Pirtûkxaneyên pêş-çêkirî yên Illumina
Taybetmendî
●Platform:Illumina NovaSeq 6000 û NovaSeq X Plus
●Modên rêzkirinê:PE150 û PE250
●Kontrolkirina kalîteyê ya pirtûkxaneyan berî rêzkirinê
●Daneyên rêzkirinê QC û radestkirin:radestkirina rapora QC û daneyên xav di formata fastq de piştî demultiplexkirin û fîlterkirina xwendinên Q30
Avantajên Xizmetê
●Pirrengiya xizmetên rêzkirinê:xerîdar dikare li gorî rê, şaneya herikînê, an jî li gorî mîqdara daneyên pêwîst (rêzkirina qismî ya rê) rêz bike.
●Ezmûneke berfireh li ser platforma rêzkirina Illumina:bi hezaran projeyên girtî yên bi cureyên cûrbecûr.
●Radestkirina rapora QC ya rêzkirinê:bi metrîkên kalîteyê, rastbûna daneyan û performansa giştî ya projeya rêzkirinê re.
●Pêvajoya rêzkirina gihîştî:bi dema vegerandina kurt.
●Kontrola Kalîteyê ya Bi Hişkî: em şertên QC-ê yên hişk bicîh tînin da ku radestkirina encamên bi domdarî yên bi kalîte bilind garantî bikin.
Platformên Nimûne
| Rawesta axaftevan | Hucreya Herikînê | Moda rêzkirinê | Yekbûn | Derana texmînkirî |
| NovaSeq X | 10B (8 şerî) | PE150 | Rêya Yekane Rêya Qismî | 375Gb / Rê |
| 25B (8 şerî) | PE150 | Rêya Yekane Rêya Qismî | 1000 Gb/Lane | |
| NovaSeq 6000 | Hucreya herikîna SP (2 rêz) | PE250 | Hucreya Herikînê Rêya Yekane Rêya Qismî | 325-400 M xwendin / Rê |
| Hucreya herikîna S4 (4 rêz) | PE150 | Hucreya Herikînê Rêya Yekane Rêya Qismî | ~800 Gb / Rê |
Pêdiviyên Nimûneyê
| Mîqdara Daneyan (X) | Têkelbûn (qPCR/nM) | Bend | |
| Rêzkirina Qismî ya Rêyan
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Rêzkirina Rêyan | Li gorî Rêyê | ≥ 1.5 nM / hewza pirtûkxaneyê | ≥ 25 μl / hewza pirtûkxaneyê |
Ji bilî konsantrasyon û mîqdara giştî, şêweyekî lûtkeyê yê guncaw jî pêdivî ye.
Têbînî: Rêzkirina rêzan a pirtûkxaneyên bi cihêrengiya kêm hewceyê spike-in PhiX dike da ku gazîkirina bingehîn a bihêz misoger bike.
Em pêşniyar dikin ku pirtûkxaneyên pêşwext komkirî wekî nimûne werin şandin. Heke hûn hewce ne ku BMKGENE komkirina pirtûkxaneyan pêk bîne, ji kerema xwe li
pêdiviyên pirtûkxaneyê ji bo rêzkirina qismî ya rê.
Mezinahiya Pirtûkxaneyê (Nexşeya lûtkeyê)
Divê lûtkeya sereke di navbera 300-450 bp de be.
Divê pirtûkxane xwedî lûtkeyeke sereke ya yekane bin, bê qirêjiya adapterê û bê dîmerên primerê.
Ji kerema xwe heke nimûneyên we li gorî hewcedariyên materyalên destpêkê nebin, bi me re têkilî daynin.
Herikîna Karê Xizmetê
Kontrola kalîteya pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Kontrola kalîteya daneyan
Radestkirina projeyê
Rapora Kontrolkirina Paqijiyê ya Pirtûkxaneyê
Berî rêzkirin, nirxandina mîqdara pirtûkxaneyê û parçebûnê, raporek li ser kalîteya pirtûkxaneyê tê pêşkêş kirin.
Rapora QC ya rêzkirinê
Tabloya 1. Amarên li ser daneyên rêzkirinê.
| Nasnameya Nimûne | BMKID | Xwendinên xav | Daneyên Xav (bp) | Xwendinên paqij (%) | Q20 (%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Wêne 1. Belavkirina kalîteyê li gorî xwendinên di her nimûneyê de
Wêne 2. Belavkirina naveroka bingehîn
Wêne 3. Belavkirina naveroka xwendî di daneyên rêzkirinê de
