-
Analyza Komeleya Genome-wide
Lêkolîna komeleya berfireh a genomê (GWAS) armanc dike ku celebên genetîkî (jenotip) yên ku bi taybetmendiyên taybetî (fenotip) re têkildar in nas bike.Lêkolîna GWAS li ser nîşankerên genetîkî li seranserê genomê ya hejmareke mezin a kesan lêkolîn dike û ji hêla analîzên statîstîkî ve di asta nifûsê de têkiliyên genotype-fenotip pêşbîn dike.Ew bi berfirehî di lêkolînên li ser nexweşiyên mirovî û genên fonksiyonel ên li ser taybetmendiyên tevlihev ên heywanan an nebatan de hatî bikar anîn.
-
Rêzkirina ARNyê ya yek-nok
Pêşkeftina di girtina yek hucreyê de û teknîka avakirina pirtûkxaneyê ya kesane ya ku bi rêzgirtina berbelav-bilind re têkildar dibe destûr dide lêkolînên vegotina genê li ser bingeha şaneyek-hucre.Ew analîzek pergalê ya kûrtir û bêkêmasî li ser nifûsên hucreyên tevlihev dike, ku tê de ew bi giranî ji maskkirina heterojeniya wan bi girtina navînî ya hemî hucreyan dûr dikeve.
Lêbelê, hin şaneyên ne guncaw in ku di nav suspensiona yek-hucreyê de bêne çêkirin, ji ber vê yekê rêbazên din ên amadekirina nimûneyê - derxistina navokê ji tevnvîsan hewce ne, ango, navok rasterast ji tevn an şaneyê tê derxistin û ji bo yek-nukleusê tê amadekirin. rêza şaneyê.
BMK karûbarê rêzgirtina RNA ya yek-hucreyê ya 10× Genomics ChromiumTM peyda dike.Ev karûbar bi berfirehî di lêkolînên li ser lêkolînên têkildarî nexweşiyê de, wekî cihêrengiya hucreya berevaniyê, heterojeniya tumor, pêşkeftina tevnvî, hwd, bi berfirehî hatî bikar anîn.
Çîpa transkrîptoma cihî: 10× Genomîk
Platform: Platforma Illumina NovaSeq
-
Plant / Animal Tevahiya Genom Sequencing
Ji nû ve rêzgirtina tevaya genomê, ku wekî WGS jî tê zanîn, hem mutasyonên hevpar û hem jî yên nadir li ser tevahiya genomê di nav wan de Polîmorfîzma Yekane Nukleotide (SNP), Jêbirina Tevgerê (InDel), Guhertoya Strukturê (SV), û Guherîna Hejmara Kopî (CNV) dide xuyakirin. ).SV ji SNP-an beşek mezin a bingeha guherînê pêk tînin û bandorek mezin li ser genomê dikin, ku bandorek girîng li ser organîzmayên zindî dike.Veguhastina dirêj-xwendin rê dide naskirina rasttir a perçeyên mezin û guheztinên tevlihev ji ber ku xwendina dirêj derbaskirina kromozomî li ser deverên tevlihev ên wekî dûbarekirina hevdemî, herêmên dewlemend-GC/AT, û herêmên hîper-guhêrbar pir hêsantir dike.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Transcriptome Cihanî
Rêxistinkirina mekanî ya hucreyan di pêvajoyên cihêreng ên biyolojîkî de, wek înfiltrasyona parastinê, pêşkeftina embrîyoyê, hwd. de rolek girîng dilîze. Rêzkirina transkrîptoma mekan, ku profîla îfadeya genê destnîşan dike dema ku agahdariya pozîsyona cîhê digire, di mîmariya tevnvîsê ya asta transkrîptomê de nihêrînên mezin peyda kiriye.Bi pêşkeftina teknolojiyê re, pêdivî ye ku morfolojiya tevna ultra-zelal û cûdahiya strukturî ya rastîn a vegotina molekulê ya cîhê bi vebijarka bilindtir were lêkolîn kirin.BMKGENE ji nimûneyan heya têgihiştinên biyolojîkî karûbarê rêzgirtina transkriptomeya mekan a berfereh, yek-stop peyda dike.
Teknolojiyên transkriptomîk ên mekanî bi çareserkirina profîla vegotina genê bi naveroka mekanî di nimûneyên heterojen de perspektîfên nû di qada lêkolînê ya cihêreng de hêz da.
Çîpa transkrîptoma cihî: BMKMANU S1000
Platform: Platforma Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Visium Spatial Gene Expression teknolojiyek rêzgirtina transkriptomeya mekanî ya sereke ye ku ji bo dabeşkirina tevne li ser bingeha mRNA ya tevahî ye.Tevahiya transkrîptomê bi çarçoweya morfolojîk re nexşe bikin da ku têgihîştinên nû yên li ser pêşkeftina normal, patholojiya nexweşiyê, û lêkolîna wergerandina klînîkî bibînin.BMKGENE ji nimûneyan heya têgihiştinên biyolojîkî karûbarê rêzgirtina transkriptomeya mekan a berfereh, yek-stop peyda dike.
Teknolojiyên transkriptomîk ên mekanî bi çareserkirina profîla vegotina genê bi naveroka mekanî di nimûneyên heterojen de perspektîfên nû di qada lêkolînê ya cihêreng de hêz kirin..
Çîpa transkrîptoma cihî: 10x Genomics Visium
Rawesta axaftevan:Platforma Illumina NovaSeq
-
Rêzkirina mRNA ya Tev-Deng-Nanopore
Rêzkirina ARN-ê ji bo analîza transkriptomeya berfireh alavek hêja ye.Bê guman, rêzikên kevneşopî yên kurt-xwendina li vir gelek pêşkeftinên girîng bi dest xistin.Digel vê yekê, ew bi gelemperî di nasnameyên îsoformê yên tev-dirêj de, hejmarkirin, biasiya PCR de bi tixûban re rû bi rû dimîne.
Rêzkirina nanoporê xwe ji platformên din ên rêzgirtinê vediqetîne, ji ber ku nukleotîd rasterast bêyî senteza ADNyê têne xwendin û xwendina dirêj bi deh kîlobazan çêdike.Ev hêz dide xwendina rasterast a ku ji transkrîptên tev-dirêj derbas dibe û di lêkolînên asta isoformê de kêşeyan çareser dike.
Rawesta axaftevan：Nanopore PromethION
Pirtûkxane:cDNA-PCR
-
Rêzkirina mRNA ya tev-dirêj -PacBio
De novorêziknameya transkriptome ya tev-dirêj, ku wekî din jî tê zanînDe novoIso-Seq di dirêjahiya xwendinê de avantajên rêzkerê PacBio digire, ku rê dide molekulên cDNA-ya tev-dirêj bê şikestin.Ev bi tevahî ji xeletiyên ku di gavên berhevkirina transkrîptê de têne hilberandin dûr disekine û bi çareseriya asta isoformê komek unigene ava dike.Ev komên unigene di asta transkrîptomê de agahdariya genetîkî ya hêzdar wekî "genoma referansê" peyda dike.Digel vê yekê, digel daneya rêzgirtina nifşê din, ev karûbar pîvanek rast a îfadeya asta isoformê hêz dike.
Platform: PacBio Sequel IIPirtûkxane: Pirtûkxaneya bell SMRT -
Rêzkirina mRNA-ya Eukaryotî-Illumina
Rêzkirina mRNA rê dide profîla hemî mRNAyên ku di bin şert û mercên taybetî de ji hucreyan hatine transkript kirin.Ew teknolojiyek hêzdar e ku ji bo eşkerekirina profîla vegotina genê, strukturên genê û mekanîzmayên molekulî yên hin pêvajoyên biyolojîkî ye.Heya nuha, rêzgirtina mRNA bi berfirehî di lêkolîna bingehîn, tespîtkirina klînîkî, pêşkeftina dermanan, hwd de tê bikar anîn.
Platform: Platforma Illumina NovaSeq
-
Rêzkirin-Illumina mRNA-ya ne-çavkanî
Rêzkirina mRNA teknîka rêzgirtinê ya nifşê din (NGS) dipejirîne da ku RNA-ya peyamber (mRNA) ji Eukaryote di heyama taybetî ya ku hin fonksiyonên taybetî çalak dikin de bigire.Veguhastina herî dirêj a ku jê re tê gotin 'Unigene' bû û wekî rêzika referansê ji bo analîza paşîn hate bikar anîn, ku ev yek amûrek bi bandor e ji bo lêkolîna mekanîzmaya molekulî û tora birêkûpêk a celebê bêyî referans.
Piştî kombûna daneya transkrîptomê û annotasyona fonksiyonel a yekgene
(1) Analîza SSR, pêşbîniya CDS û strukturên genê dê pêşde werin çêkirin.
(2) Di her nimûneyê de hêjmarkirina îfadeya yekgene dê were kirin.
(3) Di navbera nimûneyan (an koman) de yekjenên bi rengek cûda têne diyar kirin dê li ser bingeha vegotina yekjenê bêne kifş kirin
(4) Dê berhevkirin, annotasyona fonksiyonel û analîza dewlemendkirina yekjenên ku bi rengek cûda têne diyar kirin bêne kirin
-
Rêzkirina ne-kodkirina dirêj-Illumina
ARN-yên ne-kodker ên dirêj (lncRNA) celebek molekulên ARNyê yên bi dirêjahiya 200 nt e, ku ji hêla potansiyela kodkirina pir kêm ve têne diyar kirin.LncRNA, wekî endamek sereke di RNAyên ne-kodkirî de, bi giranî di navok û plazmayê de tê dîtin.Pêşkeftina di teknolojiya rêzgirtinê û bioinformtîkê de dihêle ku gelek lncRNA-yên nû werin nas kirin û wan bi fonksiyonên biyolojîkî re têkildar bikin.Delîlên berhevkirî destnîşan dikin ku lncRNA bi berfirehî di rêziknameya epigenetîk, rêziknameya veguheztinê û rêziknameya post-veguheztinê de têkildar e.
-
Rêzkirina RNA ya piçûk-Illumina
RNA-ya piçûk çînek molekulên ARN-ê yên ne-kodkirî vedibêje ku bi gelemperî dirêjahiya wan ji 200nt kêmtir e, di nav de RNA mîkro (miRNA), RNA-ya destwerdana piçûk (siRNA), û RNA-ya ku bi piwi-têkilî (piRNA) ve girêdayî ye.
MicroRNA (miRNA) çînek ARN-ya piçûk a endojen e ku dirêjahiya wê nêzî 20-24nt ye, ku di şaneyan de gelek rolên rêziknameyê yên girîng dilîze.miRNA di gelek pêvajoyên jiyanê de ku tevnek - taybetî û qonax - îfadeya taybetî eşkere dike û di celebên cûda de pir têne parastin.
-
Rêzkirina circRNA-Illumina
CircRNA (ARN-yên dorveger) yek çînek molekulên ARN-ê yên ne-kodkirî ne ku ji 5 'kapa dawî û 3' dûvika polî(A) ya dawî ne.CircRNA ji hêla girêdana kovalentî ve ku li dijî digestiya RNA exonukleazê statûya dorhêl pêk tîne.circRNA di mezinbûn û pêşkeftina zîndeweran û berxwedana wan a li hember jîngeha derve de rolek girîng dilîze.
CircRNA gelek fonksiyonên xwe hene, ku dikarin bi pêşbazî miRNA girêdin, fonksiyona rêkûpêk a ceRNA-yê bixebitînin, da ku vegotina genê birêkûpêk bikin.Di salên dawî de, her weha hate dîtin ku ew ji nêz ve bi rûdan û pêşkeftina nexweşiyan re têkildar e, û di warê nîşankerên tespîtkirina nexweşiyê û hwd de xwedan perspektîfên serîlêdana mezin e.
