De novo Meclîsa Genome Bakterî
Em xizmeteke komkirina genoma bakteriyan a temam peyda dikin, ku 0 valahî garantî dike. Ev bi entegrekirina teknolojiyên rêzkirina xwendina dirêj, wekî Nanopore û PacBio ji bo komkirinê û rêzkirina xwendina kurt bi Illumina re ji bo pejirandina komkirinê û rastkirina xeletiyên xwendinên ONT mimkun e. Xizmeta me herikîna xebata biyoenformatîk a temam ji komkirinê, şîrovekirina fonksiyonel, û analîza biyoenformatîk a pêşkeftî peyda dike, ku armancên lêkolînê yên taybetî pêk tîne. Ev xizmet ji bo cûrbecûr lêkolînên genetîkî û genomîk pêşxistina genomên referansê yên rast gengaz dike. Wekî din, ew bingeha sepanên wekî çêtirkirina cureyan, endezyariya genetîkî, û pêşkeftina teknolojiya mîkrobî pêk tîne, daneyên genomîk ên pêbawer û bê valahî peyda dike ku ji bo pêşvebirina têgihîştinên zanistî û nûjeniya biyoteknolojîk girîng in.
Taybetmendiyên Xizmetê
● Li gorî asta temambûna genomê ya xwestî, du vebijarkên gengaz hene ku meriv ji wan hilbijêre.
● Vebijêrka Genomê ya Pêşnûmeyê: Rêzkirina xwendina kurt bi Illumina NovaSeq PE150.
● Genomê 0 valahiya temam bike.
● Rêzkirina xwendina dirêj li ser Nanopore PromethION 48 an PacBio Revio ji bo komkirina genomê.
● Rêzkirina xwendina kurt li ser Illumina NovaSeq ji bo piştrastkirina genomê û rastkirina xeletiyan (Nanopore) an jî ji bo çêkirina genomek pêşnûme.
Avantajên Xizmetê
●Genomê Sifir-Gap GarantikirîEv ji ber entegrekirina rêzkirina Illumina bi rêzkirina xwendina dirêj (Nanopore an PacBio) ye.
●Herikîna Xebatê ya Biyoenformatîkê ya Temam:Ev yek civandina genomê û pêşbînîkirina gelek hêmanên genomîk, şîrovekirina genên fonksiyonel, û dîtbarîkirina genomê wekî nexşeya Circos vedihewîne.
●Pisporiya BerfirehBMKGENE, bi zêdetirî 20,000 genomên mîkrobî yên komkirî, zêdetirî deh sal ezmûn, tîmek analîzê ya pir jêhatî, naveroka berfireh, û piştgiriya piştî firotanê ya hêja tîne.
●Piştgiriya Piştî Firotanê:Pabendbûna me ji temamkirina projeyê û pê ve jî bi heyameke xizmeta piştî firotanê ya 3 mehan berdewam dike. Di vê demê de, em şopandina projeyê, alîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û rûniştinên Pirs û Bersîvê pêşkêş dikin da ku pirsên têkildarî encaman çareser bikin.
●Gelek Stratejiyên Rêzkirinê yên Berdest:Ji bo armancên lêkolînê yên cûda û pêdiviyên temambûna genomê.
Taybetmendiyên Xizmetê
| Xizmetkar | Stratejiya Rêzkirinê |
| Genomê Pêşnûmeyê | Illumina PE150 100x |
| 0 Genoma Gap | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (vebijarkî) |
Pêdiviyên Nimûneyê:
| Têkelbûn (ng/µL) | Tevahî mîqdar (µg) | Qebare (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Bakterî: ≥3.5x1010 şaneyan
Herikîna Karê Xizmetê
Radestkirina nimûneyê
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîza daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Analîza jêrîn vedihewîne:
● Kontrolkirina Kalîteya Daneyan a Rêzkirinê
● Komkirina Genomê
● Analîza Pêkhateya Genomê: Pêşbînîkirina CDS û gelek hêmanên genomîk
● Têbînîkirina fonksiyonel bi gelek databasên giştî (GO, KEGG, hwd.) û databasên pêşketî (CARD, VFDB, hwd.)
● Dîtbarîkirina Genomê
Em genomê bi formata fasta ya ku bi hêsanî gihîştî ye û pelê şîrovekirina genomê (gff) peyda dikin.
Anotasyona genê – GO
Anotasyona genê - Karbohîdratên CAZY
Dîtbarîkirina Genomê - Circos plot
Bi rêya berhevokeke weşanên bijartî, pêşketinên ku ji hêla xizmetên komkirina genoma bakteriyan ên BMKGene ve têne hêsankirin, vekolin.
Dai, W. û yên din (2023) 'Vedîtina Bacteroides uniformis F18-22 wekî Bakteriyek Probiyotîk a Ewle û Nû ji bo Dermankirina Kolîta Ûlseratîf ji Kolona Mirovî ya Saxlem',Kovara Navneteweyî ya Zanistên Molekulî, 24(19), r. 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1.
Kang, Q. û yên din (2021) 'Îzolatên Proteus mirabilis ên pir-dermanberxwedêr ên ku blaOXA-1 û blaNDM-1 ji jiyana kovî ya li Çînê hildigirin: xetera tenduristiya giştî zêde dibe',Zoolojiya Yekgirtî, 16(6), rûpel 798–809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
Wang, TT û yên din (2017) 'Rêzeya genoma temam a endofît Bacillus flexus KLBMP 4941 mekanîzmaya pêşvebirina mezinbûna nebatan û bingeha genetîkî ya ji bo toleransa xwêyê eşkere dike',Kovara Biyoteknolojiyê, 260, rûp 38–41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
Wang, X. û yên din (2021) 'Plazmîdên Berxwedana Pir-Replîkonê yên Klebsiella Belavbûna Berfireh a Genên Antîmîkrobî Navbeynkar Dikin',Sînorên di Mîkrobiolojiyê de, 12, rûp. 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.
