مصنوعات

ہسٹوگرام: پرجاتیوں کی تقسیم

2. KEGG میٹابولک پاتھ ویز کے لیے فنکشنل جین کی تشریح

3. حرارت کا نقشہ: متعلقہ جین کی کثرت پر مبنی مختلف افعال4. کارڈ اینٹی بائیوٹک مزاحمتی جینوں کے سرکوس

بی ایم کے کیس

اینٹی بائیوٹک مزاحمتی جینز اور بیکٹیریل پیتھوجینز کا پھیلاؤ مٹی-مینگروو کی جڑ کے تسلسل کے ساتھ

شائع شدہ:جرنل آف ہیزرڈوس میٹریلز، 2021

ترتیب کی حکمت عملی:

مواد: مینگروو جڑوں سے وابستہ نمونوں کے چار ٹکڑوں کے ڈی این اے نچوڑ: غیر پلانٹ شدہ مٹی، ریزوسفیر، ایپی اسپیئر اور اینڈوسفیئر کمپارٹمنٹس
پلیٹ فارم: Illumina HiSeq 2500
اہداف: میٹاجینوم
16S rRNA جین V3-V4 خطہ

کلیدی نتائج

مٹی سے پودوں میں اینٹی بائیوٹک مزاحمتی جینز (ARGs) کے پھیلاؤ کا مطالعہ کرنے کے لیے مینگرو کے پودوں کی مٹی کی جڑوں کے تسلسل پر میٹاجینومک سیکوینسنگ اور میٹا بار کوڈنگ پروفائلنگ پر کارروائی کی گئی۔میٹاجینومک ڈیٹا نے انکشاف کیا کہ 91.4% اینٹی بائیوٹک مزاحمتی جینز کی عام طور پر اوپر بیان کردہ مٹی کے چاروں حصوں میں شناخت کی گئی تھی، جس نے ایک مسلسل فیشن دکھایا۔16S rRNA amplicon کی ترتیب نے 29,285 تسلسل پیدا کیے، جو 346 پرجاتیوں کی نمائندگی کرتے ہیں۔ایمپلی کون سیکوینسنگ کے ذریعے پرجاتیوں کی پروفائلنگ کے ساتھ مل کر، یہ پھیلاؤ جڑ سے وابستہ مائکرو بائیوٹا سے آزاد پایا گیا، تاہم، اس کو جینیاتی عناصر کے موبائل کے ذریعے سہولت فراہم کی جا سکتی ہے۔اس مطالعہ نے مٹی سے پودوں میں جڑے ہوئے مٹی کی جڑ کے تسلسل کے ذریعے ARGs اور پیتھوجینز کے بہاؤ کی نشاندہی کی۔

حوالہ

وانگ، سی، ہو، آر، اسٹرانگ، پی جے، زوانگ، ڈبلیو، اور شو، ایل۔(2020)۔مٹی کے ساتھ اینٹی بائیوٹک مزاحمتی جینز اور بیکٹیریل پیتھوجینز کا پھیلاؤ – مینگروو جڑ کے تسلسل۔خطرناک مواد کا جرنل، 408، 124985۔