-
Таҳлили ассотсиатсияи геномӣ
Омӯзиши ассотсиатсияи умуми геномӣ (GWAS) ҳадафи муайян кардани вариантҳои генетикӣ (генотип), ки бо хислатҳои мушаххас (фенотип) алоқаманд аст.Таҳқиқоти GWAS маркерҳои генетикиро убури тамоми геноми шумораи зиёди шахсони алоҳида меомӯзад ва ассотсиатсияҳои генотип-фенотипро тавассути таҳлили оморӣ дар сатҳи аҳолӣ пешгӯӣ мекунад.Он дар тадқиқот оид ба бемориҳои инсон ва истихроҷи генҳои функсионалӣ оид ба хусусиятҳои мураккаби ҳайвонот ё растаниҳо васеъ истифода шудааст.
-
пайдарпайии РНК-и якядроӣ
Пешрафт дар гирифтани як ҳуҷайра ва техникаи сохтани китобхонаи инфиродӣ дар якҷоягӣ бо пайдарпайии баландсуръат имкон медиҳад, ки омӯзиши ифодаи генҳо дар асоси ҳуҷайра ба ҳуҷайра.Он имкон медиҳад, ки таҳлили амиқтар ва мукаммали система дар популяцияҳои мураккаби ҳуҷайраҳо, ки дар он асосан аз ниқоб кардани гетерогении онҳо тавассути гирифтани миёнаи ҳамаи ҳуҷайраҳо худдорӣ мекунад.
Аммо, баъзе ҳуҷайраҳо барои сохтани суспензияи якҳуҷайра мувофиқ нестанд, аз ин рӯ усулҳои дигари тайёр кардани намуна - истихроҷи ядро аз бофтаҳо лозим аст, яъне ядро мустақиман аз бофтаҳо ё ҳуҷайраҳо истихроҷ карда мешавад ва ба суспензияи якҳуҷайра омода карда мешавад. пайдарпайии ҳуҷайра.
BMK хидмати пайдарпайии як ҳуҷайраи РНК-ро дар асоси 10 × Genomics ChromiumTM пешниҳод мекунад.Ин хидмат дар таҳқиқоти таҳқиқоти марбут ба бемориҳо, ба монанди тафриқаи ҳуҷайраҳои иммунӣ, гетерогении варамҳо, рушди бофтаҳо ва ғайра васеъ истифода шудааст.
Чипи транскриптомҳои фазоӣ: 10 × Геномика
Платформа: Платформаи Illumina NovaSeq
-
Пайдарпайкунии тамоми геномҳои растанӣ/ҳайвонот
Таҷдиди пайдарпайии тамоми геном, ки бо номи WGS маъруф аст, имкон медиҳад, ки ҳам мутатсияҳои умумӣ ва ҳам нодир дар тамоми геном, аз ҷумла полиморфизми ягонаи нуклеотид (SNP), несткунии дохилкунӣ (InDel), тағирёбии сохтор (SV) ва тағирёбии рақами нусхабардорӣ (CNV) ).SVҳо нисбат ба SNPҳо қисми бештари пойгоҳи тағирёбандаро ташкил медиҳанд ва ба геном таъсири бештар доранд, ки ба организмҳои зинда таъсири назаррас доранд.Азнавбарқароркунии дарозмуддат барои муайян кардани дақиқтари порчаҳои калон ва вариантҳои мураккаб имкон медиҳад, зеро хондани тӯлонӣ убури хромосомаҳоро аз минтақаҳои мураккаб ба монанди такрори тандем, минтақаҳои аз GC/AT бой ва минтақаҳои гипертағйирёбанда хеле осон мекунад.
Платформа: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Транскриптомияи фазоӣ
Ташкили фазоии ҳуҷайраҳо дар равандҳои гуногуни биологӣ, аз қабили инфилтратсияи иммунӣ, рушди ҷанин ва ғ. нақши муҳим дорад. Пайдарпайии транскриптомҳои фазоӣ, ки профили ифодаи генҳоро ҳангоми нигоҳ доштани иттилооти мавқеъи фазоӣ нишон медиҳад, дар бораи меъмории бофтаи сатҳи транскриптом фаҳмиши бузург медиҳад.Бо рушди технология, морфологияи ултра равшани бофта ва фарқияти воқеии сохтории ифодаи молекулавии фазоӣ бояд бо ҳалли баландтар омӯхта шавад.BMKGENE хидмати ҳамаҷонибаи яктарафаи транскриптомҳои фазоиро аз намунаҳо то фаҳмиши биологӣ пешкаш мекунад.
Технологияҳои транскриптомикаи фазоӣ дурнамои навро дар арсаи гуногуни тадқиқот тавассути ҳалли профили ифодаи генҳо бо мундариҷаи фазоӣ дар намунаҳои гетерогенӣ тақвият доданд.
Чипи транскриптомии фазоӣ: BMKMANU S1000
Платформа: Платформаи Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transscriptome
Visium Spatial Gen Expression як технологияи асосии пайдарпаии фосилавии транскриптом барои таснифи матоъ дар асоси умумии mRNA мебошад.Тамоми транскриптомро бо контексти морфологӣ харита кунед, то фаҳмиши навро дар бораи рушди муқаррарӣ, патологияи беморӣ ва таҳқиқоти тарҷумаи клиникӣ кашф кунед.BMKGENE хидмати ҳамаҷонибаи яктарафаи транскриптомҳои фазоиро аз намунаҳо то фаҳмиши биологӣ пешкаш мекунад.
Технологияҳои транскриптомикаи фазоӣ дурнамои навро дар арсаи гуногуни таҳқиқот тавассути ҳалли профили ифодаи генҳо бо мундариҷаи фазоӣ дар намунаҳои гетерогенӣ тақвият доданд.
Чипи транскриптомҳои фазоӣ: 10x Genomics Visium
Платформа:Платформаи Illumina NovaSeq
-
Дарозии пурраи mRNA пайдарпаии-нанопур
Пайдарпайвандии РНК як воситаи бебаҳо барои таҳлили ҳамаҷонибаи транскриптомҳо буд.Бешубҳа, пайдарпайии анъанавии кӯтоҳмуддат дар ин ҷо ба пешрафти сершумори муҳим ноил гардид.Бо вуҷуди ин, он аксар вақт бо маҳдудиятҳо дар идентификатсияи пурраи изоформ, миқдор ва ғарази ПТР дучор меояд.
Секвенсияи нанопора аз дигар платформаҳои пайдарпайӣ фарқ мекунад, ки нуклеотидҳо мустақиман бидуни синтези ДНК хонда мешаванд ва дар даҳҳо килобазаҳо хондани тӯлонӣ тавлид мекунанд.Ин имкон медиҳад, ки мустақиман хондани транскриптҳои пурраи дарозмӯҳлат ва ҳалли мушкилот дар таҳқиқоти сатҳи изоформаро ҳал кунад.
Платформа:Nanopore PromethION
Китобхона:cDNA-PCR
-
Пайдарпаии пурраи мРНК -PacBio
De novoпайдарпаии пурраи транскриптом, инчунин бо номиDe novoIso-Seq бартариҳои секвенсери PacBio-ро дар дарозии хондан мегирад, ки имкон медиҳад пайдарпайии молекулаҳои пурраи cDNA-ро бе ягон танаффус таъмин кунад.Ин ҳама хатогиҳоеро, ки дар қадамҳои васлкунии транскрипт тавлид мешаванд, комилан пешгирӣ мекунад ва маҷмӯи унигенро бо ҳалли сатҳи изоформ месозад.Ин маҷмӯаи унигенҳо маълумоти пурқуввати генетикиро ҳамчун "геноми истинод" дар сатҳи транскриптом таъмин мекунад.Илова бар ин, дар якҷоягӣ бо маълумоти пайдарпайии насли оянда, ин хидмат миқдори дақиқи ифодаи сатҳи изоформро фароҳам меорад.
Платформа: PacBio Sequel IIКитобхона: Китобхонаи занги SMRT -
Эукариотӣ mRNA пайдарпаии-Illumina
пайдарпайии mRNA имкон медиҳад, ки профили ҳамаи mRNA-ҳои аз ҳуҷайраҳо дар шароити мушаххас транскриптшуда.Ин як технологияи тавоно барои ошкор кардани профили ифодаи генҳо, сохторҳои генҳо ва механизмҳои молекулавии равандҳои муайяни биологӣ мебошад.То имрӯз, пайдарпайии mRNA дар таҳқиқоти бунёдӣ, ташхиси клиникӣ, таҳияи маводи мухаддир ва ғайра васеъ истифода мешавад.
Платформа: Платформаи Illumina NovaSeq
-
Пайдарпаии mRNA-Illumina дар асоси ғайрирасмӣ
Пайдарпайвандии mRNA техникаи пайдарпайии насли ояндаро (NGS) қабул мекунад, то мессенҷери РНК (mRNA) -и Эукариотро дар давраи мушаххасе, ки баъзе функсияҳои махсус фаъол мешаванд, сабт кунанд.Дарозитарин транскрипти пайвастшуда "Unigene" ном дошт ва ҳамчун пайдарпаии истинод барои таҳлили минбаъда истифода мешуд, ки воситаи муассир барои омӯзиши механизми молекулавӣ ва шабакаи танзими намудҳо бидуни истинод мебошад.
Пас аз ҷамъоварии маълумоти транскриптомӣ ва шарҳи функсионалии униген
(1) Таҳлили SSR, пешгӯии CDS ва сохтори генҳо пешакӣ тартиб дода мешавад.
(2) Миқдори ифодаи униген дар ҳар як намуна анҷом дода мешавад.
(3) Юнигенҳои ба таври дифференсиалӣ ифодаёфта дар байни намунаҳо (ё гурӯҳҳо) дар асоси ифодаи униген кашф карда мешаванд
(4) Кластерсозӣ, шарҳи функсионалӣ ва ғанисозии унигенҳои ба таври дифференсиалӣ ифодашуда анҷом дода мешавад
-
пайдарпаии дароз ғайридавлатӣ рамзгузорӣ-Illumina
РНК-ҳои дарози коднашаванда (lncRNAs) як намуди молекулаҳои РНК мебошанд, ки дарозиашон аз 200 н зиёд аст, ки бо потенсиали хеле ками рамзгузорӣ хосанд.LncRNA, ҳамчун узви калидӣ дар РНК-ҳои коднашаванда, асосан дар ядро ва плазма мавҷуд аст.Рушди технологияи пайдарпайӣ ва биоинформатика имкон медиҳад, ки шумораи зиёди lncRNA-ҳои навро муайян кунанд ва онҳоро бо функсияҳои биологӣ пайваст кунанд.Далелҳои ҷамъшуда нишон медиҳанд, ки lncRNA дар танзими эпигенетикӣ, танзими транскрипсия ва танзими пас аз транскрипсия васеъ иштирок мекунад.
-
пайдарпаии РНК хурд - Illumina
РНК хурд ба синфи молекулаҳои РНК-и рамзгузорандае дахл надорад, ки дарозии онҳо одатан аз 200 нт камтар аст, аз ҷумла микроРНК (miRNA), РНК-и хурди интерференсия (siRNA) ва РНК-и мутақобилаи piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) як синфи РНК-и хурди эндогенӣ бо дарозии тақрибан 20-24nt мебошад, ки дар ҳуҷайраҳо нақшҳои гуногуни муҳими танзимкунандаро мебозад.miRNA дар бисёр равандҳои ҳаёт иштирок мекунад, ки бофтаҳо - мушаххас ва марҳила - ифодаи мушаххасро ошкор мекунанд ва дар намудҳои гуногун хеле ҳифз шудаанд.
-
пайдарпайии circRNA - Illumina
CircRNAs (RNAs Circular) як синфи молекулаҳои РНК-и коднашаванда мебошанд, ки аз 5′ сарпӯши ниҳоӣ ва 3′ думчаи охири поли(А) кӯтоҳанд.CircRNAҳо сохтори даврашаклро тавассути пайванди ковалентӣ иҷро мекунанд, ки ин ҳолат бар зидди ҳазми экзонуклеазаи РНК мебошад.circRNA дар афзоиш ва инкишофи организмҳо ва муқовимати онҳо ба муҳити беруна нақши муҳим мебозад.
CircRNA дорои функсияҳои зиёде мебошад, ки метавонанд miRNA-ро ба таври рақобатпазир пайваст кунанд, вазифаи танзимкунандаи ceRNA-ро иҷро кунанд, то ифодаи генҳоро танзим кунанд.Солҳои охир, инчунин муайян карда шудааст, ки он бо пайдоиш ва рушди бемориҳо зич алоқаманд аст ва дар самти маркерҳои ташхиси беморӣ ва ғайра дурнамои васеъ дорад.
