-
مکمل لمبائی ایم آر این اے کی ترتیب-نانوپور
آر این اے کی ترتیب جامع ٹرانسکرپٹوم تجزیہ کے لیے ایک انمول ٹول رہا ہے۔بلاشبہ، روایتی مختصر پڑھنے کی ترتیب نے یہاں متعدد اہم ترقی حاصل کی۔بہر حال، یہ اکثر پوری لمبائی کے آئسوفارم کی شناخت، مقدار، پی سی آر تعصب میں حدود کا سامنا کرتا ہے۔
نینو پور کی ترتیب خود کو دوسرے ترتیب دینے والے پلیٹ فارمز سے ممتاز کرتی ہے، اس میں نیوکلیوٹائڈس کو بغیر ڈی این اے کی ترکیب کے براہ راست پڑھا جاتا ہے اور دسیوں کلو بیس پر طویل پڑھا جاتا ہے۔یہ مکمل طوالت کی نقلوں کو براہ راست پڑھنے اور آئسوفارم سطح کے مطالعے میں چیلنجوں سے نمٹنے کی طاقت دیتا ہے۔
پلیٹ فارم：نینو پور پرومیتھیون
کتب خانہ:cDNA-PCR
-
ڈی نوو فل لینتھ ٹرانسکرپٹوم سیکوینسنگ -PacBio
ڈی نوومکمل طوالت کی ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب، جسے بھی کہا جاتا ہے۔ڈی نووIso-Seq پڑھنے کی لمبائی میں PacBio sequencer کے فوائد لیتا ہے، جو بغیر کسی وقفے کے پوری لمبائی کے cDNA مالیکیولز کی ترتیب کو قابل بناتا ہے۔یہ ٹرانسکرپٹ اسمبلی کے مراحل میں پیدا ہونے والی کسی بھی غلطی سے مکمل طور پر بچتا ہے اور آئسفارم لیول ریزولوشن کے ساتھ یونیجین سیٹ بناتا ہے۔یہ یونیجین سیٹ ٹرانسکرپٹوم کی سطح پر "حوالہ جینوم" کے طور پر طاقتور جینیاتی معلومات فراہم کرتا ہے۔مزید برآں، اگلی نسل کی ترتیب کے اعداد و شمار کے ساتھ ملا کر، یہ سروس isoform سطح کے اظہار کی درست مقدار کو تقویت دیتی ہے۔
پلیٹ فارم: PacBio سیکوئل IIلائبریری: SMRT بیل لائبریری -
یوکریوٹک ایم آر این اے سیکوینسنگ-ایلومینا۔
mRNA کی ترتیب مخصوص حالات کے تحت خلیوں سے نقل کردہ تمام mRNAs کی پروفائلنگ کو قابل بناتی ہے۔یہ جین ایکسپریشن پروفائل، جین کی ساخت اور بعض حیاتیاتی عمل کے مالیکیولر میکانزم کو ظاہر کرنے کے لیے ایک طاقتور ٹیکنالوجی ہے۔آج تک، mRNA کی ترتیب کو بنیادی تحقیق، طبی تشخیص، منشیات کی نشوونما وغیرہ میں بڑے پیمانے پر استعمال کیا گیا ہے۔
پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq 6000
-
غیر حوالہ پر مبنی ایم آر این اے سیکوینسنگ-ایلومینا۔
ایم آر این اے سیکوینسنگ اگلی نسل کی سیکوینسنگ تکنیک (این جی ایس) کو اپناتی ہے تاکہ میسنجر آر این اے (ایم آر این اے) فارم یوکرائیوٹ کو مخصوص مدت میں حاصل کیا جا سکے جس میں کچھ خاص افعال فعال ہو رہے ہوتے ہیں۔سب سے طویل ٹرانسکرپٹ کو 'Unigene' کہا جاتا تھا اور اسے بعد کے تجزیے کے لیے حوالہ ترتیب کے طور پر استعمال کیا جاتا ہے، جو بغیر کسی حوالہ کے انواع کے مالیکیولر میکانزم اور ریگولیٹری نیٹ ورک کا مطالعہ کرنے کا ایک مؤثر ذریعہ ہے۔
ٹرانسکرپٹوم ڈیٹا اسمبلی اور یونیجین فنکشنل تشریح کے بعد
(1) SNP تجزیہ، SSR تجزیہ، CDS کی پیشن گوئی اور جین کی ساخت پہلے سے تیار کی جائے گی۔
(2) ہر نمونے میں یونیجین اظہار کی مقدار کا تعین کیا جائے گا۔
(3) نمونوں (یا گروپوں) کے درمیان مختلف طور پر ظاہر کیے گئے یونجینز کو یونجین اظہار کی بنیاد پر دریافت کیا جائے گا۔
(4) کلسٹرنگ، فنکشنل تشریح اور تفریق شدہ یونیجینز کی افزودگی کا تجزیہ کیا جائے گا۔
-
لمبی نان کوڈنگ سیکوینسنگ-ایلومینا۔
لانگ نان کوڈنگ RNAs (lncRNAs) RNA مالیکیولز کی ایک قسم ہیں جن کی لمبائی 200 nt سے زیادہ ہے، جو انتہائی کم کوڈنگ کی صلاحیت کی خصوصیت رکھتے ہیں۔LncRNA، نان کوڈنگ RNAs میں ایک اہم رکن کے طور پر، بنیادی طور پر نیوکلئس اور پلازما میں پایا جاتا ہے۔ترتیب دینے والی ٹکنالوجی اور بایو انفارمیٹکس میں ترقی متعدد نوول lncRNAs کی شناخت اور ان کو حیاتیاتی افعال کے ساتھ منسلک کرنے کے قابل بناتی ہے۔جمع ہونے والے شواہد بتاتے ہیں کہ lncRNA ایپی جینیٹک ریگولیشن، ٹرانسکرپشن ریگولیشن اور پوسٹ ٹرانسکرپشن ریگولیشن میں بڑے پیمانے پر شامل ہے۔
-
چھوٹے آر این اے کی ترتیب - ایلومینا۔
سمال آر این اے سے مراد نان کوڈنگ آر این اے مالیکیولز کی ایک کلاس ہے جن کی لمبائی عام طور پر 200nt سے کم ہوتی ہے، بشمول مائیکرو آر این اے (miRNA)، چھوٹا انٹرفیس آر این اے (siRNA)، اور piwi-interacting RNA (piRNA)۔
MicroRNA (miRNA) endogenous چھوٹے RNA کی ایک کلاس ہے جس کی لمبائی تقریباً 20-24nt ہے، جو خلیات میں مختلف قسم کے اہم ریگولیٹری کردار ادا کرتی ہے۔miRNA بہت سے زندگی کے عمل میں شامل ہے جو ٹشو کو ظاہر کرتا ہے - مخصوص اور اسٹیج - مخصوص اظہار اور مختلف پرجاتیوں میں انتہائی محفوظ ہے۔
-
سرک آر این اے سیکوینسنگ-ایلومینا۔
مکمل ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب کو تمام قسم کے RNA مالیکیولز کی پروفائل کرنے کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے، بشمول کوڈنگ (mRNA) اور نان کوڈنگ RNAs (بشمول lncRNA، circRNA اور miRNA) جو ایک مخصوص وقت میں مخصوص خلیوں کے ذریعے نقل کیے جاتے ہیں۔مکمل ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب، جسے "ٹوٹل آر این اے سیکوینسنگ" کے نام سے بھی جانا جاتا ہے، کا مقصد ٹرانسکرپٹوم کی سطح پر جامع ریگولیٹری نیٹ ورکس کو ظاہر کرنا ہے۔NGS ٹیکنالوجی کا فائدہ اٹھاتے ہوئے، مکمل ٹرانسکرپٹوم مصنوعات کی ترتیب ceRNA تجزیہ اور مشترکہ RNA تجزیہ کے لیے دستیاب ہیں، جو فنکشنل خصوصیات کی طرف پہلا قدم فراہم کرتی ہے۔circRNA-miRNA-mRNA پر مبنی ceRNA کے ریگولیٹری نیٹ ورک کو ظاہر کرنا۔
-
مکمل ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب - ایلومینا۔
مکمل ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب کو تمام قسم کے RNA مالیکیولز کی پروفائل کرنے کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے، بشمول کوڈنگ (mRNA) اور نان کوڈنگ RNAs (بشمول lncRNA، circRNA اور miRNA) جو ایک مخصوص وقت میں مخصوص خلیوں کے ذریعے نقل کیے جاتے ہیں۔مکمل ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب، جسے "ٹوٹل آر این اے سیکوینسنگ" کے نام سے بھی جانا جاتا ہے، کا مقصد ٹرانسکرپٹوم کی سطح پر جامع ریگولیٹری نیٹ ورکس کو ظاہر کرنا ہے۔NGS ٹیکنالوجی کا فائدہ اٹھاتے ہوئے، مکمل ٹرانسکرپٹوم مصنوعات کی ترتیب ceRNA تجزیہ اور مشترکہ RNA تجزیہ کے لیے دستیاب ہیں، جو فنکشنل خصوصیات کی طرف پہلا قدم فراہم کرتی ہے۔circRNA-miRNA-mRNA پر مبنی ceRNA کے ریگولیٹری نیٹ ورک کو ظاہر کرنا۔
-
پروکیریٹک آر این اے کی ترتیب
پروکیریوٹک آر این اے سیکوینسنگ اگلی نسل کی ترتیب (این جی ایس) کا استعمال کرتے ہوئے بدلتے ہوئے سیلولر ٹرانسکرپٹوم کا تجزیہ کرکے، ایک مخصوص لمحے میں آر این اے کی موجودگی اور مقدار کو ظاہر کرتی ہے۔ہماری کمپنی کی پروکاریوٹک آر این اے کی ترتیب، خاص طور پر حوالہ جینوم کے ساتھ پروکیریوٹس کا مقصد ہے، آپ کو ٹرانسکرپٹوم پروفائلنگ، جین کی ساخت کا تجزیہ، وغیرہ فراہم کرنا ہے۔ اس کا وسیع پیمانے پر بنیادی سائنس کی تحقیق، منشیات کی تحقیق اور ترقی، اور بہت کچھ پر اطلاق کیا گیا ہے۔
پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq 6000
-
میٹا ٹرانسکروم کی ترتیب
میٹا ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب قدرتی ماحول (یعنی مٹی، پانی، سمندر، پاخانہ اور آنت) کے اندر جرثوموں کے جین کے اظہار کی نشاندہی کرتی ہے (یعنی مٹی، پانی، سمندر، فضلہ اور آنت)۔ خاص طور پر، یہ خدمات آپ کو پیچیدہ مائکروبیل کمیونٹیز کی مکمل جین ایکسپریشن پروفائلنگ حاصل کرنے کی اجازت دیتی ہیں۔ پرجاتیوں کا، مختلف طریقے سے ظاہر کیے گئے جینز کی فعال افزودگی کا تجزیہ، اور بہت کچھ۔
پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq 6000
