میٹجینومک تسلسل -این جی
ایک میٹجینوم حیاتیات کی مخلوط برادری کے کل جینیاتی مواد کا ایک مجموعہ ہے ، جیسے ماحولیاتی اور انسانی میٹجینومس۔ اس میں قابل کاشت اور غیر منقولہ مائکروجنزموں کے جینوم شامل ہیں۔ این جی ایس کے ساتھ شاٹگن میٹجینومک تسلسل ان پیچیدہ جینومک مناظر کے مطالعہ کو قابل بناتا ہے جو ماحولیاتی نمونوں میں سرایت کرتے ہیں جس سے ٹیکونومک پروفائلنگ سے زیادہ فراہم کی جاسکتی ہے ، جس سے پرجاتیوں کی تنوع ، کثرت کی حرکیات اور آبادی کے پیچیدہ ڈھانچے میں دانے دار بصیرت بھی ملتی ہے۔ ٹیکسونومک مطالعات سے پرے ، شاٹگن میٹجینومکس ایک فنکشنل جینومکس نقطہ نظر بھی پیش کرتا ہے ، جس سے ماحولیاتی عمل میں انکوڈڈ جینوں کی تلاش اور ان کے اہم کرداروں کو قابل بناتا ہے۔ آخر میں ، جینیاتی عناصر اور ماحولیاتی عوامل کے مابین ارتباطی نیٹ ورکس کا قیام مائکروبیل برادریوں اور ان کے ماحولیاتی پس منظر کے مابین پیچیدہ باہمی تعل .ق کی ایک جامع تفہیم میں معاون ہے۔ آخر میں ، میٹجینومک تسلسل متنوع مائکروبیل برادریوں کی جینومک پیچیدگیوں کو کھولنے کے لئے ایک اہم آلہ کے طور پر کھڑا ہے ، ان پیچیدہ ماحولیاتی نظام کے اندر جینیاتیات اور ماحولیات کے مابین کثیر جہتی تعلقات کو روشن کرتا ہے۔
پلیٹ فارم: ایلومینا نوواسق اور DNBSEQ-T7
خدمت کے فوائد
●مائکروبیل کمیونٹی پروفائلنگ کے لئے تنہائی اور کاشت سے پاک طریقہ: غیر منقول حیاتیات سے جینیاتی مواد کی ترتیب کو چالو کرنا۔
●اعلی قرارداد: ماحولیاتی نمونوں میں کم کثرت والی پرجاتیوں کا پتہ لگائیں۔
●جامع بائیو انفارمیٹکس تجزیہ:نہ صرف ٹیکسنومک تنوع پر بلکہ معاشرے کے عملی تنوع پر بھی توجہ مرکوز کی۔
●وسیع تجربہ:مختلف تحقیقی ڈومینز میں متعدد میٹجینومکس پروجیکٹس کو کامیابی کے ساتھ بند کرنے اور 200،000 سے زیادہ نمونوں پر کارروائی کرنے کے ٹریک ریکارڈ کے ساتھ ، ہماری ٹیم ہر منصوبے میں تجربہ کی دولت لاتی ہے۔
خدمت کی وضاحتیں
| ترتیب پلیٹ فارم | ترتیب کی حکمت عملی | ڈیٹا کی سفارش کی گئی ہے | کوالٹی کنٹرول |
| ایلومینا نوواسق یا DNBSEQ-T7 | PE150 | 6-20GB | Q30≥85 ٪ |
خدمت کی ضروریات
| حراستی (NG/µL) | کل رقم (این جی) | حجم (µl) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● مٹی/کیچڑ: 2-3 گرام
● آنتوں کا مواد- آسانی سے: 0.5-2g
● آنتوں کے مشمولات-انسیکٹ: 0.1-0.25g
● پلانٹ کی سطح (افزودہ تلچھٹ): 0.5-1 گرام
● ابال کے شوربے کو افزودہ تلچھٹ): 0.2-0.5g
● فاسس (بڑے جانور): 0.5-2 گرام
● فاسس (ماؤس): 3-5 گرانز
● پلمونری الیوولر لاویج سیال: فلٹر پیپر
● اندام نہانی جھاڑو: 5-6 جھاڑو
● جلد/جینیاتی جھاڑو/تھوک/زبانی نرم ٹشو/گرجیل جھاڑو/ملاشی جھاڑو: 2-3 جھاڑو
● سطح مائکروجنزم: 5-6 جھاڑو
● واٹر باڈی/ایئر/بائیوفلم: فلٹر پیپر
● اینڈوفائٹس: 2-3 جی
● دانتوں کی تختی: 0.5-1G
خدمت کے کام کا بہاؤ
نمونہ کی فراہمی
لائبریری کی تعمیر
ترتیب
ڈیٹا تجزیہ
فروخت کے بعد خدمات
مندرجہ ذیل تجزیہ پر مشتمل ہے:
data ڈیٹا کوالٹی کنٹرول کو ترتیب دینا
● میٹجینوم اسمبلی اور جین کی پیش گوئی
● جین تشریح
● ٹیکسونومک الفا تنوع کا تجزیہ
community برادری کا عملی تجزیہ: حیاتیاتی فنکشن ، میٹابولک ، اینٹی بائیوٹک مزاحمت
ancture دونوں فنکشنل اور ٹیکسونومک تنوع کے بارے میں تجزیہ:
بیٹا تنوع کا تجزیہ
بین گروپ تجزیہ
ارتباط کا تجزیہ: ماحولیاتی عوامل اور ساخت اور تنوع کے درمیان
فنکشنل تجزیہ: کارڈ اینٹی بائیوٹک مزاحمت
کیگ میٹابولک راستوں کا مختلف تجزیہ: اہم راستوں کا ہیٹ میپ
ٹیکونومک تقسیم کا الفا تنوع: ACE انڈیکس
ٹیکسونومک تقسیم کا بیٹا تنوع: پی سی او اے
اشاعتوں کے ایک مجموعہ ذخیرے کے ذریعہ بی ایم کے جی این ای کی میٹجینوم ترتیب خدمات کے ذریعہ سہولیات کی تلاش کریں۔
ہائے ، Q. ET رحمہ اللہ تعالی. (2023) 'مختلف ثقافت کے پانی کے درجہ حرارت پر متعدی ہیماتوپوائٹک نیکروسیس وائرس سے متاثرہ رینبو ٹراؤٹ (اونکورہینچس مائکیس) کے آنتوں کے مشمولات میں تبدیلیوں کا میٹجینومک اور میٹابولومک تجزیہ' ،مائکروبیولوجی میں فرنٹیئرز، 14 ، صفحہ۔ 1275649. doi: 10.3389/fmicb.2023.1275649۔
ماؤ ، سی وغیرہ۔ (2023) 'مائکروبیل کمیونٹیز ، مزاحمتی جین ، اور مختلف ٹرافک ریاستوں کے شہری جھیلوں میں مزاحم خطرات: داخلی روابط اور بیرونی اثرات' ،مضر مواد کی جرنل ایڈوانس، 9 ، صفحہ۔ 100233. doi: 10.1016/j.hazadv.2023.100233.
ایس یو ، ایم وغیرہ۔ ۔مائکروبیولوجی میں فرنٹیئرز، 13 ، صفحہ۔ 851567. doi: 10.3389/fmicb.2022.851567.
ین ، جے۔ وغیرہ۔ .بدعت، 4 (5) ، صفحہ۔ 100486. doi: 10.1016/j.xinn.2023.100486.
ژاؤ ، X. ET رحمہ اللہ تعالی. (2023) 'نمائندہ بائیو/نان ڈگری ایبل پلاسٹک اور نان پلاسٹک ملبے کے ممکنہ خطرات کے بارے میں میٹجینومک بصیرت ، ہیہی ایسٹوری ، چین کے اوپری اور نچلے حصے میں ،کل ماحول کی سائنس، 887 ، صفحہ۔ 164026. doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.164026.
