Têketina BMKCloud

Berhem

Genetîka Pêşketinî

Genetîka Pêşketinê xizmeteke rêzkirinê ya berfireh e ku ji bo pêşkêşkirina şîrovekirineke têgihîştî ya pêşketinê di nav komeke mezin a kesan de, li ser bingeha guhertoyên genetîkî, di nav de SNP, InDels, SV, û CNV, hatiye sêwirandin. Ev xizmet hemû analîzên bingehîn ên ku ji bo ronîkirina guhertinên pêşketinê û taybetmendiyên genetîkî yên nifûsan hewce ne, dihewîne, di nav de nirxandinên avahiya nifûsê, cihêrengiya genetîkî, û têkiliyên fîlojenetîk. Wekî din, ew li lêkolînên li ser herikîna genan kûr dibe, û texmînên mezinahiya nifûsê ya bi bandor û dema cudabûnê gengaz dike. Lêkolînên genetîkî yên pêşketinê têgihiştinên hêja li ser eslê û adaptasyonên cureyan peyda dikin.

Li BMKGENE, em du rêyan ji bo lêkolînên genetîka pêşketinî li ser nifûsên mezin pêşkêş dikin: bikaranîna rêzkirina tevahî-genomê (WGS) an jî hilbijartina rêbaza rêzkirina genomê ya bi temsîliyeta kêmkirî, ango Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) ya ku di hundirê şîrketê de hatiye pêşxistin. Her çend WGS ji bo genomên piçûktir minasib be jî, SLAF wekî alternatîfek lêçûn-bandor derdikeve holê ji bo lêkolîna nifûsên mezintir bi genomên dirêjtir, bi bandor lêçûnên rêzkirina kêm dike.

Paqij bûn

Agahiyên Xizmetê

Bîyoenformatîk

Encamên Demo

Weşanên sereke

Avantajên Xizmetê

Takagi û yên din,Rojnameya nebatan, 2013

●Analîza biyoenformatîkî ya berfireh:gengazkirina texmînkirina cihêrengiya genetîkî, ku potansiyela pêşketinî ya cureyan nîşan dide, û eşkerekirina têkiliyek fîlojenetîk a pêbawer di navbera cureyan de bi bandora herî kêmkirî ya pêşketina konverjant û pêşketina paralel.

●Analîza xwerû ya bijarte: wekî texmîna dem û leza cudabûnê li gorî guherînên di asta nukleotîd û asîdên amînî de.

●Qeydên Pisporî û Weşanê yên BerfirehBMKGene zêdetirî 15 salan di projeyên genetîka nifûs û pêşketinî de ezmûneke mezin berhev kiriye, bi hezaran cureyan û hwd. vedihewîne û beşdarî zêdetirî 1000 projeyên asta bilind bûye ku di Nature Communications, Molecular Plants, Plant Biotechnology Journal û hwd. de hatine weşandin.

● Tîmeke biyoenformatîkê ya pir jêhatî û çerxeke analîzê ya kurtTîma BMKGene, bi ezmûneke mezin di analîza genomîk a pêşketî de, analîzên berfireh di demek kurt de pêşkêş dike.

● Piştgiriya Piştî Firotanê:Pabendbûna me ji temamkirina projeyê û pê ve jî bi heyameke xizmeta piştî firotanê ya 3 mehan berdewam dike. Di vê demê de, em şopandina projeyê, alîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û rûniştinên Pirs û Bersîvê pêşkêş dikin da ku pirsên têkildarî encaman çareser bikin.

Taybetmendiyên Xizmetê û Pêdiviyên

Cureyê rêzkirinê

Pîvana nifûsê ya pêşniyarkirî

Stratejiya rêzkirinê

Pêdiviyên nukleotîdê

Rêzkirina Tevahiya Genomê

≥ 30 kes, bi ≥ 10 kes ji her binkomê

10x

Têkelbûn: ≥ 1 ng/ µL

Tevahî mîqdar ≥ 30ng

Hilweşîn an gemarîbûn bi sînor an tune ye

Parçeya Zêdekirî ya Cihê Taybet (SLAF)

Kûrahiya etîketê:

10x

Hejmara etîketan:

<400 Mb: WGS tê pêşniyarkirin

<1Gb: 100K etîket

1Gb

>2Gb: 300K etîket

Herî zêde 500 hezar etîket

Têkelbûn ≥ 5 ng/µL

Tevahî mîqdar ≥ 80 ng

Nanodrop OD260/280=1.6-2.5

Jela Agarozê: hilweşîn an gemarîbûn tune ye an jî bi sînor e

Herikîna Karê Xizmetê

Sêwirana ceribandinê

Radestkirina nimûneyê

Avakirina pirtûkxaneyê

Rêzkirin

Analîza daneyan

Xizmetên piştî firotanê

Pêşî: Analîza Veqetandî ya Girseyî

Piştî: Metabolomîk

Xizmet analîza avahiya nifûsê (dara fîlojenetîk, PCA, nexşeya stratifîkasyona nifûsê), cihêrengiya nifûsê, û hilbijartina nifûsê (nehevsengiya girêdanê, hilbijartina bijartî ya cihên sûdmend) vedihewîne. Xizmet dikare analîza xwerû jî vedihewîne (mînak dema cudabûnê, herikîna genan).

*Encamên demo yên li vir têne nîşandan hemî ji genomên ku bi BMKGENE hatine weşandin in.

1. Analîza pêşveçûnê avakirina dara fîlojenetîk, avahiya nifûsê û PCA li ser bingeha guhertoyên genetîkî vedihewîne.

Dara fîlojenetîk têkiliyên taksonomîk û pêşketinî yên di navbera cureyên ku bav û kalên wan ên hevpar hene de nîşan dide.
PCA armanc dike ku nêzîkbûna di navbera jêr-nifûsan de xeyal bike.
Pêkhateya nifûsê hebûna bin-nifûsên ji hêla genetîkî ve cuda ji hêla frekansên alelê ve nîşan dide.

3-1Dara-fîlojenetîk 3-2PCA 3-3Avahiya-nifûsê

Chen û yên din,PNAS, 2020

2. Paqijkirina bijartî

Paqijkirina bijartî behsa pêvajoyekê dike ku tê de cihekî sûdmend tê hilbijartin û frekansên cihên bêalî yên girêdayî zêde dibin û yên cihên negirêdayî kêm dibin, ku di encamê de frekansên herêmî kêm dibin.

Tesbîtkirina tevahiya genomê li ser herêmên paqijkirinê yên bijartî bi hesabkirina endeksa genetîkî ya nifûsê (π, Fst, Tajima's D) ya hemî SNP-yan di nav pencereyek xêzker (100 Kb) de di gaveke diyarkirî de (10 Kb) tê pêvajokirin.

Cûrbecûrîya nukleotîdan (π)
4Cûrbecûrîya nukleotîdê (π)

D ya Tajima
5Tajima's-D

Îndeksa Sabîtbûnê (Fst)

6Indeksa Sabîtkirinê (Fst)

Wu û yên din,Nebata Molekulî, 2018

3. Herikîna Genê

7Herikîna Genê

Wu û yên din,Nebata Molekulî, 2018

4. Dîroka Demografîk

8 Dîroka Demografîk

Zhang û yên din,Ekolojiya Xwezayê û Pêşveçûn, 2021

5. Dema cudabûnê

9Dema cudabûnê

Zhang û yên din,Ekolojiya Xwezayê û Pêşveçûn, 2021

Bi rêya berhevokeke weşanên bijartî, pêşketinên ku ji hêla xizmetên genetîka pêşketinî ya BMKGene ve têne hêsankirin, vekolin:

Hassanyar, AK û yên din (2023) 'Vedîtina Nîşankerên Molekulî yên SNP û Genên Namzed ên Têkildarî Berxwedana Vîrusa Sacbrood di Larvayên Apis cerana cerana de bi Rêzkirina Ji Nû Ve ya Tevahiya Genomê',Kovara Navneteweyî ya Zanistên Molekulî, 24(7). doi: 10.3390/IJMS24076238.

Chai, J. û yên din (2022) 'Vedîtina salamanderek mezin a Çînî ya kovî û ji hêla genetîkî ve paqij derfetên parastinê yên nû diafirîne',Lêkolîna Zoolojîk, 2022, Cild 43, Hejmar 3, Rûpel: 469-480, 43(3), r. 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.

Han, M. û yên din (2022) 'Şêweya Fîlogeografîk û Dîroka Pêşveçûna Gelheyê ya Elymus sibiricus L. ya Xwecihî li Deşta Qinghai-Tîbetê',Sînorên Zanista Nebatan, 13, r. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.

Wang, J. û yên din. (2022) 'Nêrînên genomîk li ser pêşveçûna longan ji kombûna genoma asta kromozom û genomîkên nifûsê yên gihîştina longan',Lêkolîna Baxçevaniyê, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.