bikarhêneran hatine çêkirin pêşkêş dike. Bikarhêner dikarin parametreyan destnîşan bikin û mîsyona boriyê bi xwe bişînin, rapora înteraktîf kontrol bikin, daneyan/diagraman bibînin û lêkolîna daneyan temam bikin, wek: hilbijartina gena hedef, komkirina fonksiyonel, diyagramkirin, û hwd.
Rawesta axaftevan:Illumina, MGI
Stratejîk:RNA-Seq
Rêz: Daneyên hevgirtî, daneyên paqij.
Tîpa pirtûkxaneyê:fr-bêtevlî, fr-tevlîya yekem an fr-tevlîya duyem
Dirêjahiya xwendinê:150 bp
Cureyê pelê:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz an jî *.fq.gz. Sîstem wêpelên .fastq li gorî navên pelên xwe bixweber hevber bikin,mînak *_1.fastq bi *._2.fastq re hatiye hevber kirin.
Hejmara nimûneyan:Ti sînorkirin li ser hejmarê tuneji nimûneyan, lê dema analîzê dê zêde bibe ji ber ku hejmaranimûne mezin dibin.
Mîqdara Daneyên Pêşniyarkirî:6G ji bo her nimûneyê
