page_head_bg

مصنوعات

میٹجینومک ترتیب (این جی ایس)

میٹاجینوم سے مراد حیاتیات کی مخلوط کمیونٹی کے کل جینیاتی مواد کا مجموعہ ہے، جیسے ماحولیاتی میٹاجینوم، ہیومن میٹاجینوم، وغیرہ۔ اس میں قابل کاشت اور ناقابل کاشت مائکروجنزم دونوں کے جینوم ہوتے ہیں۔میٹاجینومک سیکوینسنگ ایک مالیکیولر ٹول ہے جو ماحولیاتی نمونوں سے اخذ کیے گئے مخلوط جینومک مواد کا تجزیہ کرنے کے لیے استعمال کیا جاتا ہے، جو انواع کے تنوع اور کثرت، آبادی کی ساخت، فائیلوجینیٹک تعلق، فنکشنل جینز اور ماحولیاتی عوامل کے ساتھ ارتباط کے نیٹ ورک میں تفصیلی معلومات فراہم کرتا ہے۔

پلیٹ فارم:Illumina NovaSeq6000


سروس کی تفصیلات

ڈیمو کے نتائج

کیس اسٹڈی

سروس کے فوائد

Øمائکروبیل کمیونٹی پروفائلنگ کے لیے تنہائی اور کاشت سے پاک

Øماحولیاتی نمونوں میں کم کثرت پرجاتیوں کا پتہ لگانے میں اعلی قرارداد

Ø"میٹا-" کا خیال فنکشنل لیول، پرجاتیوں کی سطح اور جین کی سطح پر تمام حیاتیاتی خصوصیات کو مربوط کرتا ہے، جو ایک متحرک نظریہ کی عکاسی کرتا ہے جو حقیقت کے قریب ہے۔

ØBMK 10,000 سے زیادہ نمونوں پر عملدرآمد کے ساتھ متنوع نمونوں کی اقسام میں بڑے پیمانے پر تجربہ جمع کرتا ہے۔

سروس کی وضاحتیں

ترتیب دیناپلیٹ فارم

کتب خانہ

تجویز کردہ ڈیٹا کی پیداوار

تخمینی موڑ کا وقت

Illumina NovaSeq 6000

PE250

50K/100K/300K ٹیگز

30 یوم

بایو انفارمیٹکس کا تجزیہ

üخام ڈیٹا کوالٹی کنٹرول

üمیٹاجینوم اسمبلی

üغیر فالتو جین سیٹ اور تشریح

üپرجاتیوں کے تنوع کا تجزیہ

üجینیاتی فنکشن تنوع کا تجزیہ

üانٹر گروپ تجزیہ

üتجرباتی عوامل کے خلاف ایسوسی ایشن کا تجزیہ

2

نمونے کی ضروریات اور ترسیل

نمونہ کی ضروریات:

کے لیےڈی این اے کے نچوڑ:

نمونہ کی قسم

رقم

توجہ مرکوز کرنا

طہارت

ڈی این اے کے نچوڑ

30 این جی

1 ng/μl

OD260/280= 1.6-2.5

ماحولیاتی نمونوں کے لیے:

نمونہ کی قسم

تجویز کردہ نمونے لینے کا طریقہ کار

مٹی

نمونے لینے کی رقم: تقریبا.5 جی؛باقی سوکھے مادے کو سطح سے ہٹانے کی ضرورت ہے۔بڑے ٹکڑوں کو پیس لیں اور 2 ملی میٹر فلٹر سے گزریں۔ریزرویشن کے لیے جراثیم سے پاک EP-tube یا cyrotube میں علی کوٹ کے نمونے۔

پاخانہ

نمونے لینے کی رقم: تقریبا.5 جی؛ریزرویشن کے لیے جراثیم سے پاک ای پی ٹیوب یا کرائیوٹوب میں ایلی کوٹ کے نمونے جمع کریں۔

آنتوں کے مواد

نمونوں کو ایسپٹک حالت میں پروسیس کرنے کی ضرورت ہے۔جمع شدہ ٹشو کو پی بی ایس کے ساتھ دھونا؛پی بی ایس کو سینٹری فیوج کریں اور ای پی ٹیوبوں میں تیز رفتار جمع کریں۔

کیچڑ

نمونے لینے کی رقم: تقریبا.5 جی؛ریزرویشن کے لیے جراثیم سے پاک ای پی ٹیوب یا کرائیوٹوب میں کیچڑ کا نمونہ جمع کریں اور جمع کریں۔

آبی جسم

مائکروبیل کی محدود مقدار والے نمونے کے لیے، جیسے نل کا پانی، کنویں کا پانی، وغیرہ، کم از کم 1 L پانی جمع کریں اور جھلی پر مائکروبیل کو افزودہ کرنے کے لیے 0.22 μm فلٹر سے گزریں۔جھلی کو جراثیم سے پاک ٹیوب میں محفوظ کریں۔

جلد

جراثیم سے پاک روئی کے جھاڑو یا سرجیکل بلیڈ سے جلد کی سطح کو احتیاط سے کھرچیں اور اسے جراثیم سے پاک ٹیوب میں رکھیں۔

تجویز کردہ نمونے کی ترسیل

نمونوں کو مائع نائٹروجن میں 3-4 گھنٹے کے لیے منجمد کریں اور مائع نائٹروجن یا -80 ڈگری پر طویل مدتی ریزرویشن میں محفوظ کریں۔خشک برف کے ساتھ نمونے کی ترسیل کی ضرورت ہے۔

سروس ورک فلو

logo_02

نمونہ کی ترسیل

logo_04

لائبریری کی تعمیر

logo_05

ترتیب دینا

logo_06

ڈیٹا کا تجزیہ

logo_07

فروخت کے بعد کی خدمات


  • پچھلا:
  • اگلے:

  • ہسٹوگرام: پرجاتیوں کی تقسیم

    3

    2. KEGG میٹابولک پاتھ ویز کے لیے فنکشنل جین کی تشریح

    4

    3. حرارت کا نقشہ: متعلقہ جین کی کثرت پر مبنی مختلف افعال54. کارڈ اینٹی بائیوٹک مزاحمتی جینوں کے سرکوس

    6

    بی ایم کے کیس

    اینٹی بائیوٹک مزاحمتی جینز اور بیکٹیریل پیتھوجینز کا پھیلاؤ مٹی-مینگروو کی جڑ کے تسلسل کے ساتھ

    شائع شدہ:جرنل آف ہیزرڈوس میٹریلز، 2021

    ترتیب کی حکمت عملی:

    مواد: مینگروو جڑوں سے وابستہ نمونوں کے چار ٹکڑوں کے ڈی این اے نچوڑ: غیر پلانٹ شدہ مٹی، ریزوسفیر، ایپی اسپیئر اور اینڈوسفیئر کمپارٹمنٹس
    پلیٹ فارم: Illumina HiSeq 2500
    اہداف: میٹاجینوم
    16S rRNA جین V3-V4 خطہ

    کلیدی نتائج

    مٹی سے پودوں میں اینٹی بائیوٹک مزاحمتی جینز (ARGs) کے پھیلاؤ کا مطالعہ کرنے کے لیے مینگرو کے پودوں کی مٹی کی جڑوں کے تسلسل پر میٹاجینومک سیکوینسنگ اور میٹا بار کوڈنگ پروفائلنگ پر کارروائی کی گئی۔میٹاجینومک ڈیٹا نے انکشاف کیا کہ 91.4% اینٹی بائیوٹک مزاحمتی جینز کی عام طور پر اوپر بیان کردہ مٹی کے چاروں حصوں میں شناخت کی گئی تھی، جس نے ایک مسلسل فیشن دکھایا۔16S rRNA amplicon کی ترتیب نے 29,285 تسلسل پیدا کیے، جو 346 پرجاتیوں کی نمائندگی کرتے ہیں۔ایمپلی کون سیکوینسنگ کے ذریعے پرجاتیوں کی پروفائلنگ کے ساتھ مل کر، یہ پھیلاؤ جڑ سے وابستہ مائکرو بائیوٹا سے آزاد پایا گیا، تاہم، اس کو جینیاتی عناصر کے موبائل کے ذریعے سہولت فراہم کی جا سکتی ہے۔اس مطالعہ نے مٹی سے پودوں میں جڑے ہوئے مٹی کی جڑ کے تسلسل کے ذریعے ARGs اور پیتھوجینز کے بہاؤ کی نشاندہی کی۔

    حوالہ

    وانگ، سی، ہو، آر، اسٹرانگ، پی جے، زوانگ، ڈبلیو، اور شو، ایل۔(2020)۔مٹی کے ساتھ اینٹی بائیوٹک مزاحمتی جینز اور بیکٹیریل پیتھوجینز کا پھیلاؤ – مینگروو جڑ کے تسلسل۔خطرناک مواد کا جرنل، 408، 124985۔

    ایک اقتباس حاصل

    اپنا پیغام یہاں لکھیں اور ہمیں بھیجیں۔

    اپنا پیغام ہمیں بھیجیں: