page_head_bg

Маҳсулот

пайдарпайии метагеномӣ (NGS)

Метагеном ба маҷмӯаи маводи умумии генетикии ҷамъияти омехтаи организмҳо, ба монанди метагеноми муҳити зист, метагеноми инсон ва ғ. дахл дорад. Он дорои геномҳои ҳам микроорганизмҳои киштшаванда ва ҳам коркарднашаванда мебошад.Пайдарпаии метагеномӣ як воситаи молекулавӣ барои таҳлили маводи омехтаи геномии аз намунаҳои муҳити зист истихроҷшуда мебошад, ки дар бораи гуногунрангӣ ва фаровонии намудҳо, сохтори популятсия, робитаи филогенетикӣ, генҳои функсионалӣ ва шабакаи коррелятсия бо омилҳои муҳити зист маълумоти муфассал медиҳад.

Платформа:Illumina NovaSeq6000


Тафсилоти хидмат

Натиҷаҳои намоишӣ

Омӯзиши мисол

Афзалиятҳои хидматрасонӣ

ØИзолятсия ва бе парвариш барои профили ҷомеаи микробҳо

ØҲалли баланд дар ошкор кардани намудҳои камшумор дар намунаҳои муҳити зист

ØИдеяи «мета-» тамоми хусусиятҳои биологиро дар сатҳи функсионалӣ, дараҷаи намудҳо ва генҳо муттаҳид мекунад, ки назари динамикиро ба воқеият наздиктар инъикос мекунад.

ØBMK дар намудҳои гуногуни намунаҳо бо зиёда аз 10,000 намунаҳо коркардшуда таҷрибаи азим ҷамъоварӣ мекунад.

Мушаххасоти хадамот

пайдарпайПлатформа

Китобхона

Ҳосили тавсияшавандаи маълумот

Вақти тахминии гардиш

Illumina NovaSeq 6000

PE250

50К/100К/300К Тегҳо

30 рӯз

Таҳлили биоинформатика

üНазорати сифати маълумоти хом

üМаҷмӯи метагеномҳо

üМаҷмӯи генҳои зиёдатӣ ва эзоҳ

üТаҳлили гуногунии намудҳо

üТаҳлили гуногунии функсияҳои генетикӣ

üТаҳлили байни гурӯҳҳо

üТаҳлили ассотсиатсия бар зидди омилҳои таҷрибавӣ

2

Талаботи намунавӣ ва интиқол

Талаботи намунавӣ:

БароиИқтибосҳои ДНК:

Намунаи намуна

Маблағ

Консентратсияи

Покӣ

Иқтибосҳои ДНК

> 30 нг

> 1 нг/мкл

OD260/280= 1,6-2,5

Барои намунаҳои муҳити зист:

Навъи намуна

Тартиби тавсияшудаи интихоб

Хок

Миқдори намуна: тақрибан.5 г;Моддаи хушкшудаи боқимонда бояд аз рӯи замин хориҷ карда шавад;Порчаҳои калонро майда карда, аз филтри 2 мм гузаред;Намунаҳои аликвот дар қубури хушки EP ё cyrotube барои фармоиш.

Наҷосат

Миқдори намуна: тақрибан.5 г;Намунаҳоро дар қубури хушки EP ё криотубка барои фармоиш ҷамъ кунед ва аликвот кунед.

Мазмуни рӯда

Намунаҳоро дар ҳолати асептикӣ коркард кардан лозим аст.Бофтаи ҷамъшударо бо PBS бишӯед;PBS-ро центрифуга кунед ва боришотро дар қубурҳои EP ҷамъ кунед.

лой

Миқдори намуна: тақрибан.5 г;Намунаи лойро дар қубури безараргардонии EP ё криотубка барои фармоиш ҷамъоварӣ ва аликвот кунед

Ҳаҷми об

Барои намуна бо миқдори маҳдуди микробҳо, аз қабили оби лӯла, оби чоҳ ва ғайра, ҳадди аққал 1 л об ҷамъ кунед ва аз филтри 0,22 мкм гузаред, то микробҳоро дар мембрана ғанӣ созед.Мембранаро дар найчаи стерилизатсияшуда нигоҳ доред.

Пӯст

Сатҳи пӯстро бо тампони пахтаи безарар ё теғи ҷарроҳӣ бодиққат харошед ва онро дар найчаи стерилизатсия кунед.

Интиқоли намунаи тавсияшуда

Намунаҳоро дар нитрогени моеъ барои 3-4 соат ях кунед ва дар нитрогени моеъ ё -80 дараҷа то нигоҳдории дарозмуддат нигоҳ доред.Интиқоли намуна бо яхи хушк лозим аст.

Раванди кори хидмат

logo_02

Интиқоли намуна

logo_04

Сохтмони китобхона

logo_05

пайдарпай

logo_06

Таҳлили маълумот

logo_07

Хизматрасонии пас аз фурӯш


  • гузашта:
  • Баъдӣ:

  • 1.Гистограмма: Тақсимоти намудҳо

    3

    2.Генҳои функсионалӣ, ки ба роҳҳои метаболикии KEGG шарҳ дода шудаанд

    4

    3.Харитаи гармӣ: Функсияҳои дифференсиалӣ дар асоси фаровонии нисбии ген54.Circos генҳои муқовимати антибиотикҳои CARD

    6

    Парвандаи BMK

    Паҳншавии генҳои муқовимат ба антибиотикҳо ва патогенҳои бактериявӣ дар тӯли континууми решаи хок-мангр

    Нашр шудааст:Маҷаллаи маводҳои хатарнок, 2021

    Стратегияи пайдарпайӣ:

    Маводҳо: Иқтибосҳои ДНК аз чаҳор пораи намунаҳои решаи мангров: хоки шинонданашуда, ризосфера, эписфера ва қисмҳои эндосфера
    Платформа: Illumina HiSeq 2500
    Ҳадафҳо: Метагеном
    Минтақаи гени 16S rRNA V3-V4

    Натиҷаҳои асосӣ

    Бо мақсади омӯзиши паҳншавии генҳои муқовимати антибиотикҳо (ARGs) аз хок ба растаниҳо, пайдарпайии метагеномӣ ва профили метабаркодкунӣ дар континууми хок-решаи ниҳолҳои мангр коркард карда шуданд.Маълумоти метагеномӣ нишон дод, ки 91,4% генҳои муқовимати антибиотикҳо одатан дар ҳама чор қисмати хоки дар боло зикршуда муайян карда шудаанд, ки мӯди доимиро нишон медиҳанд.Пайдарпаии ампликони 16S rRNA 29,285 пайдарпаӣ тавлид кард, ки 346 намудро намояндагӣ мекунад.Дар якҷоягӣ бо профили намудҳо тавассути пайдарпайии ампликон, ин паҳншавӣ аз микробиотаи бо реша алоқаманд новобаста аз он муайян карда шуд, аммо он метавонад тавассути мобилии элементҳои генетикӣ мусоидат кунад.Ин тадқиқот ҷараёни ARG ва патогенҳоро аз хок ба растанӣ тавассути континууми бо ҳам пайвастшудаи хок ва реша муайян кард.

    Истинод

    Ван, С., Ху, Р., Стронг, ПҶ, Чжуан, В., ва Шу, Л.(2020).Паҳншавии генҳои муқовимати антибиотикҳо ва микроорганизмҳои бактериявӣ дар қад-қади континууми решаи хок-мангр.Маҷаллаи маводҳои хатарнок, 408, 124985.

    иқтибос гиред

    Паёми худро дар ин ҷо нависед ва ба мо бифиристед

    Паёми худро ба мо фиристед: