page_head_bg

Маҳсулот

Пайдарпаии метагеномӣ-Нанопур

Метагеномика як воситаи молекулавӣ барои таҳлили маводи омехтаи геномии аз намунаҳои муҳити зист истихроҷшуда мебошад, ки маълумоти муфассалро дар бораи гуногунрангӣ ва фаровонии намудҳо, сохтори популятсия, робитаи филогенетикӣ, генҳои функсионалӣ ва шабакаи коррелятсия бо омилҳои муҳити зист ва ғайра медиҳад. ба омӯзиши метагеномӣ.Фаъолияти барҷастаи он дар дарозии хониш ба таври назаррас таҳлили метагеномии поёнӣ, бахусус маҷмӯаи метагеномҳоро такмил дод.Бо истифода аз бартариҳои дарозии хондан, омӯзиши метагеномии нанопур дар муқоиса бо метагеномикаи тирандозӣ метавонад ба ҷамъомади муттасили бештар ноил шавад.Интишор шудааст, ки метагеномика дар асоси нанопор геномҳои пурра ва пӯшидаи бактерияҳоро аз микробиомаҳо бомуваффақият тавлид кардааст (Moss, EL, et.Биотехнологияи табиат, 2020)

Платформа:Nanopore PromethION P48


Тафсилоти хидмат

Натиҷаҳои намоишӣ

Парвандаи BMK

Афзалиятҳои хидматрасонӣ

ØМаҷмаи баландсифат - Баланд бардоштани дақиқии муайянкунии намудҳо ва пешгӯии генҳои функсионалӣ

ØИзолятсияи пӯшидаи геноми бактериявӣ

ØИстифодаи пурқувват ва боэътимод дар соҳаҳои гуногун, масалан, ошкор кардани микроорганизмҳои патогенӣ ё генҳои муқовимати антибиотикҳо

ØТаҳлили муқоисавии метагеном

Мушаххасоти хадамот

пайдарпайПлатформа

Китобхона

Ҳосили тавсияшавандаи маълумот

Вақти тахминии гардиш

Illumina NovaSeq 6000

PE250

50К/100К/300К Тегҳо

30 рӯз

Таҳлили биоинформатика

üНазорати сифати маълумоти хом

üМаҷмӯи метагеномҳо

üМаҷмӯи генҳои зиёдатӣ ва эзоҳ

üТаҳлили гуногунии намудҳо

üТаҳлили гуногунии функсияҳои генетикӣ

üТаҳлили байни гурӯҳҳо

üТаҳлили ассотсиатсия бар зидди омилҳои таҷрибавӣ

2

Талаботи намунавӣ ва интиқол

Талаботи намунавӣ ва интиқол

Талаботи намунавӣ:   

БароиИқтибосҳои ДНК:

Намунаи намуна

Маблағ

Консентратсияи

Покӣ

Иқтибосҳои ДНК

> 30 нг

> 1 нг/мкл

OD260/280= 1,6-2,5

Барои намунаҳои муҳити зист:

Навъи намуна

Тартиби тавсияшудаи интихоб

Хок

Миқдори намуна: тақрибан.5 г;Моддаи хушкшудаи боқимонда бояд аз рӯи замин хориҷ карда шавад;Порчаҳои калонро майда карда, аз филтри 2 мм гузаред;Намунаҳои аликвот дар қубури хушки EP ё cyrotube барои фармоиш.

Наҷосат

Миқдори намуна: тақрибан.5 г;Намунаҳоро дар қубури хушки EP ё криотубка барои фармоиш ҷамъ кунед ва аликвот кунед.

Мазмуни рӯда

Намунаҳоро дар ҳолати асептикӣ коркард кардан лозим аст.Бофтаи ҷамъшударо бо PBS бишӯед;PBS-ро центрифуга кунед ва боришотро дар қубурҳои EP ҷамъ кунед.

лой

Миқдори намуна: тақрибан.5 г;Намунаи лойро дар қубури безараргардонии EP ё криотубка барои фармоиш ҷамъоварӣ ва аликвот кунед

Ҳаҷми об

Барои намуна бо миқдори маҳдуди микробҳо, аз қабили оби лӯла, оби чоҳ ва ғайра, ҳадди аққал 1 л об ҷамъ кунед ва аз филтри 0,22 мкм гузаред, то микробҳоро дар мембрана ғанӣ созед.Мембранаро дар найчаи стерилизатсияшуда нигоҳ доред.

Пӯст

Сатҳи пӯстро бо тампони пахтаи безарар ё теғи ҷарроҳӣ бодиққат харошед ва онро дар найчаи стерилизатсия кунед.

Интиқоли намунаи тавсияшуда

Намунаҳоро дар нитрогени моеъ барои 3-4 соат ях кунед ва дар нитрогени моеъ ё -80 дараҷа то нигоҳдории дарозмуддат нигоҳ доред.Интиқоли намуна бо яхи хушк лозим аст.

Раванди кори хидмат

logo_02

Интиқоли намуна

logo_04

Сохтмони китобхона

logo_05

пайдарпай

logo_06

Таҳлили маълумот

logo_07

Хизматрасонии пас аз фурӯш


  • гузашта:
  • Баъдӣ:

  • 1.Харитаи гармӣ: Гурӯҳбандии сарватҳои намудҳо32.Генҳои функсионалӣ, ки ба роҳҳои метаболикии KEGG шарҳ дода шудаанд43.Шабакаи коррелятсияи намудҳо54.Circos генҳои муқовимати антибиотикҳои CARD
    6

    Парвандаи BMK

    Метагеномикаи нанопора имкон медиҳад, ки ташхиси фаврии клиникии сирояти бактериявии роҳи нафаскашии поёни

    Нашр шудааст:Биотехнологияи табиат, 2019

    Нишондодҳои техникӣ
    Пайдарпайкунӣ: Nanopore MinION
    Биоинформатикаи метагеномикаи клиникӣ: камшавии ДНК мизбон, таҳлили WIMP ва ARMA
    Муайянкунии зуд: 6 соат
    Ҳассосияти баланд: 96,6%

    Натиҷаҳои асосӣ

    Дар соли 2006, сирояти роҳҳои поёнии нафас (LR) дар саросари ҷаҳон 3 миллион нафарро ба ҳалокат расонд.Усули маъмулии ошкор кардани патогени LR1 парвариш аст, ки ҳассосияти паст дорад, вақти тӯлонӣ ва набудани роҳнамо дар табобати барвақти антибиотикҳо мебошад.Ташхиси зуд ва дақиқи микробҳо кайҳо боз як ниёзи фаврӣ буд.Доктор Ҷастин аз Донишгоҳи Шарқии Англия ва шарикони ӯ бомуваффақият усули метагеномии дар нанопур асосёфтаро барои ошкор кардани патоген таҳия карданд.Мувофиқи ҷараёни кори онҳо, 99,99% ДНК-и мизбон метавонад тамом шавад.Муайян кардани микроорганизмҳо ва генҳои ба антибиотикҳо тобоварро дар 6 соат анҷом додан мумкин аст.

    Истинод
    Чаралампус, Т., Кей, ГЛ, Ричардсон, Х., Айдин, А., О'Грейди, Ҷ.(2019).Метагеномикаи нанопора имкон медиҳад, ки ташхиси фаврии клиникии сирояти бактериявии роҳи нафаскашии поёни.Биотехнологияи табиат, 37(7), 1.

    иқтибос гиред

    Паёми худро дар ин ҷо нависед ва ба мо бифиристед

    Паёми худро ба мо фиристед: